MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-020

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017113	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384043655
2	NC_017113	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384043661
3	NC_017113	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384043662
4	NC_017113	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384043663
5	NC_017113	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384043665
6	NC_017113	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384043666
7	NC_017113	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384043666
8	NC_017113	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384043667
9	NC_017113	TTTCT	2	10	12097	12106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017113	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384043669
11	NC_017113	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384043670
12	NC_017113	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384043671
13	NC_017113	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384043672
14	NC_017113	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384043674
15	NC_017113	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384043674
16	NC_017113	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384043674
17	NC_017113	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384043675
18	NC_017113	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384043676
19	NC_017113	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384043678
20	NC_017113	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384043678
21	NC_017113	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384043681
22	NC_017113	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384043681
23	NC_017113	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384043681
24	NC_017113	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384043684
25	NC_017113	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384043687
26	NC_017113	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384043687
27	NC_017113	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384043687
28	NC_017113	GGAAG	2	10	35496	35505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017113	ACGAT	2	10	36891	36900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017113	TAAAA	2	10	37109	37118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017113	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384043692
32	NC_017113	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384043693
33	NC_017113	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384043694
34	NC_017113	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384043694
35	NC_017113	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384043694
36	NC_017113	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384043695
37	NC_017113	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384043700
38	NC_017113	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384043701
39	NC_017113	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384043702
40	NC_017113	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384043704
41	NC_017113	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384043707
42	NC_017113	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384043708
43	NC_017113	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384043708
44	NC_017113	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384043709
45	NC_017113	CAGAC	2	10	58278	58287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017113	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384043711
47	NC_017113	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384043711
48	NC_017113	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384043712
49	NC_017113	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384043712
50	NC_017113	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384043713
51	NC_017113	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384043715
52	NC_017113	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384043715
53	NC_017113	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384043716
54	NC_017113	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384043716
55	NC_017113	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384043720
56	NC_017113	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384043724
57	NC_017113	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384043724
58	NC_017113	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384043725
59	NC_017113	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384043727
60	NC_017113	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384043728
61	NC_017113	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384043729
62	NC_017113	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384043729
63	NC_017113	AGCTC	2	10	77560	77569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017113	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384043733
65	NC_017113	GAGAT	2	10	80260	80269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017113	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384043734
67	NC_017113	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384043735
68	NC_017113	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384043738
69	NC_017113	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384043739
70	NC_017113	AGAAA	2	10	85969	85978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017113	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384043741
72	NC_017113	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384043744
73	NC_017113	TTTCT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017113	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384043745
75	NC_017113	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384043745
76	NC_017113	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384043745
77	NC_017113	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384043745
78	NC_017113	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384043747
79	NC_017113	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384043750
80	NC_017113	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384043751
81	NC_017113	AGACA	2	10	98248	98257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017113	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384043755
83	NC_017113	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384043755
84	NC_017113	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384043755
85	NC_017113	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384043757
86	NC_017113	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384043757
87	NC_017113	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384043759
88	NC_017113	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384043759
89	NC_017113	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384043761
90	NC_017113	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384043766
91	NC_017113	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384043768
92	NC_017113	GATAA	2	10	114225	114234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017113	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384043769
94	NC_017113	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384043771
95	NC_017113	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384043772
96	NC_017113	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384043775
97	NC_017113	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384043776
98	NC_017113	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384043777
99	NC_017113	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384043777
100	NC_017113	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384043782
101	NC_017113	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384043783
102	NC_017113	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384043784
103	NC_017113	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384043785
104	NC_017113	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384043786
105	NC_017113	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384043787
106	NC_017113	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384043787
107	NC_017113	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384043789
108	NC_017113	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384043791
109	NC_017113	GCTGT	2	10	142569	142578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017113	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384043793
111	NC_017113	CGCGA	2	10	146926	146935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017113	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384043797
113	NC_017113	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384043798
114	NC_017113	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384043799
115	NC_017113	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384043799
116	NC_017113	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384043802
117	NC_017113	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384043803
118	NC_017113	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384043805
119	NC_017113	AGAAA	2	10	155636	155645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017113	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384043807
121	NC_017113	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384043809
122	NC_017113	TCTTT	2	10	159638	159647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017113	TGAAT	2	10	159976	159985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017113	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384043810
125	NC_017113	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384043814
126	NC_017113	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384043815
127	NC_017113	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384043815
128	NC_017113	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384043815
129	NC_017113	GGAGC	2	10	168700	168709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017113	AGCAA	2	10	169606	169615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017113	ATTAA	2	10	171299	171308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017113	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384043818
133	NC_017113	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384043818
134	NC_017113	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384043819
135	NC_017113	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384043820

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.