MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-020

Total Repeats: 296

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017113	CCA	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017113	CGC	2	6	1055	1060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_017113	TAG	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017113	AAG	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017113	GAA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017113	GTC	2	6	3878	3883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017113	CCG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017113	CGG	2	6	6707	6712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017113	CTT	2	6	7863	7868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017113	ACA	2	6	7912	7917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017113	CTG	2	6	7961	7966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017113	GGC	2	6	8009	8014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017113	CGA	2	6	9416	9421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017113	GGC	2	6	10599	10604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017113	TGG	2	6	10650	10655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017113	AGG	2	6	12026	12031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017113	TGA	2	6	12082	12087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017113	GAA	2	6	12719	12724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017113	TAA	2	6	12767	12772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017113	ATA	2	6	12817	12822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017113	GAA	2	6	12965	12970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017113	GTA	2	6	13917	13922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017113	TCA	2	6	13944	13949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017113	ATT	2	6	18791	18796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017113	TCT	2	6	21574	21579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017113	AAG	2	6	22477	22482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017113	CCT	2	6	22585	22590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_017113	TAA	2	6	22629	22634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017113	GGT	2	6	22671	22676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017113	TTC	3	9	22721	22729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017113	AAG	2	6	22836	22841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017113	AAG	2	6	22937	22942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017113	CGG	2	6	22947	22952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017113	CCG	2	6	23051	23056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017113	GAG	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017113	TGT	2	6	24278	24283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017113	CAC	2	6	24330	24335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017113	ACA	2	6	24433	24438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017113	CCG	2	6	29418	29423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017113	CAA	3	9	29442	29450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017113	GAA	2	6	30276	30281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017113	CAA	2	6	33147	33152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017113	CGT	2	6	36780	36785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017113	TCG	2	6	36800	36805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017113	CTT	2	6	36970	36975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017113	GGC	2	6	37028	37033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017113	ATC	2	6	37103	37108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017113	ATC	2	6	37163	37168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017113	TCA	2	6	37910	37915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017113	ACC	2	6	37928	37933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017113	CAT	2	6	45970	45975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017113	CCA	2	6	46029	46034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017113	TCA	2	6	46066	46071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017113	TAT	2	6	46199	46204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017113	AAG	2	6	46205	46210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017113	AAT	2	6	46309	46314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017113	TAG	3	9	46469	46477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017113	TCG	2	6	46556	46561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017113	CAC	2	6	48008	48013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017113	GCG	2	6	48023	48028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017113	GAA	2	6	48171	48176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017113	ATG	2	6	48340	48345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017113	CCG	2	6	48376	48381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017113	TCT	3	9	53254	53262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017113	AGC	2	6	53323	53328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017113	TAA	2	6	54057	54062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017113	CAG	2	6	54079	54084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017113	GTA	2	6	54209	54214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017113	CAG	2	6	57857	57862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017113	GCA	2	6	57910	57915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017113	CAG	2	6	58000	58005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017113	CGG	2	6	58080	58085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017113	CAG	2	6	58111	58116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017113	AGC	2	6	58159	58164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017113	TGT	3	9	58205	58213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017113	TCG	2	6	67510	67515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017113	GCT	2	6	67541	67546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017113	CTG	2	6	67589	67594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017113	CCG	2	6	67620	67625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017113	GCT	2	6	67699	67704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017113	CTG	2	6	67789	67794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017113	TCC	2	6	67838	67843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017113	AGA	2	6	70078	70083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017113	AAG	2	6	71014	71019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017113	TAA	3	9	71034	71042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017113	TAT	2	6	71048	71053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017113	ATT	2	6	72081	72086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017113	GGT	2	6	73915	73920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017113	ATC	2	6	73949	73954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017113	CAT	2	6	75226	75231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017113	GCG	2	6	75268	75273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017113	GCG	2	6	76653	76658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017113	TAG	2	6	76728	76733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017113	CCT	2	6	76850	76855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017113	GAT	2	6	76966	76971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017113	GCT	2	6	76990	76995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017113	TCT	2	6	77145	77150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017113	TCG	2	6	77181	77186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017113	GTG	2	6	77189	77194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017113	GGC	2	6	77222	77227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017113	GAT	2	6	77311	77316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017113	GAC	2	6	77498	77503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017113	CGG	2	6	77635	77640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017113	CGC	2	6	77701	77706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017113	GCG	2	6	77755	77760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017113	CAC	2	6	78872	78877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017113	GAG	2	6	78978	78983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017113	GCA	2	6	80199	80204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017113	TTC	2	6	83042	83047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017113	GCG	2	6	83415	83420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017113	TCA	2	6	83624	83629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017113	ATC	2	6	85987	85992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017113	CCA	2	6	87421	87426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017113	CGC	2	6	87471	87476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017113	GGC	2	6	88880	88885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017113	TGG	2	6	88931	88936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017113	TGA	2	6	90364	90369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017113	ATG	2	6	98113	98118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017113	GAA	2	6	98219	98224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017113	GCG	2	6	98323	98328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017113	AGC	2	6	98335	98340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017113	CAT	2	6	98351	98356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017113	GTG	2	6	98401	98406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017113	CCG	2	6	98459	98464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_017113	TCT	2	6	98516	98521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017113	AGG	2	6	98755	98760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017113	ATA	2	6	99397	99402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017113	ATC	2	6	99518	99523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017113	GAG	2	6	102277	102282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017113	GGC	2	6	105386	105391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017113	TGG	2	6	105437	105442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017113	AAG	2	6	107270	107275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017113	AAC	3	9	108553	108561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017113	ACC	2	6	108606	108611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017113	TGT	2	6	110765	110770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017113	TTG	2	6	110804	110809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017113	TCG	2	6	110876	110881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017113	GAC	2	6	110972	110977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017113	GGC	2	6	112546	112551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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272	NC_017113	GTG	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_017113	GAT	2	6	181112	181117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017113	CCA	2	6	181148	181153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
275	NC_017113	GCG	2	6	181161	181166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
276	NC_017113	AGG	2	6	181196	181201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017113	GGC	2	6	181230	181235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
278	NC_017113	TCA	2	6	181337	181342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017113	TCG	2	6	181465	181470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
280	NC_017113	ACG	2	6	181526	181531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_017113	CTT	2	6	181739	181744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_017113	TCC	2	6	181748	181753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_017113	CGG	2	6	181846	181851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_017113	TTC	2	6	181896	181901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_017113	GAC	2	6	181976	181981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_017113	CTG	2	6	182003	182008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_017113	CTG	2	6	182147	182152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017113	ATC	3	9	182194	182202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_017113	GCC	2	6	182396	182401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
290	NC_017113	CTT	2	6	182424	182429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
291	NC_017113	TCG	2	6	182443	182448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_017113	GAC	2	6	182499	182504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_017113	CTG	2	6	182550	182555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_017113	GCG	2	6	182678	182683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_017113	TCA	2	6	182756	182761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
296	NC_017113	AGA	2	6	182917	182922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.