MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12 plasmid pAPA12-020

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017113	GC	3	6	96	101	0 %	0 %	50 %	50 %	384043653
2	NC_017113	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	384043658
3	NC_017113	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	384043663
4	NC_017113	GT	3	6	6966	6971	0 %	50 %	50 %	0 %	384043664
5	NC_017113	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	384043664
6	NC_017113	GC	3	6	8169	8174	0 %	0 %	50 %	50 %	384043665
7	NC_017113	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	384043665
8	NC_017113	TC	3	6	9223	9228	0 %	50 %	0 %	50 %	384043665
9	NC_017113	GA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	384043666
10	NC_017113	TG	3	6	10408	10413	0 %	50 %	50 %	0 %	384043666
11	NC_017113	CG	3	6	11184	11189	0 %	0 %	50 %	50 %	384043667
12	NC_017113	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	384043668
13	NC_017113	AG	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	384043668
14	NC_017113	CA	3	6	12578	12583	50 %	0 %	0 %	50 %	384043668
15	NC_017113	CA	3	6	13021	13026	50 %	0 %	0 %	50 %	384043669
16	NC_017113	GC	3	6	13163	13168	0 %	0 %	50 %	50 %	384043669
17	NC_017113	AG	3	6	13644	13649	50 %	0 %	50 %	0 %	384043669
18	NC_017113	GC	3	6	13682	13687	0 %	0 %	50 %	50 %	384043669
19	NC_017113	GA	3	6	13807	13812	50 %	0 %	50 %	0 %	384043669
20	NC_017113	AT	3	6	14167	14172	50 %	50 %	0 %	0 %	384043670
21	NC_017113	GT	3	6	14231	14236	0 %	50 %	50 %	0 %	384043670
22	NC_017113	CA	3	6	14381	14386	50 %	0 %	0 %	50 %	384043670
23	NC_017113	GC	3	6	14471	14476	0 %	0 %	50 %	50 %	384043670
24	NC_017113	AG	3	6	14692	14697	50 %	0 %	50 %	0 %	384043670
25	NC_017113	CG	3	6	14794	14799	0 %	0 %	50 %	50 %	384043670
26	NC_017113	GC	3	6	15363	15368	0 %	0 %	50 %	50 %	384043671
27	NC_017113	CA	3	6	15593	15598	50 %	0 %	0 %	50 %	384043671
28	NC_017113	GC	3	6	16011	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	384043671
29	NC_017113	CG	3	6	16671	16676	0 %	0 %	50 %	50 %	384043671
30	NC_017113	CA	3	6	16694	16699	50 %	0 %	0 %	50 %	384043671
31	NC_017113	GC	3	6	17186	17191	0 %	0 %	50 %	50 %	384043672
32	NC_017113	CA	3	6	17422	17427	50 %	0 %	0 %	50 %	384043672
33	NC_017113	AG	3	6	17557	17562	50 %	0 %	50 %	0 %	384043672
34	NC_017113	GC	3	6	18015	18020	0 %	0 %	50 %	50 %	384043672
35	NC_017113	GC	3	6	20276	20281	0 %	0 %	50 %	50 %	384043674
36	NC_017113	TG	3	6	20871	20876	0 %	50 %	50 %	0 %	384043675
37	NC_017113	GA	3	6	21414	21419	50 %	0 %	50 %	0 %	384043675
38	NC_017113	CG	3	6	22099	22104	0 %	0 %	50 %	50 %	384043676
39	NC_017113	GC	3	6	22280	22285	0 %	0 %	50 %	50 %	384043676
40	NC_017113	GC	3	6	23263	23268	0 %	0 %	50 %	50 %	384043677
41	NC_017113	AG	3	6	24754	24759	50 %	0 %	50 %	0 %	384043679
42	NC_017113	AT	3	6	26281	26286	50 %	50 %	0 %	0 %	384043681
43	NC_017113	CG	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	384043681
44	NC_017113	TC	3	6	29016	29021	0 %	50 %	0 %	50 %	384043681
45	NC_017113	GC	3	6	29551	29556	0 %	0 %	50 %	50 %	384043682
46	NC_017113	GT	3	6	30594	30599	0 %	50 %	50 %	0 %	384043684
47	NC_017113	AG	3	6	30900	30905	50 %	0 %	50 %	0 %	384043685
48	NC_017113	AT	3	6	31598	31603	50 %	50 %	0 %	0 %	384043685
49	NC_017113	AG	3	6	32163	32168	50 %	0 %	50 %	0 %	384043685
50	NC_017113	GT	3	6	33694	33699	0 %	50 %	50 %	0 %	384043686
51	NC_017113	TC	3	6	33795	33800	0 %	50 %	0 %	50 %	384043686
52	NC_017113	TG	3	6	34459	34464	0 %	50 %	50 %	0 %	384043687
53	NC_017113	TA	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	384043688
54	NC_017113	GC	3	6	35897	35902	0 %	0 %	50 %	50 %	384043688
55	NC_017113	TG	3	6	36418	36423	0 %	50 %	50 %	0 %	384043689
56	NC_017113	AT	4	8	37583	37590	50 %	50 %	0 %	0 %	384043690
57	NC_017113	GC	3	6	38062	38067	0 %	0 %	50 %	50 %	384043691
58	NC_017113	GC	3	6	38879	38884	0 %	0 %	50 %	50 %	384043691
59	NC_017113	GC	3	6	39633	39638	0 %	0 %	50 %	50 %	384043692
60	NC_017113	CG	4	8	40227	40234	0 %	0 %	50 %	50 %	384043693
61	NC_017113	AC	3	6	43335	43340	50 %	0 %	0 %	50 %	384043694
62	NC_017113	GA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	50 %	0 %	384043694
63	NC_017113	GC	3	6	43805	43810	0 %	0 %	50 %	50 %	384043694
64	NC_017113	GA	3	6	43897	43902	50 %	0 %	50 %	0 %	384043694
65	NC_017113	AC	3	6	44176	44181	50 %	0 %	0 %	50 %	384043694
66	NC_017113	TG	3	6	44705	44710	0 %	50 %	50 %	0 %	384043695
67	NC_017113	CG	3	6	44720	44725	0 %	0 %	50 %	50 %	384043695
68	NC_017113	AT	3	6	45217	45222	50 %	50 %	0 %	0 %	384043695
69	NC_017113	AG	3	6	46748	46753	50 %	0 %	50 %	0 %	384043698
70	NC_017113	AC	3	6	47439	47444	50 %	0 %	0 %	50 %	384043698
71	NC_017113	TC	3	6	48795	48800	0 %	50 %	0 %	50 %	384043699
72	NC_017113	CG	3	6	49016	49021	0 %	0 %	50 %	50 %	384043699
73	NC_017113	GC	3	6	49069	49074	0 %	0 %	50 %	50 %	384043699
74	NC_017113	GC	3	6	49148	49153	0 %	0 %	50 %	50 %	384043699
75	NC_017113	CA	3	6	49307	49312	50 %	0 %	0 %	50 %	384043700
76	NC_017113	GT	3	6	49706	49711	0 %	50 %	50 %	0 %	384043700
77	NC_017113	CG	3	6	50654	50659	0 %	0 %	50 %	50 %	384043701
78	NC_017113	GA	3	6	50829	50834	50 %	0 %	50 %	0 %	384043701
79	NC_017113	AG	3	6	51826	51831	50 %	0 %	50 %	0 %	384043702
80	NC_017113	TC	3	6	53074	53079	0 %	50 %	0 %	50 %	384043704
81	NC_017113	AG	3	6	54530	54535	50 %	0 %	50 %	0 %	384043707
82	NC_017113	CG	3	6	55013	55018	0 %	0 %	50 %	50 %	384043707
83	NC_017113	GC	3	6	55118	55123	0 %	0 %	50 %	50 %	384043707
84	NC_017113	GA	3	6	55817	55822	50 %	0 %	50 %	0 %	384043708
85	NC_017113	CG	3	6	56033	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	384043708
86	NC_017113	CT	3	6	57475	57480	0 %	50 %	0 %	50 %	384043710
87	NC_017113	CG	3	6	60492	60497	0 %	0 %	50 %	50 %	384043712
88	NC_017113	TG	3	6	60743	60748	0 %	50 %	50 %	0 %	384043712
89	NC_017113	GT	3	6	62130	62135	0 %	50 %	50 %	0 %	384043712
90	NC_017113	TA	3	6	63175	63180	50 %	50 %	0 %	0 %	384043713
91	NC_017113	AT	3	6	63441	63446	50 %	50 %	0 %	0 %	384043713
92	NC_017113	AT	3	6	63501	63506	50 %	50 %	0 %	0 %	384043713
93	NC_017113	CG	3	6	64583	64588	0 %	0 %	50 %	50 %	384043714
94	NC_017113	GT	3	6	64808	64813	0 %	50 %	50 %	0 %	384043714
95	NC_017113	CA	3	6	64921	64926	50 %	0 %	0 %	50 %	384043714
96	NC_017113	CG	3	6	66887	66892	0 %	0 %	50 %	50 %	384043717
97	NC_017113	GC	3	6	67333	67338	0 %	0 %	50 %	50 %	384043718
98	NC_017113	AG	3	6	68225	68230	50 %	0 %	50 %	0 %	384043719
99	NC_017113	GA	3	6	69017	69022	50 %	0 %	50 %	0 %	384043721
100	NC_017113	GA	3	6	69041	69046	50 %	0 %	50 %	0 %	384043721
101	NC_017113	GT	3	6	69245	69250	0 %	50 %	50 %	0 %	384043722
102	NC_017113	GC	3	6	69324	69329	0 %	0 %	50 %	50 %	384043722
103	NC_017113	AG	3	6	70274	70279	50 %	0 %	50 %	0 %	384043723
104	NC_017113	CA	3	6	70412	70417	50 %	0 %	0 %	50 %	384043723
105	NC_017113	AC	3	6	70725	70730	50 %	0 %	0 %	50 %	384043723
106	NC_017113	AG	3	6	71431	71436	50 %	0 %	50 %	0 %	384043724
107	NC_017113	AC	3	6	71910	71915	50 %	0 %	0 %	50 %	384043724
108	NC_017113	CT	3	6	72749	72754	0 %	50 %	0 %	50 %	384043725
109	NC_017113	CT	3	6	73030	73035	0 %	50 %	0 %	50 %	384043725
110	NC_017113	GA	3	6	73297	73302	50 %	0 %	50 %	0 %	384043725
111	NC_017113	AG	3	6	74299	74304	50 %	0 %	50 %	0 %	384043727
112	NC_017113	AT	3	6	74654	74659	50 %	50 %	0 %	0 %	384043727
113	NC_017113	TC	3	6	75749	75754	0 %	50 %	0 %	50 %	384043728
114	NC_017113	CT	3	6	76403	76408	0 %	50 %	0 %	50 %	384043729
115	NC_017113	GT	3	6	77970	77975	0 %	50 %	50 %	0 %	384043730
116	NC_017113	TG	3	6	78283	78288	0 %	50 %	50 %	0 %	384043731
117	NC_017113	CT	3	6	78421	78426	0 %	50 %	0 %	50 %	384043731
118	NC_017113	GC	3	6	79112	79117	0 %	0 %	50 %	50 %	384043732
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120	NC_017113	GC	3	6	80537	80542	0 %	0 %	50 %	50 %	384043734
121	NC_017113	AG	3	6	81320	81325	50 %	0 %	50 %	0 %	384043734
122	NC_017113	CG	3	6	82837	82842	0 %	0 %	50 %	50 %	384043736
123	NC_017113	GC	3	6	83091	83096	0 %	0 %	50 %	50 %	384043737
124	NC_017113	TC	3	6	83237	83242	0 %	50 %	0 %	50 %	384043737
125	NC_017113	GC	3	6	84052	84057	0 %	0 %	50 %	50 %	384043738
126	NC_017113	GC	3	6	84770	84775	0 %	0 %	50 %	50 %	384043739
127	NC_017113	GC	3	6	86886	86891	0 %	0 %	50 %	50 %	384043741
128	NC_017113	CG	3	6	89465	89470	0 %	0 %	50 %	50 %	384043744
129	NC_017113	GC	3	6	89878	89883	0 %	0 %	50 %	50 %	384043744
130	NC_017113	GA	3	6	90454	90459	50 %	0 %	50 %	0 %	384043745
131	NC_017113	GT	3	6	90509	90514	0 %	50 %	50 %	0 %	384043745
132	NC_017113	TG	3	6	90886	90891	0 %	50 %	50 %	0 %	384043745
133	NC_017113	CG	3	6	90926	90931	0 %	0 %	50 %	50 %	384043745
134	NC_017113	GA	3	6	91976	91981	50 %	0 %	50 %	0 %	384043745
135	NC_017113	GC	3	6	92522	92527	0 %	0 %	50 %	50 %	384043746
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137	NC_017113	AG	3	6	93278	93283	50 %	0 %	50 %	0 %	384043747
138	NC_017113	CG	3	6	94606	94611	0 %	0 %	50 %	50 %	384043748
139	NC_017113	GA	3	6	94921	94926	50 %	0 %	50 %	0 %	384043749
140	NC_017113	TC	3	6	95436	95441	0 %	50 %	0 %	50 %	384043749
141	NC_017113	GA	3	6	96059	96064	50 %	0 %	50 %	0 %	384043750
142	NC_017113	GA	3	6	96833	96838	50 %	0 %	50 %	0 %	384043751
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.