MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-07 plasmid pAPA07-030

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017110	TTGT	2	8	685	692	0 %	75 %	25 %	0 %	384052588
2	NC_017110	AGAA	2	8	889	896	75 %	0 %	25 %	0 %	384052588
3	NC_017110	TGAA	2	8	1399	1406	50 %	25 %	25 %	0 %	384052589
4	NC_017110	GGCG	2	8	1515	1522	0 %	0 %	75 %	25 %	384052590
5	NC_017110	CGAT	2	8	1595	1602	25 %	25 %	25 %	25 %	384052590
6	NC_017110	TTGA	2	8	1848	1855	25 %	50 %	25 %	0 %	384052590
7	NC_017110	GTAA	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	384052592
8	NC_017110	TCTG	2	8	3038	3045	0 %	50 %	25 %	25 %	384052592
9	NC_017110	CTCA	2	8	3269	3276	25 %	25 %	0 %	50 %	384052593
10	NC_017110	GATG	2	8	3378	3385	25 %	25 %	50 %	0 %	384052593
11	NC_017110	GTCC	2	8	4177	4184	0 %	25 %	25 %	50 %	384052595
12	NC_017110	GCCA	2	8	4893	4900	25 %	0 %	25 %	50 %	384052595
13	NC_017110	ACCC	2	8	4945	4952	25 %	0 %	0 %	75 %	384052595
14	NC_017110	AGAA	2	8	5068	5075	75 %	0 %	25 %	0 %	384052595
15	NC_017110	AACT	2	8	6159	6166	50 %	25 %	0 %	25 %	384052595
16	NC_017110	TGGC	2	8	6952	6959	0 %	25 %	50 %	25 %	384052597
17	NC_017110	AGCG	2	8	7805	7812	25 %	0 %	50 %	25 %	384052599
18	NC_017110	TGAC	2	8	8169	8176	25 %	25 %	25 %	25 %	384052600
19	NC_017110	TCCA	2	8	8342	8349	25 %	25 %	0 %	50 %	384052600
20	NC_017110	CTTC	2	8	8757	8764	0 %	50 %	0 %	50 %	384052601
21	NC_017110	CTGA	2	8	8839	8846	25 %	25 %	25 %	25 %	384052601
22	NC_017110	TGCT	2	8	9217	9224	0 %	50 %	25 %	25 %	384052602
23	NC_017110	TGTC	2	8	10276	10283	0 %	50 %	25 %	25 %	384052603
24	NC_017110	TGAT	2	8	10540	10547	25 %	50 %	25 %	0 %	384052604
25	NC_017110	AATC	2	8	10835	10842	50 %	25 %	0 %	25 %	384052604
26	NC_017110	CTCG	2	8	11087	11094	0 %	25 %	25 %	50 %	384052604
27	NC_017110	GATG	2	8	11472	11479	25 %	25 %	50 %	0 %	384052604
28	NC_017110	AGAA	2	8	11792	11799	75 %	0 %	25 %	0 %	384052604
29	NC_017110	CAGC	2	8	11847	11854	25 %	0 %	25 %	50 %	384052604
30	NC_017110	TCGA	2	8	12399	12406	25 %	25 %	25 %	25 %	384052605
31	NC_017110	AGCG	2	8	13231	13238	25 %	0 %	50 %	25 %	384052606
32	NC_017110	ATTG	2	8	14735	14742	25 %	50 %	25 %	0 %	384052609
33	NC_017110	CATT	2	8	15015	15022	25 %	50 %	0 %	25 %	384052609
34	NC_017110	ACTC	2	8	17141	17148	25 %	25 %	0 %	50 %	384052611
35	NC_017110	GCCG	3	12	17947	17958	0 %	0 %	50 %	50 %	384052613
36	NC_017110	CCAG	2	8	18331	18338	25 %	0 %	25 %	50 %	384052614
37	NC_017110	AGGG	2	8	19143	19150	25 %	0 %	75 %	0 %	384052617
38	NC_017110	TTGC	2	8	19234	19241	0 %	50 %	25 %	25 %	384052617
39	NC_017110	GCCT	2	8	20095	20102	0 %	25 %	25 %	50 %	384052620
40	NC_017110	TCGA	2	8	20198	20205	25 %	25 %	25 %	25 %	384052620
41	NC_017110	CCGG	2	8	20534	20541	0 %	0 %	50 %	50 %	384052621
42	NC_017110	GGAC	2	8	20880	20887	25 %	0 %	50 %	25 %	384052621
43	NC_017110	GATC	2	8	21054	21061	25 %	25 %	25 %	25 %	384052621
44	NC_017110	CCGG	2	8	21115	21122	0 %	0 %	50 %	50 %	384052621
45	NC_017110	TCGC	2	8	21439	21446	0 %	25 %	25 %	50 %	384052621
46	NC_017110	TCTG	2	8	21834	21841	0 %	50 %	25 %	25 %	384052621
47	NC_017110	CAGG	2	8	22806	22813	25 %	0 %	50 %	25 %	384052621
48	NC_017110	GCCG	2	8	23034	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	384052621
49	NC_017110	GCGG	2	8	23226	23233	0 %	0 %	75 %	25 %	384052621
50	NC_017110	GCGG	2	8	23352	23359	0 %	0 %	75 %	25 %	384052621
51	NC_017110	GATC	2	8	23962	23969	25 %	25 %	25 %	25 %	384052623
52	NC_017110	GGGC	2	8	24179	24186	0 %	0 %	75 %	25 %	384052623
53	NC_017110	GACG	2	8	24775	24782	25 %	0 %	50 %	25 %	384052625
54	NC_017110	GCGG	2	8	25583	25590	0 %	0 %	75 %	25 %	384052625
55	NC_017110	GCCA	2	8	25718	25725	25 %	0 %	25 %	50 %	384052625
56	NC_017110	TCTG	2	8	26058	26065	0 %	50 %	25 %	25 %	384052625
57	NC_017110	CCTT	2	8	26190	26197	0 %	50 %	0 %	50 %	384052626
58	NC_017110	GAAT	2	8	26259	26266	50 %	25 %	25 %	0 %	384052626
59	NC_017110	ACTG	2	8	26316	26323	25 %	25 %	25 %	25 %	384052626
60	NC_017110	AGCA	2	8	28629	28636	50 %	0 %	25 %	25 %	384052629
61	NC_017110	GCTG	2	8	29049	29056	0 %	25 %	50 %	25 %	384052630
62	NC_017110	CCCA	2	8	29411	29418	25 %	0 %	0 %	75 %	384052631
63	NC_017110	GGCA	2	8	30017	30024	25 %	0 %	50 %	25 %	384052631
64	NC_017110	TGAC	2	8	30386	30393	25 %	25 %	25 %	25 %	384052632
65	NC_017110	TCCA	2	8	30559	30566	25 %	25 %	0 %	50 %	384052632
66	NC_017110	CTTC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	0 %	50 %	384052633
67	NC_017110	CTGA	2	8	31056	31063	25 %	25 %	25 %	25 %	384052633
68	NC_017110	ATCA	2	8	32777	32784	50 %	25 %	0 %	25 %	384052635
69	NC_017110	CTGC	2	8	32875	32882	0 %	25 %	25 %	50 %	384052635
70	NC_017110	CCTT	2	8	33525	33532	0 %	50 %	0 %	50 %	384052635
71	NC_017110	GGAC	2	8	33727	33734	25 %	0 %	50 %	25 %	384052635
72	NC_017110	GTTC	2	8	34324	34331	0 %	50 %	25 %	25 %	384052635
73	NC_017110	CCGA	2	8	34703	34710	25 %	0 %	25 %	50 %	384052636
74	NC_017110	TTGT	2	8	35031	35038	0 %	75 %	25 %	0 %	384052636
75	NC_017110	AGGA	2	8	35054	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	384052636
76	NC_017110	TTTC	2	8	35344	35351	0 %	75 %	0 %	25 %	384052636
77	NC_017110	CCGC	2	8	36163	36170	0 %	0 %	25 %	75 %	384052636
78	NC_017110	GCCT	2	8	36320	36327	0 %	25 %	25 %	50 %	384052636
79	NC_017110	GATG	2	8	37126	37133	25 %	25 %	50 %	0 %	384052636
80	NC_017110	TCCG	2	8	37575	37582	0 %	25 %	25 %	50 %	384052637
81	NC_017110	GATG	2	8	37855	37862	25 %	25 %	50 %	0 %	384052637
82	NC_017110	CCCG	2	8	37969	37976	0 %	0 %	25 %	75 %	384052637
83	NC_017110	ATCA	2	8	38288	38295	50 %	25 %	0 %	25 %	384052637
84	NC_017110	ATGA	2	8	39916	39923	50 %	25 %	25 %	0 %	384052639
85	NC_017110	CCAA	2	8	40274	40281	50 %	0 %	0 %	50 %	384052640
86	NC_017110	ACCG	2	8	40628	40635	25 %	0 %	25 %	50 %	384052640
87	NC_017110	CGCT	2	8	40801	40808	0 %	25 %	25 %	50 %	384052641
88	NC_017110	GACG	2	8	41845	41852	25 %	0 %	50 %	25 %	384052643
89	NC_017110	CTTC	2	8	42484	42491	0 %	50 %	0 %	50 %	384052643
90	NC_017110	CGGG	2	8	42654	42661	0 %	0 %	75 %	25 %	384052643
91	NC_017110	CTGC	2	8	42745	42752	0 %	25 %	25 %	50 %	384052643
92	NC_017110	GCCA	2	8	42788	42795	25 %	0 %	25 %	50 %	384052643
93	NC_017110	TCTG	2	8	43128	43135	0 %	50 %	25 %	25 %	384052643
94	NC_017110	AGGA	2	8	43290	43297	50 %	0 %	50 %	0 %	384052644
95	NC_017110	GTCC	2	8	43959	43966	0 %	25 %	25 %	50 %	384052645
96	NC_017110	GCCA	2	8	44675	44682	25 %	0 %	25 %	50 %	384052645
97	NC_017110	ACCC	2	8	44727	44734	25 %	0 %	0 %	75 %	384052645
98	NC_017110	AGAA	2	8	44850	44857	75 %	0 %	25 %	0 %	384052645
99	NC_017110	GAAG	2	8	46552	46559	50 %	0 %	50 %	0 %	384052646
100	NC_017110	TGGA	2	8	46967	46974	25 %	25 %	50 %	0 %	384052647
101	NC_017110	GTCA	2	8	47140	47147	25 %	25 %	25 %	25 %	384052647

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.