MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-12

Total Repeats: 274

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017108	GCTTG	2	10	169	178	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017108	GTACG	2	10	937	946	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017108	AATAA	2	10	2603	2612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017108	TTTGA	2	10	59031	59040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017108	CTGAA	2	10	67913	67922	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017108	CAAGG	2	10	71136	71145	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017108	AAGGT	2	10	79292	79301	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017108	TTTTC	2	10	83188	83197	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017108	GCTCT	2	10	84520	84529	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017108	AGGGA	2	10	84576	84585	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017108	CAGAA	2	10	87578	87587	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017108	GCGTT	2	10	89967	89976	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017108	AGGGC	2	10	96648	96657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017108	AAAAC	2	10	112799	112808	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017108	AACAG	2	10	120933	120942	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017108	GCATA	2	10	126079	126088	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017108	CAGGA	2	10	136034	136043	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017108	CCTAT	2	10	140554	140563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017108	TAGAT	2	10	150647	150656	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017108	ATTTT	2	10	150715	150724	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017108	CAAAA	2	10	157372	157381	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017108	TAAAG	2	10	163736	163745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017108	TAGAG	2	10	163998	164007	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017108	GTAAA	2	10	181423	181432	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017108	TTCCA	2	10	205975	205984	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017108	GAATG	2	10	223657	223666	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017108	AAAAG	2	10	230260	230269	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017108	ACCGC	2	10	280863	280872	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017108	CTGTC	2	10	291036	291045	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_017108	ATCCT	2	10	300749	300758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017108	CTTTA	2	10	303636	303645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017108	ATAGT	2	10	345646	345655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017108	TATAT	2	10	345705	345714	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017108	GGGCA	2	10	348105	348114	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017108	ACGGC	2	10	349097	349106	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017108	AAAGG	2	10	350886	350895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017108	TTGCG	2	10	352880	352889	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017108	TCAAC	2	10	354742	354751	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017108	TCTAC	2	10	354752	354761	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017108	TTTCT	2	10	358157	358166	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017108	CTTTA	2	10	363580	363589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017108	CACCC	2	10	368165	368174	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
43	NC_017108	ATTAA	2	10	368180	368189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017108	AACAC	2	10	379215	379224	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017108	ATGGC	2	10	391759	391768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017108	AAACA	2	10	413282	413291	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017108	TGAAC	2	10	413490	413499	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017108	GGGGC	2	10	419584	419593	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017108	GGGCA	2	10	424163	424172	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017108	AGGGT	2	10	433021	433030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017108	ACAGA	2	10	458354	458363	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017108	AACAG	2	10	465430	465439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017108	GGGGT	2	10	473915	473924	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017108	AACAA	2	10	477225	477234	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017108	GCCAC	2	10	487189	487198	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
56	NC_017108	CGGAA	2	10	491295	491304	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017108	GCCGG	2	10	501956	501965	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017108	GGGTG	2	10	503237	503246	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017108	TTGCG	2	10	505184	505193	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017108	GGGGA	2	10	533460	533469	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017108	GGCGT	2	10	535003	535012	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017108	GAAAA	2	10	565219	565228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017108	AGAAA	2	10	583122	583131	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017108	AAAGA	2	10	606446	606455	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017108	GTCTG	2	10	616563	616572	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017108	TGCGG	2	10	618021	618030	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017108	CATGT	2	10	636254	636263	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017108	GGCAG	2	10	637375	637384	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017108	GTGGC	2	10	643177	643186	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017108	TGTGG	2	10	645085	645094	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017108	TTTGT	2	10	650000	650009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017108	TTTTC	2	10	655999	656008	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017108	CAGGG	2	10	662784	662793	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017108	GGAAG	2	10	680883	680892	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017108	GTTAC	2	10	699800	699809	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017108	CGTTT	2	10	725046	725055	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017108	ACGTA	2	10	732335	732344	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017108	GGGAA	2	10	771681	771690	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017108	GCTGT	2	10	771881	771890	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017108	TTTCT	2	10	785432	785441	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017108	CGAGA	2	10	799654	799663	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017108	GGTGT	2	10	821561	821570	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017108	CTTGC	2	10	851506	851515	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017108	TTTCT	2	10	855113	855122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017108	GGGTG	2	10	866430	866439	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017108	CAAGC	2	10	867601	867610	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017108	AATTT	2	10	867974	867983	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017108	AAAGG	2	10	868288	868297	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017108	TTTTC	2	10	875879	875888	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017108	AGATA	2	10	888808	888817	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017108	CTGAA	2	10	889171	889180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017108	AAGGA	2	10	912519	912528	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017108	AGCTA	2	10	937318	937327	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017108	TCTCA	2	10	950830	950839	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_017108	GCACA	2	10	1051336	1051345	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017108	GTTGT	2	10	1068945	1068954	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017108	TGCAC	2	10	1092796	1092805	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017108	AAAAG	2	10	1096068	1096077	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017108	GTGAA	2	10	1108219	1108228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017108	GAAAA	2	10	1155082	1155091	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017108	AAAAT	2	10	1176985	1176994	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017108	TCTGT	2	10	1177040	1177049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017108	TAAAA	2	10	1177140	1177149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017108	TTCCT	2	10	1186061	1186070	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017108	GCAAG	2	10	1238021	1238030	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017108	TCCTG	2	10	1243017	1243026	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017108	TCTTT	2	10	1248557	1248566	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017108	GTTTT	2	10	1253614	1253623	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017108	TCTTT	2	10	1257715	1257724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017108	CACAA	2	10	1306292	1306301	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017108	CTGCC	2	10	1334084	1334093	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
112	NC_017108	ACGAT	2	10	1347762	1347771	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017108	CCTTG	2	10	1366793	1366802	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_017108	AACGA	2	10	1368823	1368832	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017108	CACAA	2	10	1390632	1390641	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017108	AACAG	2	10	1403860	1403869	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017108	TAATA	2	10	1404499	1404508	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017108	ACGCA	2	10	1419569	1419578	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017108	AAGGA	2	10	1462390	1462399	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017108	TAAAA	2	10	1462411	1462420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017108	AGGAA	2	10	1473603	1473612	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017108	AAAAC	2	10	1474822	1474831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017108	AAAAT	2	10	1477896	1477905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017108	GCTAG	2	10	1488377	1488386	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017108	AATAA	2	10	1517193	1517202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017108	ATTTC	2	10	1519022	1519031	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017108	TTTCT	2	10	1523139	1523148	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017108	TTTCT	2	10	1527460	1527469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017108	TGGTG	2	10	1531337	1531346	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017108	TGTTC	2	10	1531350	1531359	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017108	GGGAT	2	10	1536596	1536605	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017108	GCCCA	2	10	1540608	1540617	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017108	CACGA	2	10	1540675	1540684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_017108	CCCAT	2	10	1542005	1542014	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
135	NC_017108	CCTTT	2	10	1547811	1547820	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017108	TATTT	2	10	1562834	1562843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017108	CACAA	2	10	1566413	1566422	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_017108	ATAGC	2	10	1566539	1566548	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017108	TTATT	2	10	1585421	1585430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017108	TTAAA	2	10	1596868	1596877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017108	ATTAA	2	10	1596880	1596889	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017108	TAAAT	2	10	1604581	1604590	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017108	TACGC	2	10	1617732	1617741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017108	TATAT	2	10	1630229	1630238	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017108	AAATT	2	10	1663613	1663622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017108	ATTTT	2	10	1673754	1673763	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017108	TAAAT	2	10	1673828	1673837	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017108	TATTT	2	10	1673949	1673958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017108	TAAAA	2	10	1674184	1674193	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017108	CGATA	2	10	1680228	1680237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_017108	ATAAA	2	10	1680238	1680247	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017108	ATTTT	2	10	1683255	1683264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017108	ATTTT	2	10	1687830	1687839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017108	CTTAC	2	10	1717412	1717421	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
155	NC_017108	GGGAT	2	10	1729679	1729688	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017108	GCCCA	2	10	1733691	1733700	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
157	NC_017108	CACGA	2	10	1733758	1733767	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
158	NC_017108	CCCAT	2	10	1735088	1735097	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
159	NC_017108	AGAAA	2	10	1754006	1754015	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017108	GAAAA	2	10	1784247	1784256	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017108	CCCCG	2	10	1787451	1787460	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
162	NC_017108	TGCCT	2	10	1829964	1829973	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017108	CAGAG	2	10	1873430	1873439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_017108	CTTTT	2	10	1888537	1888546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_017108	TGCCG	2	10	1908580	1908589	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
167	NC_017108	TCTTT	2	10	1911378	1911387	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_017108	TCGGA	2	10	1913063	1913072	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_017108	ACCGC	2	10	1919468	1919477	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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171	NC_017108	GTACG	2	10	1922174	1922183	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_017108	GCTGG	2	10	1922447	1922456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017108	CCCTG	2	10	1922671	1922680	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
174	NC_017108	ACGGT	2	10	1923549	1923558	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
175	NC_017108	TAACG	2	10	1929451	1929460	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
176	NC_017108	AGAAA	2	10	1941296	1941305	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
177	NC_017108	CAAGA	2	10	1946914	1946923	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_017108	ACGAC	2	10	1961693	1961702	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
180	NC_017108	TATAA	2	10	1963510	1963519	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017108	CACTA	2	10	1963603	1963612	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
182	NC_017108	CGAAT	2	10	1963790	1963799	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
183	NC_017108	ATATA	2	10	1969540	1969549	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017108	CAACA	2	10	1980331	1980340	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
185	NC_017108	GCCCT	2	10	1993591	1993600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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188	NC_017108	GGCTT	2	10	2012868	2012877	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
189	NC_017108	CCCTG	2	10	2016632	2016641	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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192	NC_017108	ACATA	2	10	2026367	2026376	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_017108	CGGCG	2	10	2032032	2032041	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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196	NC_017108	ATTTT	2	10	2042299	2042308	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017108	CCTTT	2	10	2048105	2048114	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_017108	CCGCT	2	10	2053736	2053745	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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220	NC_017108	CTGTA	2	10	2332124	2332133	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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222	NC_017108	ATGAA	2	10	2346771	2346780	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_017108	CACAT	2	10	2837225	2837234	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
272	NC_017108	CATTA	2	10	2855656	2855665	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_017108	AAAAG	2	10	2864227	2864236	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_017108	GCAAA	2	10	2890914	2890923	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.