MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	TGTCC	2	10	886	895	0 %	40 %	20 %	40 %	384117722
2	NC_017105	CCAAT	2	10	4003	4012	40 %	20 %	0 %	40 %	384117728
3	NC_017105	GCGGA	2	10	4420	4429	20 %	0 %	60 %	20 %	384117729
4	NC_017105	TGAGA	2	10	5929	5938	40 %	20 %	40 %	0 %	384117730
5	NC_017105	GGCAC	2	10	8920	8929	20 %	0 %	40 %	40 %	384117732
6	NC_017105	CACCC	2	10	9786	9795	20 %	0 %	0 %	80 %	384117733
7	NC_017105	TGATA	2	10	9944	9953	40 %	40 %	20 %	0 %	384117733
8	NC_017105	GGACA	2	10	10765	10774	40 %	0 %	40 %	20 %	384117734
9	NC_017105	TTTCT	2	10	12097	12106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017105	AAAAG	2	10	13311	13320	80 %	0 %	20 %	0 %	384117736
11	NC_017105	TTTTA	2	10	13991	14000	20 %	80 %	0 %	0 %	384117737
12	NC_017105	GGAAA	2	10	15512	15521	60 %	0 %	40 %	0 %	384117738
13	NC_017105	CAATG	2	10	17635	17644	40 %	20 %	20 %	20 %	384117739
14	NC_017105	CCTGC	2	10	19626	19635	0 %	20 %	20 %	60 %	384117741
15	NC_017105	CAGCA	2	10	20035	20044	40 %	0 %	20 %	40 %	384117741
16	NC_017105	ATAGG	2	10	20290	20299	40 %	20 %	40 %	0 %	384117741
17	NC_017105	CATGC	2	10	21389	21398	20 %	20 %	20 %	40 %	384117742
18	NC_017105	CACAC	2	10	21974	21983	40 %	0 %	0 %	60 %	384117743
19	NC_017105	CCAGC	2	10	23410	23419	20 %	0 %	20 %	60 %	384117745
20	NC_017105	GTGGC	2	10	23919	23928	0 %	20 %	60 %	20 %	384117745
21	NC_017105	AAGGC	2	10	27123	27132	40 %	0 %	40 %	20 %	384117748
22	NC_017105	CATTC	2	10	27215	27224	20 %	40 %	0 %	40 %	384117748
23	NC_017105	GGCCC	2	10	28995	29004	0 %	0 %	40 %	60 %	384117748
24	NC_017105	AGGAT	2	10	30340	30349	40 %	20 %	40 %	0 %	384117751
25	NC_017105	TGTGG	2	10	33958	33967	0 %	40 %	60 %	0 %	384117754
26	NC_017105	GGAAA	2	10	34169	34178	60 %	0 %	40 %	0 %	384117754
27	NC_017105	GAAAA	2	10	35455	35464	80 %	0 %	20 %	0 %	384117754
28	NC_017105	GGAAG	2	10	35496	35505	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017105	ACGAT	2	10	36891	36900	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017105	TAAAA	2	10	37109	37118	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017105	CTGAT	2	10	39730	39739	20 %	40 %	20 %	20 %	384117759
32	NC_017105	AGGCA	2	10	40730	40739	40 %	0 %	40 %	20 %	384117760
33	NC_017105	GTTGG	2	10	43343	43352	0 %	40 %	60 %	0 %	384117761
34	NC_017105	GCCAT	2	10	43394	43403	20 %	20 %	20 %	40 %	384117761
35	NC_017105	ACCAT	2	10	43592	43601	40 %	20 %	0 %	40 %	384117761
36	NC_017105	CCCTG	2	10	45133	45142	0 %	20 %	20 %	60 %	384117762
37	NC_017105	AAATC	2	10	49246	49255	60 %	20 %	0 %	20 %	384117767
38	NC_017105	TGCGC	2	10	50463	50472	0 %	20 %	40 %	40 %	384117768
39	NC_017105	AGGCA	2	10	51467	51476	40 %	0 %	40 %	20 %	384117769
40	NC_017105	ACGAC	2	10	53050	53059	40 %	0 %	20 %	40 %	384117771
41	NC_017105	CGGGT	2	10	55158	55167	0 %	20 %	60 %	20 %	384117774
42	NC_017105	TGCCG	2	10	55770	55779	0 %	20 %	40 %	40 %	384117775
43	NC_017105	GGTCG	2	10	55882	55891	0 %	20 %	60 %	20 %	384117775
44	NC_017105	GCGCC	2	10	57008	57017	0 %	0 %	40 %	60 %	384117776
45	NC_017105	CAGAC	2	10	58278	58287	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_017105	CCATC	2	10	58345	58354	20 %	20 %	0 %	60 %	384117778
47	NC_017105	GCGTT	2	10	58683	58692	0 %	40 %	40 %	20 %	384117778
48	NC_017105	GCAGG	2	10	60057	60066	20 %	0 %	60 %	20 %	384117779
49	NC_017105	CCGTC	2	10	60828	60837	0 %	20 %	20 %	60 %	384117779
50	NC_017105	ATTTT	2	10	63376	63385	20 %	80 %	0 %	0 %	384117780
51	NC_017105	GCTGG	2	10	65314	65323	0 %	20 %	60 %	20 %	384117782
52	NC_017105	GTCCA	2	10	65541	65550	20 %	20 %	20 %	40 %	384117782
53	NC_017105	GCCAC	2	10	66228	66237	20 %	0 %	20 %	60 %	384117783
54	NC_017105	GCTGG	2	10	66737	66746	0 %	20 %	60 %	20 %	384117783
55	NC_017105	GGCGC	2	10	68688	68697	0 %	0 %	60 %	40 %	384117787
56	NC_017105	CATGA	2	10	71467	71476	40 %	20 %	20 %	20 %	384117791
57	NC_017105	GCATT	2	10	71970	71979	20 %	40 %	20 %	20 %	384117791
58	NC_017105	GACTG	2	10	72835	72844	20 %	20 %	40 %	20 %	384117792
59	NC_017105	GTCCT	2	10	74718	74727	0 %	40 %	20 %	40 %	384117794
60	NC_017105	TGATC	2	10	75423	75432	20 %	40 %	20 %	20 %	384117795
61	NC_017105	TGCTC	2	10	76204	76213	0 %	40 %	20 %	40 %	384117796
62	NC_017105	TATTG	2	10	76431	76440	20 %	60 %	20 %	0 %	384117796
63	NC_017105	AGCTC	2	10	77560	77569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017105	CCAGC	2	10	79259	79268	20 %	0 %	20 %	60 %	384117800
65	NC_017105	GAGAT	2	10	80260	80269	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017105	TTTCC	2	10	80722	80731	0 %	60 %	0 %	40 %	384117801
67	NC_017105	GCTGG	2	10	82687	82696	0 %	20 %	60 %	20 %	384117802
68	NC_017105	GCCCG	2	10	83988	83997	0 %	0 %	40 %	60 %	384117805
69	NC_017105	TGAGG	2	10	85064	85073	20 %	20 %	60 %	0 %	384117806
70	NC_017105	AGAAA	2	10	85969	85978	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017105	TGTCC	2	10	87302	87311	0 %	40 %	20 %	40 %	384117808
72	NC_017105	GGACA	2	10	89046	89055	40 %	0 %	40 %	20 %	384117811
73	NC_017105	TTTCT	2	10	90379	90388	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017105	AGCGG	2	10	90658	90667	20 %	0 %	60 %	20 %	384117812
75	NC_017105	TCGCC	2	10	90767	90776	0 %	20 %	20 %	60 %	384117812
76	NC_017105	GCATG	2	10	90953	90962	20 %	20 %	40 %	20 %	384117812
77	NC_017105	ATTCC	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	384117812
78	NC_017105	AGCGA	2	10	93876	93885	40 %	0 %	40 %	20 %	384117814
79	NC_017105	CAAAG	2	10	96047	96056	60 %	0 %	20 %	20 %	384117817
80	NC_017105	CAGCC	2	10	96867	96876	20 %	0 %	20 %	60 %	384117818
81	NC_017105	AGACA	2	10	98248	98257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017105	GTTGG	2	10	100432	100441	0 %	40 %	60 %	0 %	384117822
83	NC_017105	TTTTC	2	10	101545	101554	0 %	80 %	0 %	20 %	384117822
84	NC_017105	GTGCC	2	10	102071	102080	0 %	20 %	40 %	40 %	384117822
85	NC_017105	CCAGC	2	10	102558	102567	20 %	0 %	20 %	60 %	384117824
86	NC_017105	GTGGC	2	10	103067	103076	0 %	20 %	60 %	20 %	384117824
87	NC_017105	CACTG	2	10	103983	103992	20 %	20 %	20 %	40 %	384117826
88	NC_017105	TGGAC	2	10	104346	104355	20 %	20 %	40 %	20 %	384117826
89	NC_017105	GGACA	2	10	105552	105561	40 %	0 %	40 %	20 %	384117828
90	NC_017105	TGCGC	2	10	110147	110156	0 %	20 %	40 %	40 %	384117833
91	NC_017105	GGACA	2	10	112712	112721	40 %	0 %	40 %	20 %	384117835
92	NC_017105	GATAA	2	10	114225	114234	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017105	CCATG	2	10	114613	114622	20 %	20 %	20 %	40 %	384117836
94	NC_017105	GATAC	2	10	116689	116698	40 %	20 %	20 %	20 %	384117838
95	NC_017105	GCTGG	2	10	117551	117560	0 %	20 %	60 %	20 %	384117839
96	NC_017105	CTGAC	2	10	118186	118195	20 %	20 %	20 %	40 %	384117842
97	NC_017105	TTTTC	2	10	118980	118989	0 %	80 %	0 %	20 %	384117843
98	NC_017105	CGTTT	2	10	119631	119640	0 %	60 %	20 %	20 %	384117844
99	NC_017105	CACTG	2	10	121386	121395	20 %	20 %	20 %	40 %	384117844
100	NC_017105	TTATT	2	10	126656	126665	20 %	80 %	0 %	0 %	384117849
101	NC_017105	CGTTC	2	10	127203	127212	0 %	40 %	20 %	40 %	384117850
102	NC_017105	CGGTC	2	10	128949	128958	0 %	20 %	40 %	40 %	384117851
103	NC_017105	GAAGC	2	10	132093	132102	40 %	0 %	40 %	20 %	384117852
104	NC_017105	TCAAG	2	10	133131	133140	40 %	20 %	20 %	20 %	384117853
105	NC_017105	CAGGA	2	10	134251	134260	40 %	0 %	40 %	20 %	384117854
106	NC_017105	CGGAC	2	10	135105	135114	20 %	0 %	40 %	40 %	384117854
107	NC_017105	GAGCA	2	10	137241	137250	40 %	0 %	40 %	20 %	384117856
108	NC_017105	GACAG	2	10	138415	138424	40 %	0 %	40 %	20 %	384117858
109	NC_017105	GCTGT	2	10	142569	142578	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017105	AGCGG	2	10	142650	142659	20 %	0 %	60 %	20 %	384117860
111	NC_017105	CGCGA	2	10	146926	146935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017105	AGGTC	2	10	147737	147746	20 %	20 %	40 %	20 %	384117864
113	NC_017105	CATCG	2	10	149288	149297	20 %	20 %	20 %	40 %	384117865
114	NC_017105	GGCAG	2	10	149790	149799	20 %	0 %	60 %	20 %	384117866
115	NC_017105	CGGCA	2	10	150231	150240	20 %	0 %	40 %	40 %	384117866
116	NC_017105	CCTCA	2	10	152774	152783	20 %	20 %	0 %	60 %	384117869
117	NC_017105	CCGGG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	384117870
118	NC_017105	CGTTT	2	10	154790	154799	0 %	60 %	20 %	20 %	384117872
119	NC_017105	AGAAA	2	10	155636	155645	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017105	TGTCC	2	10	156969	156978	0 %	40 %	20 %	40 %	384117874
121	NC_017105	GCCAT	2	10	159119	159128	20 %	20 %	20 %	40 %	384117876
122	NC_017105	TCTTT	2	10	159638	159647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017105	TGAAT	2	10	159976	159985	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017105	AGCTG	2	10	160166	160175	20 %	20 %	40 %	20 %	384117877
125	NC_017105	CGTTC	2	10	162714	162723	0 %	40 %	20 %	40 %	384117881
126	NC_017105	CCCTG	2	10	166572	166581	0 %	20 %	20 %	60 %	384117882
127	NC_017105	CTGCT	2	10	168244	168253	0 %	40 %	20 %	40 %	384117882
128	NC_017105	GAGGG	2	10	168396	168405	20 %	0 %	80 %	0 %	384117882
129	NC_017105	GGAGC	2	10	168700	168709	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017105	AGCAA	2	10	169606	169615	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017105	ATTAA	2	10	171299	171308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017105	TTGAA	2	10	172596	172605	40 %	40 %	20 %	0 %	384117885
133	NC_017105	GCGTT	2	10	172737	172746	0 %	40 %	40 %	20 %	384117885
134	NC_017105	GGGCA	2	10	174165	174174	20 %	0 %	60 %	20 %	384117886
135	NC_017105	GGCAC	2	10	175804	175813	20 %	0 %	40 %	40 %	384117887

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.