MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 405

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	CGGG	2	8	87	94	0 %	0 %	75 %	25 %	384117720
2	NC_017105	TCTG	2	8	561	568	0 %	50 %	25 %	25 %	384117721
3	NC_017105	CGTC	2	8	874	881	0 %	25 %	25 %	50 %	384117722
4	NC_017105	AACA	2	8	1292	1299	75 %	0 %	0 %	25 %	384117723
5	NC_017105	TGGC	2	8	2514	2521	0 %	25 %	50 %	25 %	384117725
6	NC_017105	TCGT	2	8	3343	3350	0 %	50 %	25 %	25 %	384117727
7	NC_017105	CCAT	2	8	3600	3607	25 %	25 %	0 %	50 %	384117727
8	NC_017105	ATAA	2	8	3657	3664	75 %	25 %	0 %	0 %	384117727
9	NC_017105	TGGG	2	8	4569	4576	0 %	25 %	75 %	0 %	384117729
10	NC_017105	CCTT	2	8	4594	4601	0 %	50 %	0 %	50 %	384117729
11	NC_017105	CATG	2	8	4908	4915	25 %	25 %	25 %	25 %	384117730
12	NC_017105	CGGC	2	8	7116	7123	0 %	0 %	50 %	50 %	384117731
13	NC_017105	GCCT	2	8	7360	7367	0 %	25 %	25 %	50 %	384117731
14	NC_017105	GGGC	2	8	7433	7440	0 %	0 %	75 %	25 %	384117731
15	NC_017105	GCCA	2	8	7656	7663	25 %	0 %	25 %	50 %	384117731
16	NC_017105	GATG	2	8	8287	8294	25 %	25 %	50 %	0 %	384117732
17	NC_017105	ACGC	2	8	8768	8775	25 %	0 %	25 %	50 %	384117732
18	NC_017105	GTGC	2	8	9582	9589	0 %	25 %	50 %	25 %	384117733
19	NC_017105	CACC	2	8	10017	10024	25 %	0 %	0 %	75 %	384117733
20	NC_017105	CCAT	2	8	10099	10106	25 %	25 %	0 %	50 %	384117733
21	NC_017105	GACG	2	8	10779	10786	25 %	0 %	50 %	25 %	384117734
22	NC_017105	CTTC	2	8	11418	11425	0 %	50 %	0 %	50 %	384117734
23	NC_017105	CGGG	2	8	11588	11595	0 %	0 %	75 %	25 %	384117734
24	NC_017105	GCCA	2	8	11722	11729	25 %	0 %	25 %	50 %	384117734
25	NC_017105	TCGA	2	8	12627	12634	25 %	25 %	25 %	25 %	384117735
26	NC_017105	ATGG	2	8	13366	13373	25 %	25 %	50 %	0 %	384117736
27	NC_017105	TATC	2	8	13486	13493	25 %	50 %	0 %	25 %	384117736
28	NC_017105	ACCC	2	8	13601	13608	25 %	0 %	0 %	75 %	384117736
29	NC_017105	AGAC	2	8	13721	13728	50 %	0 %	25 %	25 %	384117736
30	NC_017105	TCCT	2	8	14307	14314	0 %	50 %	0 %	50 %	384117737
31	NC_017105	TGCG	2	8	14597	14604	0 %	25 %	50 %	25 %	384117737
32	NC_017105	AGTG	2	8	14704	14711	25 %	25 %	50 %	0 %	384117737
33	NC_017105	CAAT	2	8	15055	15062	50 %	25 %	0 %	25 %	384117737
34	NC_017105	AGAT	2	8	15129	15136	50 %	25 %	25 %	0 %	384117737
35	NC_017105	CAGC	2	8	15743	15750	25 %	0 %	25 %	50 %	384117738
36	NC_017105	AACC	2	8	15848	15855	50 %	0 %	0 %	50 %	384117738
37	NC_017105	AAAC	2	8	16914	16921	75 %	0 %	0 %	25 %	384117739
38	NC_017105	CAGA	2	8	17163	17170	50 %	0 %	25 %	25 %	384117739
39	NC_017105	ACAT	2	8	17816	17823	50 %	25 %	0 %	25 %	384117739
40	NC_017105	GTCA	2	8	18151	18158	25 %	25 %	25 %	25 %	384117739
41	NC_017105	GGGC	2	8	18324	18331	0 %	0 %	75 %	25 %	384117740
42	NC_017105	AGAT	2	8	18582	18589	50 %	25 %	25 %	0 %	384117740
43	NC_017105	CAGA	2	8	19019	19026	50 %	0 %	25 %	25 %	384117741
44	NC_017105	CCGC	2	8	19208	19215	0 %	0 %	25 %	75 %	384117741
45	NC_017105	GTAT	2	8	20679	20686	25 %	50 %	25 %	0 %	384117742
46	NC_017105	GACA	2	8	20979	20986	50 %	0 %	25 %	25 %	384117742
47	NC_017105	TGAA	2	8	21102	21109	50 %	25 %	25 %	0 %	384117742
48	NC_017105	GAAC	2	8	21813	21820	50 %	0 %	25 %	25 %	384117743
49	NC_017105	GAAG	2	8	23380	23387	50 %	0 %	50 %	0 %	384117744
50	NC_017105	GATG	2	8	23793	23800	25 %	25 %	50 %	0 %	384117745
51	NC_017105	GTCA	2	8	23968	23975	25 %	25 %	25 %	25 %	384117745
52	NC_017105	TTTG	2	8	24102	24109	0 %	75 %	25 %	0 %	384117745
53	NC_017105	CATC	2	8	24507	24514	25 %	25 %	0 %	50 %	384117746
54	NC_017105	CGCA	2	8	25688	25695	25 %	0 %	25 %	50 %	384117747
55	NC_017105	ATCA	2	8	25916	25923	50 %	25 %	0 %	25 %	384117747
56	NC_017105	TGCC	2	8	25988	25995	0 %	25 %	25 %	50 %	384117747
57	NC_017105	TCAC	2	8	26123	26130	25 %	25 %	0 %	50 %	384117748
58	NC_017105	AGCC	3	12	26574	26585	25 %	0 %	25 %	50 %	384117748
59	NC_017105	TCCA	2	8	27262	27269	25 %	25 %	0 %	50 %	384117748
60	NC_017105	TGGC	2	8	27494	27501	0 %	25 %	50 %	25 %	384117748
61	NC_017105	GTCC	2	8	27542	27549	0 %	25 %	25 %	50 %	384117748
62	NC_017105	CGGA	2	8	29386	29393	25 %	0 %	50 %	25 %	384117748
63	NC_017105	TGGC	2	8	29654	29661	0 %	25 %	50 %	25 %	384117749
64	NC_017105	CATC	2	8	31929	31936	25 %	25 %	0 %	50 %	384117752
65	NC_017105	AACC	2	8	32208	32215	50 %	0 %	0 %	50 %	384117752
66	NC_017105	AGCC	2	8	33025	33032	25 %	0 %	25 %	50 %	384117752
67	NC_017105	CTGC	2	8	34244	34251	0 %	25 %	25 %	50 %	384117754
68	NC_017105	CCAA	2	8	34290	34297	50 %	0 %	0 %	50 %	384117754
69	NC_017105	TTGT	2	8	34645	34652	0 %	75 %	25 %	0 %	384117754
70	NC_017105	ATCC	2	8	34709	34716	25 %	25 %	0 %	50 %	384117754
71	NC_017105	TGCC	2	8	34783	34790	0 %	25 %	25 %	50 %	384117754
72	NC_017105	CAGC	2	8	35597	35604	25 %	0 %	25 %	50 %	384117755
73	NC_017105	AAGC	2	8	35822	35829	50 %	0 %	25 %	25 %	384117755
74	NC_017105	ACGA	2	8	35937	35944	50 %	0 %	25 %	25 %	384117755
75	NC_017105	AAAT	2	8	36012	36019	75 %	25 %	0 %	0 %	384117756
76	NC_017105	AGCC	2	8	36032	36039	25 %	0 %	25 %	50 %	384117756
77	NC_017105	AAGC	2	8	36262	36269	50 %	0 %	25 %	25 %	384117756
78	NC_017105	AACA	2	8	36440	36447	75 %	0 %	0 %	25 %	384117756
79	NC_017105	AAAG	2	8	36661	36668	75 %	0 %	25 %	0 %	384117756
80	NC_017105	GCAA	2	8	36672	36679	50 %	0 %	25 %	25 %	384117756
81	NC_017105	ATTT	2	8	37196	37203	25 %	75 %	0 %	0 %	384117757
82	NC_017105	CTGC	2	8	37669	37676	0 %	25 %	25 %	50 %	384117757
83	NC_017105	CCAG	2	8	37740	37747	25 %	0 %	25 %	50 %	384117757
84	NC_017105	TTTC	2	8	37873	37880	0 %	75 %	0 %	25 %	384117757
85	NC_017105	TGGA	2	8	38696	38703	25 %	25 %	50 %	0 %	384117758
86	NC_017105	CACG	2	8	39350	39357	25 %	0 %	25 %	50 %	384117759
87	NC_017105	GCCT	2	8	39607	39614	0 %	25 %	25 %	50 %	384117759
88	NC_017105	TTCA	2	8	39663	39670	25 %	50 %	0 %	25 %	384117759
89	NC_017105	TCAC	2	8	40248	40255	25 %	25 %	0 %	50 %	384117760
90	NC_017105	CCAT	2	8	40713	40720	25 %	25 %	0 %	50 %	384117760
91	NC_017105	GGCT	2	8	41097	41104	0 %	25 %	50 %	25 %	384117760
92	NC_017105	TGCG	3	12	41172	41183	0 %	25 %	50 %	25 %	384117760
93	NC_017105	CAGC	2	8	41461	41468	25 %	0 %	25 %	50 %	384117760
94	NC_017105	GTGC	2	8	42249	42256	0 %	25 %	50 %	25 %	384117760
95	NC_017105	CCAC	2	8	42398	42405	25 %	0 %	0 %	75 %	384117760
96	NC_017105	CTCA	2	8	42446	42453	25 %	25 %	0 %	50 %	384117760
97	NC_017105	GCAT	2	8	43157	43164	25 %	25 %	25 %	25 %	384117761
98	NC_017105	TATC	2	8	43212	43219	25 %	50 %	0 %	25 %	384117761
99	NC_017105	CAGA	2	8	43518	43525	50 %	0 %	25 %	25 %	384117761
100	NC_017105	CTGC	2	8	43734	43741	0 %	25 %	25 %	50 %	384117761
101	NC_017105	CCTG	2	8	43752	43759	0 %	25 %	25 %	50 %	384117761
102	NC_017105	ACCA	2	8	43789	43796	50 %	0 %	0 %	50 %	384117761
103	NC_017105	GCAG	2	8	44295	44302	25 %	0 %	50 %	25 %	384117762
104	NC_017105	CTGC	2	8	44309	44316	0 %	25 %	25 %	50 %	384117762
105	NC_017105	AAGC	2	8	44504	44511	50 %	0 %	25 %	25 %	384117762
106	NC_017105	CTGG	2	8	44804	44811	0 %	25 %	50 %	25 %	384117762
107	NC_017105	CCCT	2	8	45165	45172	0 %	25 %	0 %	75 %	384117762
108	NC_017105	CGAA	2	8	45401	45408	50 %	0 %	25 %	25 %	384117762
109	NC_017105	CCGG	2	8	45658	45665	0 %	0 %	50 %	50 %	384117763
110	NC_017105	GGCA	2	8	45743	45750	25 %	0 %	50 %	25 %	384117763
111	NC_017105	GCGT	2	8	47202	47209	0 %	25 %	50 %	25 %	384117765
112	NC_017105	CATC	2	8	47683	47690	25 %	25 %	0 %	50 %	384117765
113	NC_017105	AGCG	2	8	47798	47805	25 %	0 %	50 %	25 %	384117765
114	NC_017105	GACA	2	8	48781	48788	50 %	0 %	25 %	25 %	384117766
115	NC_017105	TGGT	2	8	48824	48831	0 %	50 %	50 %	0 %	384117766
116	NC_017105	CTGA	2	8	48857	48864	25 %	25 %	25 %	25 %	384117766
117	NC_017105	GAAC	2	8	48912	48919	50 %	0 %	25 %	25 %	384117766
118	NC_017105	CATC	2	8	49130	49137	25 %	25 %	0 %	50 %	384117766
119	NC_017105	CAAC	2	8	49859	49866	50 %	0 %	0 %	50 %	384117767
120	NC_017105	CTGA	2	8	49936	49943	25 %	25 %	25 %	25 %	384117767
121	NC_017105	GCCA	2	8	49986	49993	25 %	0 %	25 %	50 %	384117767
122	NC_017105	ATCA	2	8	50310	50317	50 %	25 %	0 %	25 %	384117767
123	NC_017105	CGGG	2	8	50494	50501	0 %	0 %	75 %	25 %	384117768
124	NC_017105	AATG	2	8	51414	51421	50 %	25 %	25 %	0 %	384117769
125	NC_017105	GATC	2	8	52992	52999	25 %	25 %	25 %	25 %	384117771
126	NC_017105	CAGT	2	8	53754	53761	25 %	25 %	25 %	25 %	384117773
127	NC_017105	GCCC	2	8	54389	54396	0 %	0 %	25 %	75 %	384117774
128	NC_017105	CGTC	2	8	54765	54772	0 %	25 %	25 %	50 %	384117774
129	NC_017105	CACC	2	8	54871	54878	25 %	0 %	0 %	75 %	384117774
130	NC_017105	ACAA	2	8	54945	54952	75 %	0 %	0 %	25 %	384117774
131	NC_017105	GGGT	2	8	55844	55851	0 %	25 %	75 %	0 %	384117775
132	NC_017105	CGGG	2	8	56177	56184	0 %	0 %	75 %	25 %	384117776
133	NC_017105	CAGG	2	8	56655	56662	25 %	0 %	50 %	25 %	384117776
134	NC_017105	CAGC	2	8	56840	56847	25 %	0 %	25 %	50 %	384117776
135	NC_017105	CGGA	2	8	57511	57518	25 %	0 %	50 %	25 %	384117777
136	NC_017105	ACGC	2	8	58813	58820	25 %	0 %	25 %	50 %	384117778
137	NC_017105	TTCC	2	8	59185	59192	0 %	50 %	0 %	50 %	384117779
138	NC_017105	CTGG	2	8	59622	59629	0 %	25 %	50 %	25 %	384117779
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.