MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 2267

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017105	CTT	2	6	161165	161170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117878
2002	NC_017105	ATT	2	6	161175	161180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384117878
2003	NC_017105	TCG	2	6	161217	161222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117878
2004	NC_017105	CAA	2	6	161257	161262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117878
2005	NC_017105	ACG	2	6	161347	161352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117878
2006	NC_017105	TCA	2	6	161359	161364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117878
2007	NC_017105	CAT	2	6	161382	161387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_017105	CGA	2	6	161443	161448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117879
2009	NC_017105	CAG	2	6	161453	161458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117879
2010	NC_017105	ACA	2	6	161625	161630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384117879
2011	NC_017105	CAC	2	6	161691	161696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2012	NC_017105	GCC	2	6	161735	161740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_017105	GGC	2	6	161747	161752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2014	NC_017105	ACG	2	6	161800	161805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117880
2015	NC_017105	CCG	2	6	161936	161941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117880
2016	NC_017105	CAG	3	9	162078	162086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117880
2017	NC_017105	TCT	2	6	162120	162125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117881
2018	NC_017105	CTC	2	6	162199	162204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384117881
2019	NC_017105	TCG	2	6	162282	162287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117881
2020	NC_017105	ATC	2	6	162292	162297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117881
2021	NC_017105	CTG	2	6	162415	162420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117881
2022	NC_017105	CGC	2	6	162433	162438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117881
2023	NC_017105	TCA	3	9	162521	162529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117881
2024	NC_017105	GCG	2	6	162696	162701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117881
2025	NC_017105	CCA	2	6	162743	162748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117881
2026	NC_017105	AAT	2	6	162760	162765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384117881
2027	NC_017105	CAC	2	6	162876	162881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117881
2028	NC_017105	GCA	2	6	162995	163000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117881
2029	NC_017105	ATC	2	6	163034	163039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117881
2030	NC_017105	CTC	2	6	163210	163215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2031	NC_017105	CCG	2	6	163263	163268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_017105	GCG	2	6	163329	163334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_017105	GGC	2	6	163339	163344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2034	NC_017105	AGC	2	6	163426	163431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117882
2035	NC_017105	ATC	2	6	163432	163437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2036	NC_017105	GGA	2	6	163738	163743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384117882
2037	NC_017105	ACT	2	6	163745	163750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2038	NC_017105	CTG	2	6	163780	163785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117882
2039	NC_017105	ACC	2	6	163913	163918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384117882
2040	NC_017105	GTG	2	6	163919	163924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117882
2041	NC_017105	GCC	2	6	163976	163981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384117882
2042	NC_017105	ATC	2	6	164059	164064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
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2044	NC_017105	TGG	2	6	164271	164276	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384117882
2045	NC_017105	CTG	2	6	164290	164295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117882
2046	NC_017105	ATG	2	6	164363	164368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117882
2047	NC_017105	CGA	2	6	164373	164378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117882
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2050	NC_017105	GCT	2	6	164510	164515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117882
2051	NC_017105	ATC	2	6	164648	164653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2052	NC_017105	ATC	2	6	164747	164752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2053	NC_017105	TCA	2	6	164774	164779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2054	NC_017105	CAT	2	6	164826	164831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2055	NC_017105	TCA	2	6	164832	164837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2056	NC_017105	ATG	2	6	164846	164851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384117882
2057	NC_017105	GAC	2	6	164868	164873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384117882
2058	NC_017105	CTG	2	6	164914	164919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117882
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2061	NC_017105	TCA	2	6	165008	165013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384117882
2062	NC_017105	GGC	2	6	165148	165153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117882
2063	NC_017105	CTT	2	6	165286	165291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117882
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2067	NC_017105	CTT	2	6	165498	165503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384117882
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2103	NC_017105	TAT	2	6	169390	169395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2118	NC_017105	GTC	2	6	170348	170353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384117883
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2242	NC_017105	CAG	2	6	180915	180920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_017105	GTG	2	6	181096	181101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2244	NC_017105	GAT	2	6	181112	181117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2245	NC_017105	CCA	2	6	181148	181153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2246	NC_017105	GCG	2	6	181161	181166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2247	NC_017105	AGG	2	6	181196	181201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2248	NC_017105	GGC	2	6	181230	181235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2249	NC_017105	TCA	2	6	181337	181342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2250	NC_017105	TCG	2	6	181465	181470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2251	NC_017105	ACG	2	6	181526	181531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2252	NC_017105	CTT	2	6	181739	181744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_017105	TCC	2	6	181748	181753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2254	NC_017105	CGG	2	6	181846	181851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_017105	TTC	2	6	181896	181901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2256	NC_017105	GAC	2	6	181976	181981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2257	NC_017105	CTG	2	6	182003	182008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2258	NC_017105	CTG	2	6	182147	182152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2259	NC_017105	ATC	3	9	182194	182202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2260	NC_017105	GCC	2	6	182396	182401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2261	NC_017105	CTT	2	6	182424	182429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2262	NC_017105	TCG	2	6	182443	182448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2263	NC_017105	GAC	2	6	182499	182504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2264	NC_017105	CTG	2	6	182550	182555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2265	NC_017105	GCG	2	6	182678	182683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2266	NC_017105	TCA	2	6	182756	182761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2267	NC_017105	AGA	2	6	182917	182922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.