MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_020

Total Repeats: 247

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017105	GC	3	6	96	101	0 %	0 %	50 %	50 %	384117720
2	NC_017105	GC	3	6	2411	2416	0 %	0 %	50 %	50 %	384117725
3	NC_017105	GC	3	6	4931	4936	0 %	0 %	50 %	50 %	384117730
4	NC_017105	GT	3	6	6966	6971	0 %	50 %	50 %	0 %	384117731
5	NC_017105	GC	3	6	7200	7205	0 %	0 %	50 %	50 %	384117731
6	NC_017105	GC	3	6	8169	8174	0 %	0 %	50 %	50 %	384117732
7	NC_017105	GT	3	6	8533	8538	0 %	50 %	50 %	0 %	384117732
8	NC_017105	TC	3	6	9223	9228	0 %	50 %	0 %	50 %	384117732
9	NC_017105	GA	3	6	10031	10036	50 %	0 %	50 %	0 %	384117733
10	NC_017105	TG	3	6	10408	10413	0 %	50 %	50 %	0 %	384117733
11	NC_017105	CG	3	6	11184	11189	0 %	0 %	50 %	50 %	384117734
12	NC_017105	AG	3	6	12220	12225	50 %	0 %	50 %	0 %	384117735
13	NC_017105	AG	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	384117735
14	NC_017105	CA	3	6	12578	12583	50 %	0 %	0 %	50 %	384117735
15	NC_017105	CA	3	6	13021	13026	50 %	0 %	0 %	50 %	384117736
16	NC_017105	GC	3	6	13163	13168	0 %	0 %	50 %	50 %	384117736
17	NC_017105	AG	3	6	13644	13649	50 %	0 %	50 %	0 %	384117736
18	NC_017105	GC	3	6	13682	13687	0 %	0 %	50 %	50 %	384117736
19	NC_017105	GA	3	6	13807	13812	50 %	0 %	50 %	0 %	384117736
20	NC_017105	AT	3	6	14167	14172	50 %	50 %	0 %	0 %	384117737
21	NC_017105	GT	3	6	14231	14236	0 %	50 %	50 %	0 %	384117737
22	NC_017105	CA	3	6	14381	14386	50 %	0 %	0 %	50 %	384117737
23	NC_017105	GC	3	6	14471	14476	0 %	0 %	50 %	50 %	384117737
24	NC_017105	AG	3	6	14692	14697	50 %	0 %	50 %	0 %	384117737
25	NC_017105	CG	3	6	14794	14799	0 %	0 %	50 %	50 %	384117737
26	NC_017105	GC	3	6	15363	15368	0 %	0 %	50 %	50 %	384117738
27	NC_017105	CA	3	6	15593	15598	50 %	0 %	0 %	50 %	384117738
28	NC_017105	GC	3	6	16011	16016	0 %	0 %	50 %	50 %	384117738
29	NC_017105	CG	3	6	16671	16676	0 %	0 %	50 %	50 %	384117738
30	NC_017105	CA	3	6	16694	16699	50 %	0 %	0 %	50 %	384117738
31	NC_017105	GC	3	6	17186	17191	0 %	0 %	50 %	50 %	384117739
32	NC_017105	CA	3	6	17422	17427	50 %	0 %	0 %	50 %	384117739
33	NC_017105	AG	3	6	17557	17562	50 %	0 %	50 %	0 %	384117739
34	NC_017105	GC	3	6	18015	18020	0 %	0 %	50 %	50 %	384117739
35	NC_017105	GC	3	6	20276	20281	0 %	0 %	50 %	50 %	384117741
36	NC_017105	TG	3	6	20871	20876	0 %	50 %	50 %	0 %	384117742
37	NC_017105	GA	3	6	21414	21419	50 %	0 %	50 %	0 %	384117742
38	NC_017105	CG	3	6	22099	22104	0 %	0 %	50 %	50 %	384117743
39	NC_017105	GC	3	6	22280	22285	0 %	0 %	50 %	50 %	384117743
40	NC_017105	GC	3	6	23263	23268	0 %	0 %	50 %	50 %	384117744
41	NC_017105	AG	3	6	24754	24759	50 %	0 %	50 %	0 %	384117746
42	NC_017105	AT	3	6	26281	26286	50 %	50 %	0 %	0 %	384117748
43	NC_017105	CG	3	6	26301	26306	0 %	0 %	50 %	50 %	384117748
44	NC_017105	TC	3	6	29016	29021	0 %	50 %	0 %	50 %	384117748
45	NC_017105	GC	3	6	29551	29556	0 %	0 %	50 %	50 %	384117749
46	NC_017105	GT	3	6	30594	30599	0 %	50 %	50 %	0 %	384117751
47	NC_017105	AG	3	6	30900	30905	50 %	0 %	50 %	0 %	384117752
48	NC_017105	AT	3	6	31598	31603	50 %	50 %	0 %	0 %	384117752
49	NC_017105	AG	3	6	32163	32168	50 %	0 %	50 %	0 %	384117752
50	NC_017105	GT	3	6	33694	33699	0 %	50 %	50 %	0 %	384117753
51	NC_017105	TC	3	6	33795	33800	0 %	50 %	0 %	50 %	384117753
52	NC_017105	TG	3	6	34459	34464	0 %	50 %	50 %	0 %	384117754
53	NC_017105	TA	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	384117755
54	NC_017105	GC	3	6	35897	35902	0 %	0 %	50 %	50 %	384117755
55	NC_017105	TG	3	6	36418	36423	0 %	50 %	50 %	0 %	384117756
56	NC_017105	AT	4	8	37583	37590	50 %	50 %	0 %	0 %	384117757
57	NC_017105	GC	3	6	38062	38067	0 %	0 %	50 %	50 %	384117758
58	NC_017105	GC	3	6	38879	38884	0 %	0 %	50 %	50 %	384117758
59	NC_017105	GC	3	6	39633	39638	0 %	0 %	50 %	50 %	384117759
60	NC_017105	CG	4	8	40227	40234	0 %	0 %	50 %	50 %	384117760
61	NC_017105	AC	3	6	43335	43340	50 %	0 %	0 %	50 %	384117761
62	NC_017105	GA	3	6	43608	43613	50 %	0 %	50 %	0 %	384117761
63	NC_017105	GC	3	6	43805	43810	0 %	0 %	50 %	50 %	384117761
64	NC_017105	GA	3	6	43897	43902	50 %	0 %	50 %	0 %	384117761
65	NC_017105	AC	3	6	44176	44181	50 %	0 %	0 %	50 %	384117761
66	NC_017105	TG	3	6	44705	44710	0 %	50 %	50 %	0 %	384117762
67	NC_017105	CG	3	6	44720	44725	0 %	0 %	50 %	50 %	384117762
68	NC_017105	AT	3	6	45217	45222	50 %	50 %	0 %	0 %	384117762
69	NC_017105	AG	3	6	46748	46753	50 %	0 %	50 %	0 %	384117765
70	NC_017105	AC	3	6	47439	47444	50 %	0 %	0 %	50 %	384117765
71	NC_017105	TC	3	6	48795	48800	0 %	50 %	0 %	50 %	384117766
72	NC_017105	CG	3	6	49016	49021	0 %	0 %	50 %	50 %	384117766
73	NC_017105	GC	3	6	49069	49074	0 %	0 %	50 %	50 %	384117766
74	NC_017105	GC	3	6	49148	49153	0 %	0 %	50 %	50 %	384117766
75	NC_017105	CA	3	6	49307	49312	50 %	0 %	0 %	50 %	384117767
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78	NC_017105	GA	3	6	50829	50834	50 %	0 %	50 %	0 %	384117768
79	NC_017105	AG	3	6	51826	51831	50 %	0 %	50 %	0 %	384117769
80	NC_017105	TC	3	6	53074	53079	0 %	50 %	0 %	50 %	384117771
81	NC_017105	AG	3	6	54530	54535	50 %	0 %	50 %	0 %	384117774
82	NC_017105	CG	3	6	55013	55018	0 %	0 %	50 %	50 %	384117774
83	NC_017105	GC	3	6	55118	55123	0 %	0 %	50 %	50 %	384117774
84	NC_017105	GA	3	6	55817	55822	50 %	0 %	50 %	0 %	384117775
85	NC_017105	CG	3	6	56033	56038	0 %	0 %	50 %	50 %	384117775
86	NC_017105	CT	3	6	57475	57480	0 %	50 %	0 %	50 %	384117777
87	NC_017105	CG	3	6	60492	60497	0 %	0 %	50 %	50 %	384117779
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89	NC_017105	GT	3	6	62130	62135	0 %	50 %	50 %	0 %	384117779
90	NC_017105	TA	3	6	63175	63180	50 %	50 %	0 %	0 %	384117780
91	NC_017105	AT	3	6	63441	63446	50 %	50 %	0 %	0 %	384117780
92	NC_017105	AT	3	6	63501	63506	50 %	50 %	0 %	0 %	384117780
93	NC_017105	CG	3	6	64583	64588	0 %	0 %	50 %	50 %	384117781
94	NC_017105	GT	3	6	64808	64813	0 %	50 %	50 %	0 %	384117781
95	NC_017105	CA	3	6	64921	64926	50 %	0 %	0 %	50 %	384117781
96	NC_017105	CG	3	6	66887	66892	0 %	0 %	50 %	50 %	384117784
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100	NC_017105	GA	3	6	69041	69046	50 %	0 %	50 %	0 %	384117788
101	NC_017105	GT	3	6	69245	69250	0 %	50 %	50 %	0 %	384117789
102	NC_017105	GC	3	6	69324	69329	0 %	0 %	50 %	50 %	384117789
103	NC_017105	AG	3	6	70274	70279	50 %	0 %	50 %	0 %	384117790
104	NC_017105	CA	3	6	70412	70417	50 %	0 %	0 %	50 %	384117790
105	NC_017105	AC	3	6	70725	70730	50 %	0 %	0 %	50 %	384117790
106	NC_017105	AG	3	6	71431	71436	50 %	0 %	50 %	0 %	384117791
107	NC_017105	AC	3	6	71910	71915	50 %	0 %	0 %	50 %	384117791
108	NC_017105	CT	3	6	72749	72754	0 %	50 %	0 %	50 %	384117792
109	NC_017105	CT	3	6	73030	73035	0 %	50 %	0 %	50 %	384117792
110	NC_017105	GA	3	6	73297	73302	50 %	0 %	50 %	0 %	384117792
111	NC_017105	AG	3	6	74299	74304	50 %	0 %	50 %	0 %	384117794
112	NC_017105	AT	3	6	74654	74659	50 %	50 %	0 %	0 %	384117794
113	NC_017105	TC	3	6	75749	75754	0 %	50 %	0 %	50 %	384117795
114	NC_017105	CT	3	6	76403	76408	0 %	50 %	0 %	50 %	384117796
115	NC_017105	GT	3	6	77970	77975	0 %	50 %	50 %	0 %	384117797
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117	NC_017105	CT	3	6	78421	78426	0 %	50 %	0 %	50 %	384117798
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123	NC_017105	GC	3	6	83091	83096	0 %	0 %	50 %	50 %	384117804
124	NC_017105	TC	3	6	83237	83242	0 %	50 %	0 %	50 %	384117804
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128	NC_017105	CG	3	6	89465	89470	0 %	0 %	50 %	50 %	384117811
129	NC_017105	GC	3	6	89878	89883	0 %	0 %	50 %	50 %	384117811
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.