MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	GGCGCG	2	12	2182	2193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384117544
2	NC_017104	GGCTGG	2	12	2206	2217	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384117544
3	NC_017104	GATAAT	2	12	8047	8058	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017104	ATTGTC	2	12	12936	12947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384117552
5	NC_017104	CCTGTC	2	12	12956	12967	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384117552
6	NC_017104	TGGATG	2	12	14865	14876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117553
7	NC_017104	CATCCA	2	12	19839	19850	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117557
8	NC_017104	GGAACT	2	12	21605	21616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384117560
9	NC_017104	CATGCT	2	12	24615	24626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117562
10	NC_017104	TAAGGG	2	12	27692	27703	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384117565
11	NC_017104	TGGATG	2	12	29106	29117	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117567
12	NC_017104	AACAAG	2	12	30351	30362	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384117568
13	NC_017104	GTCAGG	2	12	31120	31131	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017104	TCCTGA	2	12	39493	39504	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384117577
15	NC_017104	TGGATG	2	12	41088	41099	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117579
16	NC_017104	TGGATG	2	12	42757	42768	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117580
17	NC_017104	GTGCTT	2	12	45738	45749	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384117583
18	NC_017104	GGCATC	2	12	50668	50679	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117587
19	NC_017104	CGTCAG	2	12	52721	52732	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117589
20	NC_017104	TTCGGC	2	12	53273	53284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017104	GGCGTG	2	12	62034	62045	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384117595
22	NC_017104	CATCCA	2	12	64848	64859	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117597
23	NC_017104	ATTTTA	2	12	68139	68150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017104	CATTAT	2	12	69801	69812	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384117600
25	NC_017104	GAGGAC	2	12	73481	73492	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384117604
26	NC_017104	CATCCA	2	12	76416	76427	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117606
27	NC_017104	AACCAG	2	12	77751	77762	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384117607
28	NC_017104	CATCCA	2	12	89806	89817	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117616
29	NC_017104	TGGATG	2	12	93984	93995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117621
30	NC_017104	GAATAA	2	12	96474	96485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384117624
31	NC_017104	TCTTAA	2	12	96727	96738	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384117624
32	NC_017104	TTTGCC	2	12	103010	103021	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384117629
33	NC_017104	GGCATC	2	12	108790	108801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117635
34	NC_017104	CAGCCG	2	12	109840	109851	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384117636
35	NC_017104	CTTCCT	2	12	113934	113945	0 %	50 %	0 %	50 %	384117641
36	NC_017104	AGCGGA	2	12	114670	114681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384117643
37	NC_017104	GGGCCA	2	12	117690	117701	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384117644
38	NC_017104	TGCAGG	2	12	120243	120254	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384117646
39	NC_017104	CCAAAA	2	12	124912	124923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017104	CATCCA	2	12	130916	130927	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117659
41	NC_017104	CCCCCT	2	12	132356	132367	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384117661
42	NC_017104	CCAGAA	2	12	139218	139229	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384117670
43	NC_017104	GAGGAA	2	12	140263	140274	50 %	0 %	50 %	0 %	384117671
44	NC_017104	CATCCA	2	12	142018	142029	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117672
45	NC_017104	TGGATG	2	12	145439	145450	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117675
46	NC_017104	CCCACG	2	12	149219	149230	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384117676
47	NC_017104	GATGCC	2	12	151487	151498	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117680
48	NC_017104	CTTCCT	2	12	153894	153905	0 %	50 %	0 %	50 %	384117681
49	NC_017104	TGGATG	2	12	160893	160904	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117694
50	NC_017104	GATGCC	2	12	163896	163907	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384117697
51	NC_017104	CATCCA	2	12	165287	165298	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384117698
52	NC_017104	GCCATC	2	12	171668	171679	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384117703
53	NC_017104	CCCAAA	2	12	175293	175304	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017104	TGGATG	2	12	181501	181512	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117713
55	NC_017104	TGGATG	2	12	183182	183193	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384117714
56	NC_017104	TCCAGC	2	12	186179	186190	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384117716
57	NC_017104	ATTCTG	2	12	186989	187000	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384117716
58	NC_017104	ATACCG	2	12	188303	188314	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384117717
59	NC_017104	TCAGTT	2	12	188470	188481	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384117717
60	NC_017104	TATCGC	2	12	189917	189928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.