MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017104	GGCTC	2	10	2504	2513	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_017104	ATGTG	2	10	7869	7878	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017104	TTTCT	2	10	20369	20378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017104	AGAAA	2	10	28578	28587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017104	GCTCC	2	10	34462	34471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017104	AGAAA	2	10	40560	40569	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017104	AGAAA	2	10	42229	42238	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017104	CTTGC	2	10	82125	82134	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017104	TTTCT	2	10	84075	84084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_017104	CCAGA	2	10	87016	87025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_017104	TCACT	2	10	91458	91467	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_017104	AATCA	2	10	91489	91498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017104	CTGAG	2	10	91506	91515	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017104	TTTAC	2	10	92700	92709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017104	TTATG	2	10	100256	100265	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017104	GACAT	2	10	104122	104131	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017104	GTATT	2	10	111420	111429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017104	TTTCT	2	10	131446	131455	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017104	ATAGT	2	10	135855	135864	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017104	TTTCT	2	10	142548	142557	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017104	CTTTT	2	10	144460	144469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017104	ATGAC	2	10	144600	144609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017104	AGAAA	2	10	144911	144920	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017104	TGATC	2	10	146593	146602	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017104	CAGAT	2	10	146797	146806	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017104	AAACA	2	10	154200	154209	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017104	CTTCC	2	10	154803	154812	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
29	NC_017104	CTGCC	2	10	156375	156384	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017104	AGAAA	2	10	160365	160374	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017104	TCTAT	2	10	162562	162571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017104	TTTCT	2	10	165817	165826	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017104	CTGCT	2	10	169463	169472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017104	CCGGA	2	10	169579	169588	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017104	ATGCA	2	10	176772	176781	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017104	AGAAA	2	10	180973	180982	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017104	AGAAA	2	10	182654	182663	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017104	CCAGC	2	10	190733	190742	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017104	GCCAC	2	10	191562	191571	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.