MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	GGAAA	2	10	2241	2250	60 %	0 %	40 %	0 %	384117544
2	NC_017104	TGCCA	2	10	3472	3481	20 %	20 %	20 %	40 %	384117545
3	NC_017104	CGATC	2	10	3587	3596	20 %	20 %	20 %	40 %	384117545
4	NC_017104	GAGCT	2	10	4178	4187	20 %	20 %	40 %	20 %	384117546
5	NC_017104	CTGTG	2	10	5906	5915	0 %	40 %	40 %	20 %	384117548
6	NC_017104	ATCCG	2	10	9094	9103	20 %	20 %	20 %	40 %	384117551
7	NC_017104	AAGCC	2	10	9435	9444	40 %	0 %	20 %	40 %	384117552
8	NC_017104	TACGC	2	10	11629	11638	20 %	20 %	20 %	40 %	384117552
9	NC_017104	GGACA	2	10	19036	19045	40 %	0 %	40 %	20 %	384117557
10	NC_017104	ACCAC	2	10	20876	20885	40 %	0 %	0 %	60 %	384117558
11	NC_017104	CCAGC	2	10	21345	21354	20 %	0 %	20 %	60 %	384117560
12	NC_017104	CTGGC	2	10	23176	23185	0 %	20 %	40 %	40 %	384117562
13	NC_017104	TGCAA	2	10	23742	23751	40 %	20 %	20 %	20 %	384117562
14	NC_017104	CTGGT	2	10	24033	24042	0 %	40 %	40 %	20 %	384117562
15	NC_017104	TGTCC	2	10	29911	29920	0 %	40 %	20 %	40 %	384117567
16	NC_017104	CACCT	2	10	32879	32888	20 %	20 %	0 %	60 %	384117570
17	NC_017104	GCAGG	2	10	36596	36605	20 %	0 %	60 %	20 %	384117573
18	NC_017104	GCTGT	2	10	37645	37654	0 %	40 %	40 %	20 %	384117574
19	NC_017104	CATGC	2	10	39830	39839	20 %	20 %	20 %	40 %	384117577
20	NC_017104	TGTCC	2	10	41893	41902	0 %	40 %	20 %	40 %	384117579
21	NC_017104	TGTCC	2	10	43562	43571	0 %	40 %	20 %	40 %	384117580
22	NC_017104	ATGGC	2	10	46264	46273	20 %	20 %	40 %	20 %	384117583
23	NC_017104	CCTGA	2	10	46798	46807	20 %	20 %	20 %	40 %	384117583
24	NC_017104	TTATT	2	10	51250	51259	20 %	80 %	0 %	0 %	384117588
25	NC_017104	CGTTC	2	10	51797	51806	0 %	40 %	20 %	40 %	384117589
26	NC_017104	CGGTC	2	10	53543	53552	0 %	20 %	40 %	40 %	384117590
27	NC_017104	GAAGC	2	10	56687	56696	40 %	0 %	40 %	20 %	384117591
28	NC_017104	TCAAG	2	10	57725	57734	40 %	20 %	20 %	20 %	384117592
29	NC_017104	CAGGA	2	10	58845	58854	40 %	0 %	40 %	20 %	384117593
30	NC_017104	CGGAC	2	10	59699	59708	20 %	0 %	40 %	40 %	384117593
31	NC_017104	CACAT	2	10	63134	63143	40 %	20 %	0 %	40 %	384117596
32	NC_017104	ACACA	2	10	65898	65907	60 %	0 %	0 %	40 %	384117598
33	NC_017104	TTACA	2	10	69296	69305	40 %	40 %	0 %	20 %	384117600
34	NC_017104	ACTGT	2	10	69401	69410	20 %	40 %	20 %	20 %	384117600
35	NC_017104	CAACG	2	10	70813	70822	40 %	0 %	20 %	40 %	384117601
36	NC_017104	CCGTC	2	10	71798	71807	0 %	20 %	20 %	60 %	384117602
37	NC_017104	AGCAG	2	10	74211	74220	40 %	0 %	40 %	20 %	384117604
38	NC_017104	GGACA	2	10	75613	75622	40 %	0 %	40 %	20 %	384117606
39	NC_017104	CACAC	2	10	77427	77436	40 %	0 %	0 %	60 %	384117607
40	NC_017104	ACGCC	2	10	81578	81587	20 %	0 %	20 %	60 %	384117609
41	NC_017104	CCGCG	2	10	82493	82502	0 %	0 %	40 %	60 %	384117610
42	NC_017104	GCACA	2	10	83388	83397	40 %	0 %	20 %	40 %	384117611
43	NC_017104	GCTGT	2	10	84914	84923	0 %	40 %	40 %	20 %	384117613
44	NC_017104	CCGAG	2	10	87329	87338	20 %	0 %	40 %	40 %	384117615
45	NC_017104	GGACA	2	10	89003	89012	40 %	0 %	40 %	20 %	384117616
46	NC_017104	TTTCT	2	10	90336	90345	0 %	80 %	0 %	20 %	384117617
47	NC_017104	TCCTC	2	10	92390	92399	0 %	40 %	0 %	60 %	384117619
48	NC_017104	TGTCC	2	10	94789	94798	0 %	40 %	20 %	40 %	384117621
49	NC_017104	ATGCA	2	10	98357	98366	40 %	20 %	20 %	20 %	384117625
50	NC_017104	CCTGA	2	10	100784	100793	20 %	20 %	20 %	40 %	384117627
51	NC_017104	CATTG	2	10	100824	100833	20 %	40 %	20 %	20 %	384117627
52	NC_017104	CAAGG	2	10	101882	101891	40 %	0 %	40 %	20 %	384117627
53	NC_017104	CTGGG	2	10	102128	102137	0 %	20 %	60 %	20 %	384117627
54	NC_017104	AGGGG	2	10	102372	102381	20 %	0 %	80 %	0 %	384117627
55	NC_017104	CTATT	2	10	105536	105545	20 %	60 %	0 %	20 %	384117631
56	NC_017104	GTCAC	2	10	114904	114913	20 %	20 %	20 %	40 %	384117643
57	NC_017104	TTGGA	2	10	118256	118265	20 %	40 %	40 %	0 %	384117644
58	NC_017104	CGGTT	2	10	119364	119373	0 %	40 %	40 %	20 %	384117645
59	NC_017104	CGTCC	2	10	126111	126120	0 %	20 %	20 %	60 %	384117653
60	NC_017104	TTTCA	2	10	126352	126361	20 %	60 %	0 %	20 %	384117653
61	NC_017104	TTATT	2	10	129084	129093	20 %	80 %	0 %	0 %	384117657
62	NC_017104	GGACA	2	10	130113	130122	40 %	0 %	40 %	20 %	384117659
63	NC_017104	GCCCT	2	10	132104	132113	0 %	20 %	20 %	60 %	384117661
64	NC_017104	GCCAC	2	10	133706	133715	20 %	0 %	20 %	60 %	384117663
65	NC_017104	GCTGG	2	10	134215	134224	0 %	20 %	60 %	20 %	384117663
66	NC_017104	AGCGA	2	10	134650	134659	40 %	0 %	40 %	20 %	384117665
67	NC_017104	TCCGT	2	10	137303	137312	0 %	40 %	20 %	40 %	384117669
68	NC_017104	CTGCG	2	10	138031	138040	0 %	20 %	40 %	40 %	384117669
69	NC_017104	TCGCG	2	10	138566	138575	0 %	20 %	40 %	40 %	384117669
70	NC_017104	CGTCC	2	10	140713	140722	0 %	20 %	20 %	60 %	384117671
71	NC_017104	GGACA	2	10	141215	141224	40 %	0 %	40 %	20 %	384117672
72	NC_017104	CATGG	2	10	143332	143341	20 %	20 %	40 %	20 %	384117674
73	NC_017104	AATTA	2	10	143497	143506	60 %	40 %	0 %	0 %	384117674
74	NC_017104	TGTCC	2	10	146244	146253	0 %	40 %	20 %	40 %	384117675
75	NC_017104	ACCGT	2	10	147346	147355	20 %	20 %	20 %	40 %	384117676
76	NC_017104	GATCA	2	10	147978	147987	40 %	20 %	20 %	20 %	384117676
77	NC_017104	TGGGG	2	10	149924	149933	0 %	20 %	80 %	0 %	384117678
78	NC_017104	GGCAC	2	10	152046	152055	20 %	0 %	40 %	40 %	384117680
79	NC_017104	CCAAC	2	10	157944	157953	40 %	0 %	0 %	60 %	384117687
80	NC_017104	CTGCC	2	10	159061	159070	0 %	20 %	20 %	60 %	384117691
81	NC_017104	GCCAT	2	10	159413	159422	20 %	20 %	20 %	40 %	384117692
82	NC_017104	GCCAC	2	10	160235	160244	20 %	0 %	20 %	60 %	384117693
83	NC_017104	TGTCC	2	10	161698	161707	0 %	40 %	20 %	40 %	384117694
84	NC_017104	TGCCC	2	10	163247	163256	0 %	20 %	20 %	60 %	384117696
85	NC_017104	GGACA	2	10	164484	164493	40 %	0 %	40 %	20 %	384117698
86	NC_017104	CATCT	2	10	165977	165986	20 %	40 %	0 %	40 %	384117699
87	NC_017104	ATCGC	2	10	166236	166245	20 %	20 %	20 %	40 %	384117699
88	NC_017104	CCAAC	2	10	166436	166445	40 %	0 %	0 %	60 %	384117700
89	NC_017104	TCCGG	2	10	167675	167684	0 %	20 %	40 %	40 %	384117700
90	NC_017104	TCCGG	2	10	172164	172173	0 %	20 %	40 %	40 %	384117704
91	NC_017104	TCGCG	2	10	172224	172233	0 %	20 %	40 %	40 %	384117704
92	NC_017104	CCCGG	2	10	172431	172440	0 %	0 %	40 %	60 %	384117705
93	NC_017104	GTCCG	2	10	173035	173044	0 %	20 %	40 %	40 %	384117705
94	NC_017104	TGATC	2	10	173785	173794	20 %	40 %	20 %	20 %	384117706
95	NC_017104	ACACC	2	10	175358	175367	40 %	0 %	0 %	60 %	384117708
96	NC_017104	AGTAG	2	10	175991	176000	40 %	20 %	40 %	0 %	384117708
97	NC_017104	CGATG	2	10	177569	177578	20 %	20 %	40 %	20 %	384117709
98	NC_017104	GGAAA	2	10	178457	178466	60 %	0 %	40 %	0 %	384117710
99	NC_017104	TGTCC	2	10	182306	182315	0 %	40 %	20 %	40 %	384117713
100	NC_017104	TGTCC	2	10	183987	183996	0 %	40 %	20 %	40 %	384117714
101	NC_017104	GCCCA	2	10	185290	185299	20 %	0 %	20 %	60 %	384117716
102	NC_017104	TGCTC	2	10	186099	186108	0 %	40 %	20 %	40 %	384117716
103	NC_017104	CCGAG	2	10	186696	186705	20 %	0 %	40 %	40 %	384117716
104	NC_017104	CATGC	2	10	187243	187252	20 %	20 %	20 %	40 %	384117717
105	NC_017104	CCTGC	2	10	187823	187832	0 %	20 %	20 %	60 %	384117717
106	NC_017104	ACGAC	2	10	190383	190392	40 %	0 %	20 %	40 %	384117718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.