MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 110

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	CTTC	2	8	1376	1383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017104	ACGG	2	8	2750	2757	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017104	GATC	3	12	2946	2957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017104	TCGT	2	8	4657	4664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017104	AGCC	2	8	5215	5222	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017104	CGGT	2	8	8856	8863	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017104	TTGC	2	8	13612	13619	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017104	CGAT	2	8	13746	13753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017104	GACT	2	8	13860	13867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017104	ACAG	2	8	15762	15769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017104	TAAC	2	8	18368	18375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017104	TTTG	2	8	18403	18410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017104	CTGT	2	8	18946	18953	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017104	TCTT	2	8	25758	25765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017104	ACTG	2	8	28228	28235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017104	ACAG	2	8	30003	30010	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017104	GACT	2	8	30803	30810	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017104	CCAC	2	8	34495	34502	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_017104	CCAT	2	8	37490	37497	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017104	CCGT	2	8	38723	38730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017104	ATCC	2	8	38860	38867	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017104	ATCC	2	8	39047	39054	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017104	ACAG	2	8	41985	41992	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017104	ACAG	2	8	43654	43661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017104	AATA	2	8	45593	45600	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017104	AGGC	2	8	48483	48490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017104	CTTC	2	8	49489	49496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017104	GTGA	2	8	49585	49592	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017104	GGTA	2	8	50973	50980	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017104	AAAT	2	8	61296	61303	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017104	CTGT	2	8	63955	63962	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017104	GGAA	2	8	65498	65505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017104	CTGA	2	8	67826	67833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017104	TTTA	2	8	67938	67945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017104	GTCA	2	8	70253	70260	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017104	CTTA	2	8	74935	74942	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017104	CCAG	2	8	75145	75152	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017104	GATA	2	8	75182	75189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017104	CTGT	2	8	75523	75530	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017104	CCTG	2	8	80950	80957	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017104	GTGG	2	8	82014	82021	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017104	CAGG	2	8	82112	82119	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017104	GAAT	2	8	84634	84641	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017104	CCAT	2	8	84759	84766	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017104	CAAG	2	8	85912	85919	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017104	CCGG	2	8	87003	87010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017104	ATTG	2	8	87048	87055	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017104	CCAG	2	8	88079	88086	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017104	CGTC	2	8	88279	88286	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017104	AACT	2	8	88450	88457	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017104	CTGT	2	8	88913	88920	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017104	GTTC	2	8	91421	91428	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017104	AAAG	2	8	91557	91564	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017104	ACTT	2	8	92714	92721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017104	TACC	2	8	92748	92755	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017104	ACAG	2	8	94881	94888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017104	CTTT	2	8	96125	96132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017104	TGTT	2	8	96160	96167	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017104	AGTA	2	8	96300	96307	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017104	AAAT	2	8	96387	96394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017104	GATG	2	8	100686	100693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017104	ATTG	2	8	103885	103892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017104	GTAA	2	8	104096	104103	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017104	GGTA	2	8	104704	104711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017104	AGAT	2	8	104907	104914	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017104	TTCT	2	8	105239	105246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_017104	TATT	2	8	105787	105794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017104	CTTG	2	8	105818	105825	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017104	GTGA	2	8	107707	107714	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017104	CAAT	2	8	111443	111450	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017104	GTGC	2	8	126872	126879	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017104	TGGA	2	8	128840	128847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017104	CTGT	2	8	130023	130030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017104	TTGA	2	8	132419	132426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017104	TTGA	2	8	132461	132468	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017104	AGCA	2	8	135885	135892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017104	GCCG	2	8	136994	137001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017104	GGCG	2	8	139043	139050	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017104	ACGA	2	8	140030	140037	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017104	CTGT	2	8	141125	141132	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017104	GAAC	2	8	144410	144417	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017104	ACAG	2	8	146336	146343	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017104	GCAG	2	8	147021	147028	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017104	CTGT	2	8	149889	149896	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017104	CTCA	2	8	152573	152580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017104	TCAA	2	8	153996	154003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017104	CAAC	2	8	154039	154046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017104	GATA	2	8	157701	157708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017104	ACAG	2	8	161790	161797	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017104	TGCT	2	8	162115	162122	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017104	ATTC	2	8	162664	162671	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017104	CTGT	2	8	164394	164401	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017104	TCGC	2	8	169535	169542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017104	ACGC	2	8	169666	169673	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017104	TCCT	2	8	174473	174480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_017104	CCAG	2	8	174997	175004	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017104	TGTA	2	8	175067	175074	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017104	GATA	2	8	180406	180413	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017104	TGAG	2	8	180543	180550	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017104	GTGA	2	8	180609	180616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017104	ACAG	2	8	182398	182405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017104	ACAG	2	8	184079	184086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017104	GCCA	2	8	189369	189376	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017104	GACA	2	8	189788	189795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017104	CGGG	2	8	190156	190163	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017104	GAAG	2	8	190703	190710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017104	TGGA	2	8	191118	191125	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017104	CAAA	2	8	191381	191388	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017104	TGAC	2	8	191515	191522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017104	TCCA	2	8	191688	191695	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.