MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	384117541
2	NC_017104	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	384117541
3	NC_017104	GTCA	2	8	693	700	25 %	25 %	25 %	25 %	384117542
4	NC_017104	GCTG	2	8	2359	2366	0 %	25 %	50 %	25 %	384117544
5	NC_017104	CTGC	2	8	3728	3735	0 %	25 %	25 %	50 %	384117545
6	NC_017104	CAGC	2	8	4440	4447	25 %	0 %	25 %	50 %	384117546
7	NC_017104	TGAT	2	8	5955	5962	25 %	50 %	25 %	0 %	384117548
8	NC_017104	GCAC	2	8	6255	6262	25 %	0 %	25 %	50 %	384117548
9	NC_017104	CCAT	2	8	7542	7549	25 %	25 %	0 %	50 %	384117549
10	NC_017104	GAAA	2	8	8320	8327	75 %	0 %	25 %	0 %	384117550
11	NC_017104	TTGC	2	8	9119	9126	0 %	50 %	25 %	25 %	384117551
12	NC_017104	TTGG	2	8	9140	9147	0 %	50 %	50 %	0 %	384117551
13	NC_017104	TCTT	2	8	9275	9282	0 %	75 %	0 %	25 %	384117551
14	NC_017104	GTCA	2	8	9672	9679	25 %	25 %	25 %	25 %	384117552
15	NC_017104	CCAG	2	8	10192	10199	25 %	0 %	25 %	50 %	384117552
16	NC_017104	TTCT	2	8	10646	10653	0 %	75 %	0 %	25 %	384117552
17	NC_017104	ATGG	2	8	11231	11238	25 %	25 %	50 %	0 %	384117552
18	NC_017104	CAGC	2	8	11815	11822	25 %	0 %	25 %	50 %	384117552
19	NC_017104	AAAG	2	8	11963	11970	75 %	0 %	25 %	0 %	384117552
20	NC_017104	CTTG	2	8	12327	12334	0 %	50 %	25 %	25 %	384117552
21	NC_017104	TTCG	2	8	12710	12717	0 %	50 %	25 %	25 %	384117552
22	NC_017104	GTCA	2	8	13365	13372	25 %	25 %	25 %	25 %	384117552
23	NC_017104	CAGA	2	8	14375	14382	50 %	0 %	25 %	25 %	384117553
24	NC_017104	TGGC	2	8	14715	14722	0 %	25 %	50 %	25 %	384117553
25	NC_017104	GCAC	2	8	14842	14849	25 %	0 %	25 %	50 %	384117553
26	NC_017104	GACA	2	8	15001	15008	50 %	0 %	25 %	25 %	384117553
27	NC_017104	GAAG	2	8	15019	15026	50 %	0 %	50 %	0 %	384117553
28	NC_017104	CGTC	2	8	15658	15665	0 %	25 %	25 %	50 %	384117553
29	NC_017104	TCGG	2	8	16128	16135	0 %	25 %	50 %	25 %	384117554
30	NC_017104	TTGC	2	8	16434	16441	0 %	50 %	25 %	25 %	384117554
31	NC_017104	CGGG	2	8	16931	16938	0 %	0 %	75 %	25 %	384117555
32	NC_017104	CTTC	2	8	17786	17793	0 %	50 %	0 %	50 %	384117555
33	NC_017104	GACG	2	8	19050	19057	25 %	0 %	50 %	25 %	384117557
34	NC_017104	GCGG	2	8	19858	19865	0 %	0 %	75 %	25 %	384117557
35	NC_017104	GCCA	2	8	19993	20000	25 %	0 %	25 %	50 %	384117557
36	NC_017104	TCTG	2	8	20333	20340	0 %	50 %	25 %	25 %	384117557
37	NC_017104	TCGA	2	8	20720	20727	25 %	25 %	25 %	25 %	384117558
38	NC_017104	GAAG	2	8	20887	20894	50 %	0 %	50 %	0 %	384117558
39	NC_017104	AAGA	2	8	20930	20937	75 %	0 %	25 %	0 %	384117558
40	NC_017104	GAAG	2	8	21315	21322	50 %	0 %	50 %	0 %	384117559
41	NC_017104	TGGA	2	8	21730	21737	25 %	25 %	50 %	0 %	384117560
42	NC_017104	GTCA	2	8	21903	21910	25 %	25 %	25 %	25 %	384117560
43	NC_017104	AGAT	2	8	22711	22718	50 %	25 %	25 %	0 %	384117561
44	NC_017104	GCTC	2	8	23384	23391	0 %	25 %	25 %	50 %	384117562
45	NC_017104	CTAT	2	8	23414	23421	25 %	50 %	0 %	25 %	384117562
46	NC_017104	GCTG	2	8	24522	24529	0 %	25 %	50 %	25 %	384117562
47	NC_017104	AGAA	2	8	25217	25224	75 %	0 %	25 %	0 %	384117562
48	NC_017104	GATA	2	8	25245	25252	50 %	25 %	25 %	0 %	384117562
49	NC_017104	CAAA	2	8	25658	25665	75 %	0 %	0 %	25 %	384117563
50	NC_017104	GGCA	2	8	26428	26435	25 %	0 %	50 %	25 %	384117564
51	NC_017104	TGCG	2	8	26460	26467	0 %	25 %	50 %	25 %	384117564
52	NC_017104	AAGG	2	8	26498	26505	50 %	0 %	50 %	0 %	384117564
53	NC_017104	CCAT	2	8	27184	27191	25 %	25 %	0 %	50 %	384117565
54	NC_017104	CAGA	2	8	28616	28623	50 %	0 %	25 %	25 %	384117567
55	NC_017104	TGGC	2	8	28956	28963	0 %	25 %	50 %	25 %	384117567
56	NC_017104	GCAC	2	8	29083	29090	25 %	0 %	25 %	50 %	384117567
57	NC_017104	GAAG	2	8	29260	29267	50 %	0 %	50 %	0 %	384117567
58	NC_017104	CGTC	2	8	29899	29906	0 %	25 %	25 %	50 %	384117567
59	NC_017104	GTCA	2	8	30517	30524	25 %	25 %	25 %	25 %	384117568
60	NC_017104	ATCT	2	8	31520	31527	25 %	50 %	0 %	25 %	384117569
61	NC_017104	AGGT	2	8	31788	31795	25 %	25 %	50 %	0 %	384117569
62	NC_017104	TTCC	2	8	32012	32019	0 %	50 %	0 %	50 %	384117569
63	NC_017104	AACG	2	8	32353	32360	50 %	0 %	25 %	25 %	384117570
64	NC_017104	GAAC	2	8	32436	32443	50 %	0 %	25 %	25 %	384117570
65	NC_017104	CCAA	2	8	32495	32502	50 %	0 %	0 %	50 %	384117570
66	NC_017104	GGAA	2	8	33174	33181	50 %	0 %	50 %	0 %	384117570
67	NC_017104	TGAT	2	8	34161	34168	25 %	50 %	25 %	0 %	384117571
68	NC_017104	TGGT	2	8	34418	34425	0 %	50 %	50 %	0 %	384117572
69	NC_017104	GCGT	2	8	34822	34829	0 %	25 %	50 %	25 %	384117573
70	NC_017104	ACCC	2	8	35374	35381	25 %	0 %	0 %	75 %	384117573
71	NC_017104	GACA	2	8	36070	36077	50 %	0 %	25 %	25 %	384117573
72	NC_017104	CGTG	2	8	36221	36228	0 %	25 %	50 %	25 %	384117573
73	NC_017104	ATCA	2	8	36240	36247	50 %	25 %	0 %	25 %	384117573
74	NC_017104	CTGG	2	8	36344	36351	0 %	25 %	50 %	25 %	384117573
75	NC_017104	TCAT	2	8	36421	36428	25 %	50 %	0 %	25 %	384117573
76	NC_017104	CGCA	2	8	36698	36705	25 %	0 %	25 %	50 %	384117573
77	NC_017104	CCGT	2	8	36838	36845	0 %	25 %	25 %	50 %	384117573
78	NC_017104	GAGC	2	8	37204	37211	25 %	0 %	50 %	25 %	384117573
79	NC_017104	GAAT	2	8	37365	37372	50 %	25 %	25 %	0 %	384117573
80	NC_017104	CGAT	2	8	37850	37857	25 %	25 %	25 %	25 %	384117574
81	NC_017104	CGGG	2	8	38130	38137	0 %	0 %	75 %	25 %	384117574
82	NC_017104	TTGA	2	8	38457	38464	25 %	50 %	25 %	0 %	384117575
83	NC_017104	ACCC	2	8	39134	39141	25 %	0 %	0 %	75 %	384117576
84	NC_017104	CGCA	2	8	39281	39288	25 %	0 %	25 %	50 %	384117576
85	NC_017104	GGGA	2	8	39904	39911	25 %	0 %	75 %	0 %	384117577
86	NC_017104	CAGA	2	8	40079	40086	50 %	0 %	25 %	25 %	384117578
87	NC_017104	TGGC	2	8	40419	40426	0 %	25 %	50 %	25 %	384117578
88	NC_017104	CAGA	2	8	40598	40605	50 %	0 %	25 %	25 %	384117579
89	NC_017104	TGGC	2	8	40938	40945	0 %	25 %	50 %	25 %	384117579
90	NC_017104	GCAC	2	8	41065	41072	25 %	0 %	25 %	50 %	384117579
91	NC_017104	GAAG	2	8	41242	41249	50 %	0 %	50 %	0 %	384117579
92	NC_017104	CGTC	2	8	41881	41888	0 %	25 %	25 %	50 %	384117579
93	NC_017104	CAGA	2	8	42267	42274	50 %	0 %	25 %	25 %	384117580
94	NC_017104	TGGC	2	8	42607	42614	0 %	25 %	50 %	25 %	384117580
95	NC_017104	GCAC	2	8	42734	42741	25 %	0 %	25 %	50 %	384117580
96	NC_017104	GAAG	2	8	42911	42918	50 %	0 %	50 %	0 %	384117580
97	NC_017104	CGTC	2	8	43550	43557	0 %	25 %	25 %	50 %	384117580
98	NC_017104	TCCG	2	8	44470	44477	0 %	25 %	25 %	50 %	384117581
99	NC_017104	CTGG	2	8	45464	45471	0 %	25 %	50 %	25 %	384117582
100	NC_017104	GGCA	2	8	45526	45533	25 %	0 %	50 %	25 %	384117582
101	NC_017104	ATGG	2	8	45936	45943	25 %	25 %	50 %	0 %	384117583
102	NC_017104	TGCC	2	8	46054	46061	0 %	25 %	25 %	50 %	384117583
103	NC_017104	GCAC	2	8	46432	46439	25 %	0 %	25 %	50 %	384117583
104	NC_017104	GTCT	2	8	46663	46670	0 %	50 %	25 %	25 %	384117583
105	NC_017104	TGGT	2	8	46705	46712	0 %	50 %	50 %	0 %	384117583
106	NC_017104	AATG	2	8	47036	47043	50 %	25 %	25 %	0 %	384117584
107	NC_017104	ACCT	2	8	48160	48167	25 %	25 %	0 %	50 %	384117584
108	NC_017104	ATTG	2	8	48203	48210	25 %	50 %	25 %	0 %	384117584
109	NC_017104	CGTC	2	8	49280	49287	0 %	25 %	25 %	50 %	384117586
110	NC_017104	GCGT	2	8	49444	49451	0 %	25 %	50 %	25 %	384117586
111	NC_017104	GCGT	2	8	50265	50272	0 %	25 %	50 %	25 %	384117587
112	NC_017104	CATC	2	8	50746	50753	25 %	25 %	0 %	50 %	384117587
113	NC_017104	AGCG	2	8	50861	50868	25 %	0 %	50 %	25 %	384117587
114	NC_017104	ACGA	2	8	51266	51273	50 %	0 %	25 %	25 %	384117588
115	NC_017104	GGAC	2	8	51394	51401	25 %	0 %	50 %	25 %	384117588
116	NC_017104	GGTC	2	8	52381	52388	0 %	25 %	50 %	25 %	384117589
117	NC_017104	GAAA	2	8	53019	53026	75 %	0 %	25 %	0 %	384117589
118	NC_017104	TGCC	2	8	54699	54706	0 %	25 %	25 %	50 %	384117590
119	NC_017104	GTGG	2	8	55041	55048	0 %	25 %	75 %	0 %	384117590
120	NC_017104	CCTT	2	8	55054	55061	0 %	50 %	0 %	50 %	384117590
121	NC_017104	CCTT	2	8	55794	55801	0 %	50 %	0 %	50 %	384117591
122	NC_017104	CAGG	2	8	56149	56156	25 %	0 %	50 %	25 %	384117591
123	NC_017104	TGTT	2	8	56979	56986	0 %	75 %	25 %	0 %	384117591
124	NC_017104	TTTC	2	8	57303	57310	0 %	75 %	0 %	25 %	384117592
125	NC_017104	GCGG	2	8	57378	57385	0 %	0 %	75 %	25 %	384117592
126	NC_017104	GGTT	2	8	57413	57420	0 %	50 %	50 %	0 %	384117592
127	NC_017104	TGGA	2	8	58265	58272	25 %	25 %	50 %	0 %	384117593
128	NC_017104	CTCC	2	8	59276	59283	0 %	25 %	0 %	75 %	384117593
129	NC_017104	AGAA	2	8	59740	59747	75 %	0 %	25 %	0 %	384117593
130	NC_017104	CGTC	2	8	60306	60313	0 %	25 %	25 %	50 %	384117593
131	NC_017104	ATGG	2	8	60742	60749	25 %	25 %	50 %	0 %	384117594
132	NC_017104	GGAT	2	8	62166	62173	25 %	25 %	50 %	0 %	384117595
133	NC_017104	CCCG	2	8	62633	62640	0 %	0 %	25 %	75 %	384117595
134	NC_017104	CTGT	2	8	62665	62672	0 %	50 %	25 %	25 %	384117595
135	NC_017104	AATC	2	8	63363	63370	50 %	25 %	0 %	25 %	384117596
136	NC_017104	GACG	2	8	64059	64066	25 %	0 %	50 %	25 %	384117597
137	NC_017104	GGTC	2	8	64329	64336	0 %	25 %	50 %	25 %	384117597
138	NC_017104	CTTC	2	8	64698	64705	0 %	50 %	0 %	50 %	384117597
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408	NC_017104	CCAG	2	8	184818	184825	25 %	0 %	25 %	50 %	384117716
409	NC_017104	ATGG	2	8	185785	185792	25 %	25 %	50 %	0 %	384117716
410	NC_017104	CCGG	2	8	185836	185843	0 %	0 %	50 %	50 %	384117716
411	NC_017104	ACCG	2	8	186256	186263	25 %	0 %	25 %	50 %	384117716
412	NC_017104	CATC	2	8	186282	186289	25 %	25 %	0 %	50 %	384117716
413	NC_017104	CCGC	2	8	186474	186481	0 %	0 %	25 %	75 %	384117716
414	NC_017104	GGCC	2	8	186939	186946	0 %	0 %	50 %	50 %	384117716
415	NC_017104	CTTC	2	8	187634	187641	0 %	50 %	0 %	50 %	384117717
416	NC_017104	CCAA	2	8	188426	188433	50 %	0 %	0 %	50 %	384117717
417	NC_017104	GATC	2	8	190325	190332	25 %	25 %	25 %	25 %	384117718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.