MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 306

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384117541
2	NC_017104	GC	3	6	1642	1647	0 %	0 %	50 %	50 %	384117544
3	NC_017104	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	384117545
4	NC_017104	TG	3	6	3679	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	384117545
5	NC_017104	TG	3	6	3870	3875	0 %	50 %	50 %	0 %	384117545
6	NC_017104	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	384117546
7	NC_017104	TA	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384117548
8	NC_017104	CG	3	6	5616	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	384117548
9	NC_017104	TG	3	6	6660	6665	0 %	50 %	50 %	0 %	384117548
10	NC_017104	AG	3	6	6796	6801	50 %	0 %	50 %	0 %	384117548
11	NC_017104	TG	3	6	7721	7726	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017104	GT	3	6	7932	7937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017104	GA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017104	GA	3	6	10492	10497	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
15	NC_017104	CG	3	6	10969	10974	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
16	NC_017104	CG	3	6	12404	12409	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
17	NC_017104	AG	3	6	12499	12504	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
18	NC_017104	TC	3	6	12843	12848	0 %	50 %	0 %	50 %	384117552
19	NC_017104	CG	3	6	13042	13047	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
20	NC_017104	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
21	NC_017104	GC	3	6	15254	15259	0 %	0 %	50 %	50 %	384117553
22	NC_017104	GC	3	6	15958	15963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017104	CG	3	6	16079	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	384117554
24	NC_017104	AC	3	6	17325	17330	50 %	0 %	0 %	50 %	384117555
25	NC_017104	CA	3	6	18308	18313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017104	CG	3	6	19455	19460	0 %	0 %	50 %	50 %	384117557
27	NC_017104	GC	3	6	19868	19873	0 %	0 %	50 %	50 %	384117557
28	NC_017104	AG	4	8	20557	20564	50 %	0 %	50 %	0 %	384117558
29	NC_017104	TC	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	384117558
30	NC_017104	AC	3	6	20787	20792	50 %	0 %	0 %	50 %	384117558
31	NC_017104	GC	3	6	21198	21203	0 %	0 %	50 %	50 %	384117559
32	NC_017104	TC	3	6	22255	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	384117561
33	NC_017104	GA	4	8	22334	22341	50 %	0 %	50 %	0 %	384117561
34	NC_017104	CT	4	8	24088	24095	0 %	50 %	0 %	50 %	384117562
35	NC_017104	GC	3	6	24239	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	384117562
36	NC_017104	GT	3	6	26885	26890	0 %	50 %	50 %	0 %	384117565
37	NC_017104	AG	3	6	27127	27132	50 %	0 %	50 %	0 %	384117565
38	NC_017104	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	384117566
39	NC_017104	GA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	50 %	0 %	384117566
40	NC_017104	GC	3	6	29495	29500	0 %	0 %	50 %	50 %	384117567
41	NC_017104	CA	3	6	30982	30987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017104	GA	3	6	31027	31032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017104	CA	3	6	31304	31309	50 %	0 %	0 %	50 %	384117569
44	NC_017104	AG	3	6	31555	31560	50 %	0 %	50 %	0 %	384117569
45	NC_017104	TC	3	6	32080	32085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017104	GT	3	6	32168	32173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017104	CT	3	6	32191	32196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017104	AC	3	6	32382	32387	50 %	0 %	0 %	50 %	384117570
49	NC_017104	GA	3	6	34545	34550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017104	AG	3	6	35004	35009	50 %	0 %	50 %	0 %	384117573
51	NC_017104	GC	3	6	35084	35089	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
52	NC_017104	AC	3	6	35107	35112	50 %	0 %	0 %	50 %	384117573
53	NC_017104	CG	3	6	35285	35290	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
54	NC_017104	CG	3	6	36137	36142	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
55	NC_017104	GT	3	6	36145	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	384117573
56	NC_017104	CA	3	6	36677	36682	50 %	0 %	0 %	50 %	384117573
57	NC_017104	CT	3	6	37468	37473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017104	CA	3	6	38310	38315	50 %	0 %	0 %	50 %	384117574
59	NC_017104	CA	3	6	38631	38636	50 %	0 %	0 %	50 %	384117575
60	NC_017104	GC	3	6	41477	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	384117579
61	NC_017104	GC	3	6	43146	43151	0 %	0 %	50 %	50 %	384117580
62	NC_017104	CA	3	6	44651	44656	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017104	TA	3	6	44836	44841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017104	AT	3	6	44950	44955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017104	AC	3	6	45495	45500	50 %	0 %	0 %	50 %	384117582
66	NC_017104	GC	3	6	46538	46543	0 %	0 %	50 %	50 %	384117583
67	NC_017104	CA	3	6	47460	47465	50 %	0 %	0 %	50 %	384117584
68	NC_017104	CG	3	6	48000	48005	0 %	0 %	50 %	50 %	384117584
69	NC_017104	GT	3	6	48678	48683	0 %	50 %	50 %	0 %	384117585
70	NC_017104	TG	3	6	48991	48996	0 %	50 %	50 %	0 %	384117586
71	NC_017104	CT	3	6	49129	49134	0 %	50 %	0 %	50 %	384117586
72	NC_017104	GA	3	6	49648	49653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017104	AG	3	6	49811	49816	50 %	0 %	50 %	0 %	384117587
74	NC_017104	AC	3	6	50502	50507	50 %	0 %	0 %	50 %	384117587
75	NC_017104	GT	3	6	51427	51432	0 %	50 %	50 %	0 %	384117588
76	NC_017104	CA	3	6	53220	53225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017104	AG	3	6	54255	54260	50 %	0 %	50 %	0 %	384117590
78	NC_017104	CG	3	6	55740	55745	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
79	NC_017104	CG	3	6	56078	56083	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
80	NC_017104	CG	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
81	NC_017104	CA	3	6	59419	59424	50 %	0 %	0 %	50 %	384117593
82	NC_017104	GC	3	6	59990	59995	0 %	0 %	50 %	50 %	384117593
83	NC_017104	CT	3	6	60161	60166	0 %	50 %	0 %	50 %	384117593
84	NC_017104	TC	3	6	60453	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	384117593
85	NC_017104	CG	3	6	60900	60905	0 %	0 %	50 %	50 %	384117594
86	NC_017104	CA	3	6	61269	61274	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017104	CA	3	6	61448	61453	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017104	GC	3	6	61732	61737	0 %	0 %	50 %	50 %	384117595
89	NC_017104	CA	3	6	61763	61768	50 %	0 %	0 %	50 %	384117595
90	NC_017104	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	384117595
91	NC_017104	CT	4	8	61813	61820	0 %	50 %	0 %	50 %	384117595
92	NC_017104	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	384117596
93	NC_017104	AC	3	6	63770	63775	50 %	0 %	0 %	50 %	384117596
94	NC_017104	CG	3	6	64464	64469	0 %	0 %	50 %	50 %	384117597
95	NC_017104	AT	3	6	65623	65628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017104	TC	3	6	66316	66321	0 %	50 %	0 %	50 %	384117598
97	NC_017104	CA	3	6	67278	67283	50 %	0 %	0 %	50 %	384117599
98	NC_017104	AG	3	6	67556	67561	50 %	0 %	50 %	0 %	384117599
99	NC_017104	AT	3	6	67803	67808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017104	TA	4	8	68010	68017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017104	TA	3	6	68064	68069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017104	GA	3	6	68082	68087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017104	AC	3	6	68103	68108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017104	AT	3	6	68312	68317	50 %	50 %	0 %	0 %	384117600
105	NC_017104	CT	3	6	68385	68390	0 %	50 %	0 %	50 %	384117600
106	NC_017104	TC	3	6	69102	69107	0 %	50 %	0 %	50 %	384117600
107	NC_017104	TA	3	6	69845	69850	50 %	50 %	0 %	0 %	384117600
108	NC_017104	AG	3	6	70827	70832	50 %	0 %	50 %	0 %	384117601
109	NC_017104	GC	3	6	70938	70943	0 %	0 %	50 %	50 %	384117601
110	NC_017104	GC	3	6	71523	71528	0 %	0 %	50 %	50 %	384117601
111	NC_017104	TG	3	6	71879	71884	0 %	50 %	50 %	0 %	384117602
112	NC_017104	GA	3	6	72023	72028	50 %	0 %	50 %	0 %	384117602
113	NC_017104	GC	3	6	73175	73180	0 %	0 %	50 %	50 %	384117604
114	NC_017104	CT	4	8	74621	74628	0 %	50 %	0 %	50 %	384117605
115	NC_017104	TC	3	6	74691	74696	0 %	50 %	0 %	50 %	384117605
116	NC_017104	CG	3	6	76032	76037	0 %	0 %	50 %	50 %	384117606
117	NC_017104	TG	3	6	77159	77164	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017104	CG	4	8	80190	80197	0 %	0 %	50 %	50 %	384117608
119	NC_017104	GA	3	6	80563	80568	50 %	0 %	50 %	0 %	384117608
120	NC_017104	GC	3	6	80805	80810	0 %	0 %	50 %	50 %	384117608
121	NC_017104	CT	3	6	81001	81006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017104	AG	3	6	81022	81027	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017104	CA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	0 %	50 %	384117610
124	NC_017104	CT	3	6	83116	83121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017104	CT	3	6	83161	83166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017104	TG	3	6	83334	83339	0 %	50 %	50 %	0 %	384117611
127	NC_017104	CT	3	6	84737	84742	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017104	CA	3	6	85579	85584	50 %	0 %	0 %	50 %	384117613
129	NC_017104	CT	3	6	86900	86905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017104	CA	3	6	87172	87177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017104	GT	3	6	87919	87924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017104	AG	3	6	87932	87937	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017104	CG	3	6	89422	89427	0 %	0 %	50 %	50 %	384117616
134	NC_017104	GC	3	6	89835	89840	0 %	0 %	50 %	50 %	384117616
135	NC_017104	AG	3	6	90474	90479	50 %	0 %	50 %	0 %	384117617
136	NC_017104	AG	4	8	90774	90781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017104	TC	3	6	90820	90825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017104	AT	3	6	90837	90842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017104	AT	3	6	90891	90896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017104	AC	3	6	91248	91253	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017104	AC	3	6	92538	92543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017104	GC	3	6	94373	94378	0 %	0 %	50 %	50 %	384117621
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145	NC_017104	GA	3	6	96852	96857	50 %	0 %	50 %	0 %	384117624
146	NC_017104	TG	3	6	97021	97026	0 %	50 %	50 %	0 %	384117624
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305	NC_017104	AG	3	6	189517	189522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.