MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-01-42C plasmid pAPA42C_011

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017104	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384117541
2	NC_017104	GC	3	6	1642	1647	0 %	0 %	50 %	50 %	384117544
3	NC_017104	CG	3	6	3554	3559	0 %	0 %	50 %	50 %	384117545
4	NC_017104	TG	3	6	3679	3684	0 %	50 %	50 %	0 %	384117545
5	NC_017104	TG	3	6	3870	3875	0 %	50 %	50 %	0 %	384117545
6	NC_017104	GC	3	6	4264	4269	0 %	0 %	50 %	50 %	384117546
7	NC_017104	TA	3	6	5601	5606	50 %	50 %	0 %	0 %	384117548
8	NC_017104	CG	3	6	5616	5621	0 %	0 %	50 %	50 %	384117548
9	NC_017104	TG	3	6	6660	6665	0 %	50 %	50 %	0 %	384117548
10	NC_017104	AG	3	6	6796	6801	50 %	0 %	50 %	0 %	384117548
11	NC_017104	GA	3	6	10492	10497	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
12	NC_017104	CG	3	6	10969	10974	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
13	NC_017104	CG	3	6	12404	12409	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
14	NC_017104	AG	3	6	12499	12504	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
15	NC_017104	TC	3	6	12843	12848	0 %	50 %	0 %	50 %	384117552
16	NC_017104	CG	3	6	13042	13047	0 %	0 %	50 %	50 %	384117552
17	NC_017104	AG	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	384117552
18	NC_017104	GC	3	6	15254	15259	0 %	0 %	50 %	50 %	384117553
19	NC_017104	CG	3	6	16079	16084	0 %	0 %	50 %	50 %	384117554
20	NC_017104	AC	3	6	17325	17330	50 %	0 %	0 %	50 %	384117555
21	NC_017104	CG	3	6	19455	19460	0 %	0 %	50 %	50 %	384117557
22	NC_017104	GC	3	6	19868	19873	0 %	0 %	50 %	50 %	384117557
23	NC_017104	AG	4	8	20557	20564	50 %	0 %	50 %	0 %	384117558
24	NC_017104	TC	3	6	20622	20627	0 %	50 %	0 %	50 %	384117558
25	NC_017104	AC	3	6	20787	20792	50 %	0 %	0 %	50 %	384117558
26	NC_017104	GC	3	6	21198	21203	0 %	0 %	50 %	50 %	384117559
27	NC_017104	TC	3	6	22255	22260	0 %	50 %	0 %	50 %	384117561
28	NC_017104	GA	4	8	22334	22341	50 %	0 %	50 %	0 %	384117561
29	NC_017104	CT	4	8	24088	24095	0 %	50 %	0 %	50 %	384117562
30	NC_017104	GC	3	6	24239	24244	0 %	0 %	50 %	50 %	384117562
31	NC_017104	GT	3	6	26885	26890	0 %	50 %	50 %	0 %	384117565
32	NC_017104	AG	3	6	27127	27132	50 %	0 %	50 %	0 %	384117565
33	NC_017104	CT	3	6	27964	27969	0 %	50 %	0 %	50 %	384117566
34	NC_017104	GA	3	6	27991	27996	50 %	0 %	50 %	0 %	384117566
35	NC_017104	GC	3	6	29495	29500	0 %	0 %	50 %	50 %	384117567
36	NC_017104	CA	3	6	31304	31309	50 %	0 %	0 %	50 %	384117569
37	NC_017104	AG	3	6	31555	31560	50 %	0 %	50 %	0 %	384117569
38	NC_017104	AC	3	6	32382	32387	50 %	0 %	0 %	50 %	384117570
39	NC_017104	AG	3	6	35004	35009	50 %	0 %	50 %	0 %	384117573
40	NC_017104	GC	3	6	35084	35089	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
41	NC_017104	AC	3	6	35107	35112	50 %	0 %	0 %	50 %	384117573
42	NC_017104	CG	3	6	35285	35290	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
43	NC_017104	CG	3	6	36137	36142	0 %	0 %	50 %	50 %	384117573
44	NC_017104	GT	3	6	36145	36150	0 %	50 %	50 %	0 %	384117573
45	NC_017104	CA	3	6	36677	36682	50 %	0 %	0 %	50 %	384117573
46	NC_017104	CA	3	6	38310	38315	50 %	0 %	0 %	50 %	384117574
47	NC_017104	CA	3	6	38631	38636	50 %	0 %	0 %	50 %	384117575
48	NC_017104	GC	3	6	41477	41482	0 %	0 %	50 %	50 %	384117579
49	NC_017104	GC	3	6	43146	43151	0 %	0 %	50 %	50 %	384117580
50	NC_017104	AC	3	6	45495	45500	50 %	0 %	0 %	50 %	384117582
51	NC_017104	GC	3	6	46538	46543	0 %	0 %	50 %	50 %	384117583
52	NC_017104	CA	3	6	47460	47465	50 %	0 %	0 %	50 %	384117584
53	NC_017104	CG	3	6	48000	48005	0 %	0 %	50 %	50 %	384117584
54	NC_017104	GT	3	6	48678	48683	0 %	50 %	50 %	0 %	384117585
55	NC_017104	TG	3	6	48991	48996	0 %	50 %	50 %	0 %	384117586
56	NC_017104	CT	3	6	49129	49134	0 %	50 %	0 %	50 %	384117586
57	NC_017104	AG	3	6	49811	49816	50 %	0 %	50 %	0 %	384117587
58	NC_017104	AC	3	6	50502	50507	50 %	0 %	0 %	50 %	384117587
59	NC_017104	GT	3	6	51427	51432	0 %	50 %	50 %	0 %	384117588
60	NC_017104	AG	3	6	54255	54260	50 %	0 %	50 %	0 %	384117590
61	NC_017104	CG	3	6	55740	55745	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
62	NC_017104	CG	3	6	56078	56083	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
63	NC_017104	CG	3	6	56821	56826	0 %	0 %	50 %	50 %	384117591
64	NC_017104	CA	3	6	59419	59424	50 %	0 %	0 %	50 %	384117593
65	NC_017104	GC	3	6	59990	59995	0 %	0 %	50 %	50 %	384117593
66	NC_017104	CT	3	6	60161	60166	0 %	50 %	0 %	50 %	384117593
67	NC_017104	TC	3	6	60453	60458	0 %	50 %	0 %	50 %	384117593
68	NC_017104	CG	3	6	60900	60905	0 %	0 %	50 %	50 %	384117594
69	NC_017104	GC	3	6	61732	61737	0 %	0 %	50 %	50 %	384117595
70	NC_017104	CA	3	6	61763	61768	50 %	0 %	0 %	50 %	384117595
71	NC_017104	GC	3	6	61787	61792	0 %	0 %	50 %	50 %	384117595
72	NC_017104	CT	4	8	61813	61820	0 %	50 %	0 %	50 %	384117595
73	NC_017104	AC	3	6	63075	63080	50 %	0 %	0 %	50 %	384117596
74	NC_017104	AC	3	6	63770	63775	50 %	0 %	0 %	50 %	384117596
75	NC_017104	CG	3	6	64464	64469	0 %	0 %	50 %	50 %	384117597
76	NC_017104	TC	3	6	66316	66321	0 %	50 %	0 %	50 %	384117598
77	NC_017104	CA	3	6	67278	67283	50 %	0 %	0 %	50 %	384117599
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80	NC_017104	CT	3	6	68385	68390	0 %	50 %	0 %	50 %	384117600
81	NC_017104	TC	3	6	69102	69107	0 %	50 %	0 %	50 %	384117600
82	NC_017104	TA	3	6	69845	69850	50 %	50 %	0 %	0 %	384117600
83	NC_017104	AG	3	6	70827	70832	50 %	0 %	50 %	0 %	384117601
84	NC_017104	GC	3	6	70938	70943	0 %	0 %	50 %	50 %	384117601
85	NC_017104	GC	3	6	71523	71528	0 %	0 %	50 %	50 %	384117601
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87	NC_017104	GA	3	6	72023	72028	50 %	0 %	50 %	0 %	384117602
88	NC_017104	GC	3	6	73175	73180	0 %	0 %	50 %	50 %	384117604
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90	NC_017104	TC	3	6	74691	74696	0 %	50 %	0 %	50 %	384117605
91	NC_017104	CG	3	6	76032	76037	0 %	0 %	50 %	50 %	384117606
92	NC_017104	CG	4	8	80190	80197	0 %	0 %	50 %	50 %	384117608
93	NC_017104	GA	3	6	80563	80568	50 %	0 %	50 %	0 %	384117608
94	NC_017104	GC	3	6	80805	80810	0 %	0 %	50 %	50 %	384117608
95	NC_017104	CA	3	6	82966	82971	50 %	0 %	0 %	50 %	384117610
96	NC_017104	TG	3	6	83334	83339	0 %	50 %	50 %	0 %	384117611
97	NC_017104	CA	3	6	85579	85584	50 %	0 %	0 %	50 %	384117613
98	NC_017104	CG	3	6	89422	89427	0 %	0 %	50 %	50 %	384117616
99	NC_017104	GC	3	6	89835	89840	0 %	0 %	50 %	50 %	384117616
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102	NC_017104	GC	3	6	95994	95999	0 %	0 %	50 %	50 %	384117623
103	NC_017104	GA	3	6	96522	96527	50 %	0 %	50 %	0 %	384117624
104	NC_017104	GA	3	6	96852	96857	50 %	0 %	50 %	0 %	384117624
105	NC_017104	TG	3	6	97021	97026	0 %	50 %	50 %	0 %	384117624
106	NC_017104	AT	3	6	97613	97618	50 %	50 %	0 %	0 %	384117624
107	NC_017104	GC	3	6	98303	98308	0 %	0 %	50 %	50 %	384117625
108	NC_017104	CT	3	6	98489	98494	0 %	50 %	0 %	50 %	384117625
109	NC_017104	GA	3	6	98517	98522	50 %	0 %	50 %	0 %	384117626
110	NC_017104	TG	3	6	98562	98567	0 %	50 %	50 %	0 %	384117626
111	NC_017104	CT	3	6	99457	99462	0 %	50 %	0 %	50 %	384117626
112	NC_017104	GC	3	6	101061	101066	0 %	0 %	50 %	50 %	384117627
113	NC_017104	GC	3	6	101733	101738	0 %	0 %	50 %	50 %	384117627
114	NC_017104	GC	3	6	102186	102191	0 %	0 %	50 %	50 %	384117627
115	NC_017104	TG	3	6	103270	103275	0 %	50 %	50 %	0 %	384117629
116	NC_017104	GC	3	6	106075	106080	0 %	0 %	50 %	50 %	384117632
117	NC_017104	AG	3	6	106188	106193	50 %	0 %	50 %	0 %	384117632
118	NC_017104	CT	3	6	107082	107087	0 %	50 %	0 %	50 %	384117633
119	NC_017104	TG	3	6	107449	107454	0 %	50 %	50 %	0 %	384117634
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123	NC_017104	GC	3	6	110647	110652	0 %	0 %	50 %	50 %	384117637
124	NC_017104	CA	3	6	110725	110730	50 %	0 %	0 %	50 %	384117637
125	NC_017104	TC	3	6	110930	110935	0 %	50 %	0 %	50 %	384117638
126	NC_017104	TC	3	6	113145	113150	0 %	50 %	0 %	50 %	384117641
127	NC_017104	AC	3	6	114314	114319	50 %	0 %	0 %	50 %	384117642
128	NC_017104	TC	3	6	115664	115669	0 %	50 %	0 %	50 %	384117643
129	NC_017104	GA	3	6	116146	116151	50 %	0 %	50 %	0 %	384117643
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131	NC_017104	CT	3	6	117031	117036	0 %	50 %	0 %	50 %	384117643
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138	NC_017104	CT	3	6	120741	120746	0 %	50 %	0 %	50 %	384117647
139	NC_017104	CA	3	6	120918	120923	50 %	0 %	0 %	50 %	384117647
140	NC_017104	CG	3	6	121485	121490	0 %	0 %	50 %	50 %	384117648
141	NC_017104	CA	3	6	122305	122310	50 %	0 %	0 %	50 %	384117649
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.