MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-010

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017101	GGCGCG	2	12	1810	1821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384049360
2	NC_017101	GGCTGG	2	12	1834	1845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384049360
3	NC_017101	GATAAT	2	12	7675	7686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017101	ATTGTC	2	12	12564	12575	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384049368
5	NC_017101	CCTGTC	2	12	12584	12595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384049368
6	NC_017101	TGGATG	2	12	14493	14504	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049369
7	NC_017101	CATCCA	2	12	19467	19478	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049373
8	NC_017101	GGAACT	2	12	21233	21244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384049376
9	NC_017101	CATGCT	2	12	24243	24254	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384049378
10	NC_017101	TAAGGG	2	12	27320	27331	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384049381
11	NC_017101	TGGATG	2	12	28734	28745	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049383
12	NC_017101	AACAAG	2	12	29979	29990	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384049384
13	NC_017101	GTCAGG	2	12	30748	30759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017101	TCCTGA	2	12	39121	39132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384049393
15	NC_017101	TGGATG	2	12	40716	40727	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049395
16	NC_017101	TGGATG	2	12	42385	42396	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049396
17	NC_017101	GTGCTT	2	12	45366	45377	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384049399
18	NC_017101	GGCATC	2	12	50296	50307	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384049403
19	NC_017101	CGTCAG	2	12	52349	52360	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384049405
20	NC_017101	TTCGGC	2	12	52901	52912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017101	GGCGTG	2	12	61662	61673	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384049411
22	NC_017101	CATCCA	2	12	64476	64487	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049413
23	NC_017101	ATTTTA	2	12	67767	67778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017101	CATTAT	2	12	69429	69440	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384049416
25	NC_017101	GAGGAC	2	12	73109	73120	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384049420
26	NC_017101	CATCCA	2	12	76044	76055	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049422
27	NC_017101	AACCAG	2	12	77379	77390	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384049423
28	NC_017101	CATCCA	2	12	89434	89445	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049432
29	NC_017101	TGGATG	2	12	93612	93623	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049437
30	NC_017101	GAATAA	2	12	96102	96113	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384049440
31	NC_017101	TCTTAA	2	12	96355	96366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384049440
32	NC_017101	TTTGCC	2	12	102638	102649	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384049445
33	NC_017101	GGCATC	2	12	108418	108429	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384049451
34	NC_017101	CAGCCG	2	12	109468	109479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384049452
35	NC_017101	CTTCCT	2	12	113562	113573	0 %	50 %	0 %	50 %	384049457
36	NC_017101	AGCGGA	2	12	114298	114309	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384049459
37	NC_017101	GGGCCA	2	12	117318	117329	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384049460
38	NC_017101	TGCAGG	2	12	119871	119882	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384049462
39	NC_017101	CCAAAA	2	12	124540	124551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017101	CATCCA	2	12	130544	130555	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049475
41	NC_017101	CCCCCT	2	12	131984	131995	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	384049477
42	NC_017101	CCAGAA	2	12	138846	138857	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384049486
43	NC_017101	GAGGAA	2	12	139891	139902	50 %	0 %	50 %	0 %	384049487
44	NC_017101	CATCCA	2	12	141646	141657	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049488
45	NC_017101	TGGATG	2	12	145067	145078	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049491
46	NC_017101	CCCACG	2	12	148847	148858	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384049492
47	NC_017101	GATGCC	2	12	151115	151126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384049496
48	NC_017101	CTTCCT	2	12	153522	153533	0 %	50 %	0 %	50 %	384049497
49	NC_017101	TGGATG	2	12	160521	160532	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049510
50	NC_017101	GATGCC	2	12	163524	163535	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384049513
51	NC_017101	CATCCA	2	12	164915	164926	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384049514
52	NC_017101	GCCATC	2	12	171296	171307	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384049519
53	NC_017101	CCCAAA	2	12	174921	174932	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017101	TGGATG	2	12	181129	181140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049529
55	NC_017101	TGGATG	2	12	182810	182821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384049530
56	NC_017101	TCCAGC	2	12	185807	185818	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384049532
57	NC_017101	ATTCTG	2	12	186617	186628	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384049532
58	NC_017101	ATACCG	2	12	187931	187942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384049533
59	NC_017101	TCAGTT	2	12	188098	188109	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384049533
60	NC_017101	TATCGC	2	12	189545	189556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.