MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-010

Total Repeats: 145

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017101	GCTGG	2	10	272	281	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017101	GGAAA	2	10	1869	1878	60 %	0 %	40 %	0 %	384049360
3	NC_017101	GGCTC	2	10	2132	2141	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017101	TGCCA	2	10	3100	3109	20 %	20 %	20 %	40 %	384049361
5	NC_017101	CGATC	2	10	3215	3224	20 %	20 %	20 %	40 %	384049361
6	NC_017101	GAGCT	2	10	3806	3815	20 %	20 %	40 %	20 %	384049362
7	NC_017101	CTGTG	2	10	5534	5543	0 %	40 %	40 %	20 %	384049364
8	NC_017101	ATGTG	2	10	7497	7506	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017101	ATCCG	2	10	8722	8731	20 %	20 %	20 %	40 %	384049367
10	NC_017101	AAGCC	2	10	9063	9072	40 %	0 %	20 %	40 %	384049368
11	NC_017101	TACGC	2	10	11257	11266	20 %	20 %	20 %	40 %	384049368
12	NC_017101	GGACA	2	10	18664	18673	40 %	0 %	40 %	20 %	384049373
13	NC_017101	TTTCT	2	10	19997	20006	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017101	ACCAC	2	10	20504	20513	40 %	0 %	0 %	60 %	384049374
15	NC_017101	CCAGC	2	10	20973	20982	20 %	0 %	20 %	60 %	384049376
16	NC_017101	CTGGC	2	10	22804	22813	0 %	20 %	40 %	40 %	384049378
17	NC_017101	TGCAA	2	10	23370	23379	40 %	20 %	20 %	20 %	384049378
18	NC_017101	CTGGT	2	10	23661	23670	0 %	40 %	40 %	20 %	384049378
19	NC_017101	AGAAA	2	10	28206	28215	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017101	TGTCC	2	10	29539	29548	0 %	40 %	20 %	40 %	384049383
21	NC_017101	CACCT	2	10	32507	32516	20 %	20 %	0 %	60 %	384049386
22	NC_017101	GCTCC	2	10	34090	34099	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017101	GCAGG	2	10	36224	36233	20 %	0 %	60 %	20 %	384049389
24	NC_017101	GCTGT	2	10	37273	37282	0 %	40 %	40 %	20 %	384049390
25	NC_017101	CATGC	2	10	39458	39467	20 %	20 %	20 %	40 %	384049393
26	NC_017101	AGAAA	2	10	40188	40197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017101	TGTCC	2	10	41521	41530	0 %	40 %	20 %	40 %	384049395
28	NC_017101	AGAAA	2	10	41857	41866	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017101	TGTCC	2	10	43190	43199	0 %	40 %	20 %	40 %	384049396
30	NC_017101	ATGGC	2	10	45892	45901	20 %	20 %	40 %	20 %	384049399
31	NC_017101	CCTGA	2	10	46426	46435	20 %	20 %	20 %	40 %	384049399
32	NC_017101	TTATT	2	10	50878	50887	20 %	80 %	0 %	0 %	384049404
33	NC_017101	CGTTC	2	10	51425	51434	0 %	40 %	20 %	40 %	384049405
34	NC_017101	CGGTC	2	10	53171	53180	0 %	20 %	40 %	40 %	384049406
35	NC_017101	GAAGC	2	10	56315	56324	40 %	0 %	40 %	20 %	384049407
36	NC_017101	TCAAG	2	10	57353	57362	40 %	20 %	20 %	20 %	384049408
37	NC_017101	CAGGA	2	10	58473	58482	40 %	0 %	40 %	20 %	384049409
38	NC_017101	CGGAC	2	10	59327	59336	20 %	0 %	40 %	40 %	384049409
39	NC_017101	CACAT	2	10	62762	62771	40 %	20 %	0 %	40 %	384049412
40	NC_017101	ACACA	2	10	65526	65535	60 %	0 %	0 %	40 %	384049414
41	NC_017101	TTACA	2	10	68924	68933	40 %	40 %	0 %	20 %	384049416
42	NC_017101	ACTGT	2	10	69029	69038	20 %	40 %	20 %	20 %	384049416
43	NC_017101	CAACG	2	10	70441	70450	40 %	0 %	20 %	40 %	384049417
44	NC_017101	CCGTC	2	10	71426	71435	0 %	20 %	20 %	60 %	384049418
45	NC_017101	AGCAG	2	10	73839	73848	40 %	0 %	40 %	20 %	384049420
46	NC_017101	GGACA	2	10	75241	75250	40 %	0 %	40 %	20 %	384049422
47	NC_017101	CACAC	2	10	77055	77064	40 %	0 %	0 %	60 %	384049423
48	NC_017101	ACGCC	2	10	81206	81215	20 %	0 %	20 %	60 %	384049425
49	NC_017101	CTTGC	2	10	81753	81762	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017101	CCGCG	2	10	82121	82130	0 %	0 %	40 %	60 %	384049426
51	NC_017101	GCACA	2	10	83016	83025	40 %	0 %	20 %	40 %	384049427
52	NC_017101	TTTCT	2	10	83703	83712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017101	GCTGT	2	10	84542	84551	0 %	40 %	40 %	20 %	384049429
54	NC_017101	CCAGA	2	10	86644	86653	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_017101	CCGAG	2	10	86957	86966	20 %	0 %	40 %	40 %	384049431
56	NC_017101	GGACA	2	10	88631	88640	40 %	0 %	40 %	20 %	384049432
57	NC_017101	TTTCT	2	10	89964	89973	0 %	80 %	0 %	20 %	384049433
58	NC_017101	TCACT	2	10	91086	91095	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017101	AATCA	2	10	91117	91126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017101	CTGAG	2	10	91134	91143	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017101	TCCTC	2	10	92018	92027	0 %	40 %	0 %	60 %	384049435
62	NC_017101	TTTAC	2	10	92328	92337	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017101	TGTCC	2	10	94417	94426	0 %	40 %	20 %	40 %	384049437
64	NC_017101	ATGCA	2	10	97985	97994	40 %	20 %	20 %	20 %	384049441
65	NC_017101	TTATG	2	10	99884	99893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017101	CCTGA	2	10	100412	100421	20 %	20 %	20 %	40 %	384049443
67	NC_017101	CATTG	2	10	100452	100461	20 %	40 %	20 %	20 %	384049443
68	NC_017101	CAAGG	2	10	101510	101519	40 %	0 %	40 %	20 %	384049443
69	NC_017101	CTGGG	2	10	101756	101765	0 %	20 %	60 %	20 %	384049443
70	NC_017101	AGGGG	2	10	102000	102009	20 %	0 %	80 %	0 %	384049443
71	NC_017101	GACAT	2	10	103750	103759	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017101	CTATT	2	10	105164	105173	20 %	60 %	0 %	20 %	384049447
73	NC_017101	GTATT	2	10	111048	111057	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017101	GTCAC	2	10	114532	114541	20 %	20 %	20 %	40 %	384049459
75	NC_017101	TTGGA	2	10	117884	117893	20 %	40 %	40 %	0 %	384049460
76	NC_017101	CGGTT	2	10	118992	119001	0 %	40 %	40 %	20 %	384049461
77	NC_017101	CGTCC	2	10	125739	125748	0 %	20 %	20 %	60 %	384049469
78	NC_017101	TTTCA	2	10	125980	125989	20 %	60 %	0 %	20 %	384049469
79	NC_017101	TTATT	2	10	128712	128721	20 %	80 %	0 %	0 %	384049473
80	NC_017101	GGACA	2	10	129741	129750	40 %	0 %	40 %	20 %	384049475
81	NC_017101	TTTCT	2	10	131074	131083	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017101	GCCCT	2	10	131732	131741	0 %	20 %	20 %	60 %	384049477
83	NC_017101	GCCAC	2	10	133334	133343	20 %	0 %	20 %	60 %	384049479
84	NC_017101	GCTGG	2	10	133843	133852	0 %	20 %	60 %	20 %	384049479
85	NC_017101	AGCGA	2	10	134278	134287	40 %	0 %	40 %	20 %	384049481
86	NC_017101	ATAGT	2	10	135483	135492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017101	TCCGT	2	10	136931	136940	0 %	40 %	20 %	40 %	384049485
88	NC_017101	CTGCG	2	10	137659	137668	0 %	20 %	40 %	40 %	384049485
89	NC_017101	TCGCG	2	10	138194	138203	0 %	20 %	40 %	40 %	384049485
90	NC_017101	CGTCC	2	10	140341	140350	0 %	20 %	20 %	60 %	384049487
91	NC_017101	GGACA	2	10	140843	140852	40 %	0 %	40 %	20 %	384049488
92	NC_017101	TTTCT	2	10	142176	142185	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017101	CATGG	2	10	142960	142969	20 %	20 %	40 %	20 %	384049490
94	NC_017101	AATTA	2	10	143125	143134	60 %	40 %	0 %	0 %	384049490
95	NC_017101	CTTTT	2	10	144088	144097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017101	ATGAC	2	10	144228	144237	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017101	AGAAA	2	10	144539	144548	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017101	TGTCC	2	10	145872	145881	0 %	40 %	20 %	40 %	384049491
99	NC_017101	TGATC	2	10	146221	146230	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017101	CAGAT	2	10	146425	146434	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017101	ACCGT	2	10	146974	146983	20 %	20 %	20 %	40 %	384049492
102	NC_017101	GATCA	2	10	147606	147615	40 %	20 %	20 %	20 %	384049492
103	NC_017101	TGGGG	2	10	149552	149561	0 %	20 %	80 %	0 %	384049494
104	NC_017101	GGCAC	2	10	151674	151683	20 %	0 %	40 %	40 %	384049496
105	NC_017101	AAACA	2	10	153828	153837	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_017101	CTTCC	2	10	154431	154440	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017101	CTGCC	2	10	156003	156012	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017101	CCAAC	2	10	157572	157581	40 %	0 %	0 %	60 %	384049503
109	NC_017101	CTGCC	2	10	158689	158698	0 %	20 %	20 %	60 %	384049507
110	NC_017101	GCCAT	2	10	159041	159050	20 %	20 %	20 %	40 %	384049508
111	NC_017101	GCCAC	2	10	159863	159872	20 %	0 %	20 %	60 %	384049509
112	NC_017101	AGAAA	2	10	159993	160002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017101	TGTCC	2	10	161326	161335	0 %	40 %	20 %	40 %	384049510
114	NC_017101	TCTAT	2	10	162190	162199	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017101	TGCCC	2	10	162875	162884	0 %	20 %	20 %	60 %	384049512
116	NC_017101	GGACA	2	10	164112	164121	40 %	0 %	40 %	20 %	384049514
117	NC_017101	TTTCT	2	10	165445	165454	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017101	CATCT	2	10	165605	165614	20 %	40 %	0 %	40 %	384049515
119	NC_017101	ATCGC	2	10	165864	165873	20 %	20 %	20 %	40 %	384049515
120	NC_017101	CCAAC	2	10	166064	166073	40 %	0 %	0 %	60 %	384049516
121	NC_017101	TCCGG	2	10	167303	167312	0 %	20 %	40 %	40 %	384049516
122	NC_017101	CTGCT	2	10	169091	169100	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017101	CCGGA	2	10	169207	169216	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017101	TCCGG	2	10	171792	171801	0 %	20 %	40 %	40 %	384049520
125	NC_017101	TCGCG	2	10	171852	171861	0 %	20 %	40 %	40 %	384049520
126	NC_017101	CCCGG	2	10	172059	172068	0 %	0 %	40 %	60 %	384049521
127	NC_017101	GTCCG	2	10	172663	172672	0 %	20 %	40 %	40 %	384049521
128	NC_017101	TGATC	2	10	173413	173422	20 %	40 %	20 %	20 %	384049522
129	NC_017101	ACACC	2	10	174986	174995	40 %	0 %	0 %	60 %	384049524
130	NC_017101	AGTAG	2	10	175619	175628	40 %	20 %	40 %	0 %	384049524
131	NC_017101	ATGCA	2	10	176400	176409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017101	CGATG	2	10	177197	177206	20 %	20 %	40 %	20 %	384049525
133	NC_017101	GGAAA	2	10	178085	178094	60 %	0 %	40 %	0 %	384049526
134	NC_017101	AGAAA	2	10	180601	180610	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017101	TGTCC	2	10	181934	181943	0 %	40 %	20 %	40 %	384049529
136	NC_017101	AGAAA	2	10	182282	182291	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017101	TGTCC	2	10	183615	183624	0 %	40 %	20 %	40 %	384049530
138	NC_017101	GCCCA	2	10	184918	184927	20 %	0 %	20 %	60 %	384049532
139	NC_017101	TGCTC	2	10	185727	185736	0 %	40 %	20 %	40 %	384049532
140	NC_017101	CCGAG	2	10	186324	186333	20 %	0 %	40 %	40 %	384049532
141	NC_017101	CATGC	2	10	186871	186880	20 %	20 %	20 %	40 %	384049533
142	NC_017101	CCTGC	2	10	187451	187460	0 %	20 %	20 %	60 %	384049533
143	NC_017101	ACGAC	2	10	190011	190020	40 %	0 %	20 %	40 %	384049534
144	NC_017101	CCAGC	2	10	190361	190370	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017101	GCCAC	2	10	191190	191199	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.