MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-010

Total Repeats: 416

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017101	CTTC	2	8	304	311	0 %	50 %	0 %	50 %	384049358
2	NC_017101	CTGA	2	8	386	393	25 %	25 %	25 %	25 %	384049358
3	NC_017101	GCTG	2	8	1987	1994	0 %	25 %	50 %	25 %	384049360
4	NC_017101	CTGC	2	8	3356	3363	0 %	25 %	25 %	50 %	384049361
5	NC_017101	CAGC	2	8	4068	4075	25 %	0 %	25 %	50 %	384049362
6	NC_017101	TGAT	2	8	5583	5590	25 %	50 %	25 %	0 %	384049364
7	NC_017101	GCAC	2	8	5883	5890	25 %	0 %	25 %	50 %	384049364
8	NC_017101	CCAT	2	8	7170	7177	25 %	25 %	0 %	50 %	384049365
9	NC_017101	GAAA	2	8	7948	7955	75 %	0 %	25 %	0 %	384049366
10	NC_017101	TTGC	2	8	8747	8754	0 %	50 %	25 %	25 %	384049367
11	NC_017101	TTGG	2	8	8768	8775	0 %	50 %	50 %	0 %	384049367
12	NC_017101	TCTT	2	8	8903	8910	0 %	75 %	0 %	25 %	384049367
13	NC_017101	GTCA	2	8	9300	9307	25 %	25 %	25 %	25 %	384049368
14	NC_017101	CCAG	2	8	9820	9827	25 %	0 %	25 %	50 %	384049368
15	NC_017101	TTCT	2	8	10274	10281	0 %	75 %	0 %	25 %	384049368
16	NC_017101	ATGG	2	8	10859	10866	25 %	25 %	50 %	0 %	384049368
17	NC_017101	CAGC	2	8	11443	11450	25 %	0 %	25 %	50 %	384049368
18	NC_017101	AAAG	2	8	11591	11598	75 %	0 %	25 %	0 %	384049368
19	NC_017101	CTTG	2	8	11955	11962	0 %	50 %	25 %	25 %	384049368
20	NC_017101	TTCG	2	8	12338	12345	0 %	50 %	25 %	25 %	384049368
21	NC_017101	GTCA	2	8	12993	13000	25 %	25 %	25 %	25 %	384049368
22	NC_017101	CAGA	2	8	14003	14010	50 %	0 %	25 %	25 %	384049369
23	NC_017101	TGGC	2	8	14343	14350	0 %	25 %	50 %	25 %	384049369
24	NC_017101	GCAC	2	8	14470	14477	25 %	0 %	25 %	50 %	384049369
25	NC_017101	GACA	2	8	14629	14636	50 %	0 %	25 %	25 %	384049369
26	NC_017101	GAAG	2	8	14647	14654	50 %	0 %	50 %	0 %	384049369
27	NC_017101	CGTC	2	8	15286	15293	0 %	25 %	25 %	50 %	384049369
28	NC_017101	TCGG	2	8	15756	15763	0 %	25 %	50 %	25 %	384049370
29	NC_017101	TTGC	2	8	16062	16069	0 %	50 %	25 %	25 %	384049370
30	NC_017101	CGGG	2	8	16559	16566	0 %	0 %	75 %	25 %	384049371
31	NC_017101	CTTC	2	8	17414	17421	0 %	50 %	0 %	50 %	384049371
32	NC_017101	GACG	2	8	18678	18685	25 %	0 %	50 %	25 %	384049373
33	NC_017101	GCGG	2	8	19486	19493	0 %	0 %	75 %	25 %	384049373
34	NC_017101	GCCA	2	8	19621	19628	25 %	0 %	25 %	50 %	384049373
35	NC_017101	TCTG	2	8	19961	19968	0 %	50 %	25 %	25 %	384049373
36	NC_017101	TCGA	2	8	20348	20355	25 %	25 %	25 %	25 %	384049374
37	NC_017101	GAAG	2	8	20515	20522	50 %	0 %	50 %	0 %	384049374
38	NC_017101	AAGA	2	8	20558	20565	75 %	0 %	25 %	0 %	384049374
39	NC_017101	GAAG	2	8	20943	20950	50 %	0 %	50 %	0 %	384049375
40	NC_017101	TGGA	2	8	21358	21365	25 %	25 %	50 %	0 %	384049376
41	NC_017101	GTCA	2	8	21531	21538	25 %	25 %	25 %	25 %	384049376
42	NC_017101	AGAT	2	8	22339	22346	50 %	25 %	25 %	0 %	384049377
43	NC_017101	GCTC	2	8	23012	23019	0 %	25 %	25 %	50 %	384049378
44	NC_017101	CTAT	2	8	23042	23049	25 %	50 %	0 %	25 %	384049378
45	NC_017101	GCTG	2	8	24150	24157	0 %	25 %	50 %	25 %	384049378
46	NC_017101	AGAA	2	8	24845	24852	75 %	0 %	25 %	0 %	384049378
47	NC_017101	GATA	2	8	24873	24880	50 %	25 %	25 %	0 %	384049378
48	NC_017101	CAAA	2	8	25286	25293	75 %	0 %	0 %	25 %	384049379
49	NC_017101	GGCA	2	8	26056	26063	25 %	0 %	50 %	25 %	384049380
50	NC_017101	TGCG	2	8	26088	26095	0 %	25 %	50 %	25 %	384049380
51	NC_017101	AAGG	2	8	26126	26133	50 %	0 %	50 %	0 %	384049380
52	NC_017101	CCAT	2	8	26812	26819	25 %	25 %	0 %	50 %	384049381
53	NC_017101	CAGA	2	8	28244	28251	50 %	0 %	25 %	25 %	384049383
54	NC_017101	TGGC	2	8	28584	28591	0 %	25 %	50 %	25 %	384049383
55	NC_017101	GCAC	2	8	28711	28718	25 %	0 %	25 %	50 %	384049383
56	NC_017101	GAAG	2	8	28888	28895	50 %	0 %	50 %	0 %	384049383
57	NC_017101	CGTC	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	384049383
58	NC_017101	GTCA	2	8	30145	30152	25 %	25 %	25 %	25 %	384049384
59	NC_017101	ATCT	2	8	31148	31155	25 %	50 %	0 %	25 %	384049385
60	NC_017101	AGGT	2	8	31416	31423	25 %	25 %	50 %	0 %	384049385
61	NC_017101	TTCC	2	8	31640	31647	0 %	50 %	0 %	50 %	384049385
62	NC_017101	AACG	2	8	31981	31988	50 %	0 %	25 %	25 %	384049386
63	NC_017101	GAAC	2	8	32064	32071	50 %	0 %	25 %	25 %	384049386
64	NC_017101	CCAA	2	8	32123	32130	50 %	0 %	0 %	50 %	384049386
65	NC_017101	GGAA	2	8	32802	32809	50 %	0 %	50 %	0 %	384049386
66	NC_017101	TGAT	2	8	33789	33796	25 %	50 %	25 %	0 %	384049387
67	NC_017101	TGGT	2	8	34046	34053	0 %	50 %	50 %	0 %	384049388
68	NC_017101	GCGT	2	8	34450	34457	0 %	25 %	50 %	25 %	384049389
69	NC_017101	ACCC	2	8	35002	35009	25 %	0 %	0 %	75 %	384049389
70	NC_017101	GACA	2	8	35698	35705	50 %	0 %	25 %	25 %	384049389
71	NC_017101	CGTG	2	8	35849	35856	0 %	25 %	50 %	25 %	384049389
72	NC_017101	ATCA	2	8	35868	35875	50 %	25 %	0 %	25 %	384049389
73	NC_017101	CTGG	2	8	35972	35979	0 %	25 %	50 %	25 %	384049389
74	NC_017101	TCAT	2	8	36049	36056	25 %	50 %	0 %	25 %	384049389
75	NC_017101	CGCA	2	8	36326	36333	25 %	0 %	25 %	50 %	384049389
76	NC_017101	CCGT	2	8	36466	36473	0 %	25 %	25 %	50 %	384049389
77	NC_017101	GAGC	2	8	36832	36839	25 %	0 %	50 %	25 %	384049389
78	NC_017101	GAAT	2	8	36993	37000	50 %	25 %	25 %	0 %	384049389
79	NC_017101	CGAT	2	8	37478	37485	25 %	25 %	25 %	25 %	384049390
80	NC_017101	CGGG	2	8	37758	37765	0 %	0 %	75 %	25 %	384049390
81	NC_017101	TTGA	2	8	38085	38092	25 %	50 %	25 %	0 %	384049391
82	NC_017101	ACCC	2	8	38762	38769	25 %	0 %	0 %	75 %	384049392
83	NC_017101	CGCA	2	8	38909	38916	25 %	0 %	25 %	50 %	384049392
84	NC_017101	GGGA	2	8	39532	39539	25 %	0 %	75 %	0 %	384049393
85	NC_017101	CAGA	2	8	39707	39714	50 %	0 %	25 %	25 %	384049394
86	NC_017101	TGGC	2	8	40047	40054	0 %	25 %	50 %	25 %	384049394
87	NC_017101	CAGA	2	8	40226	40233	50 %	0 %	25 %	25 %	384049395
88	NC_017101	TGGC	2	8	40566	40573	0 %	25 %	50 %	25 %	384049395
89	NC_017101	GCAC	2	8	40693	40700	25 %	0 %	25 %	50 %	384049395
90	NC_017101	GAAG	2	8	40870	40877	50 %	0 %	50 %	0 %	384049395
91	NC_017101	CGTC	2	8	41509	41516	0 %	25 %	25 %	50 %	384049395
92	NC_017101	CAGA	2	8	41895	41902	50 %	0 %	25 %	25 %	384049396
93	NC_017101	TGGC	2	8	42235	42242	0 %	25 %	50 %	25 %	384049396
94	NC_017101	GCAC	2	8	42362	42369	25 %	0 %	25 %	50 %	384049396
95	NC_017101	GAAG	2	8	42539	42546	50 %	0 %	50 %	0 %	384049396
96	NC_017101	CGTC	2	8	43178	43185	0 %	25 %	25 %	50 %	384049396
97	NC_017101	TCCG	2	8	44098	44105	0 %	25 %	25 %	50 %	384049397
98	NC_017101	CTGG	2	8	45092	45099	0 %	25 %	50 %	25 %	384049398
99	NC_017101	GGCA	2	8	45154	45161	25 %	0 %	50 %	25 %	384049398
100	NC_017101	ATGG	2	8	45564	45571	25 %	25 %	50 %	0 %	384049399
101	NC_017101	TGCC	2	8	45682	45689	0 %	25 %	25 %	50 %	384049399
102	NC_017101	GCAC	2	8	46060	46067	25 %	0 %	25 %	50 %	384049399
103	NC_017101	GTCT	2	8	46291	46298	0 %	50 %	25 %	25 %	384049399
104	NC_017101	TGGT	2	8	46333	46340	0 %	50 %	50 %	0 %	384049399
105	NC_017101	AATG	2	8	46664	46671	50 %	25 %	25 %	0 %	384049400
106	NC_017101	ACCT	2	8	47788	47795	25 %	25 %	0 %	50 %	384049400
107	NC_017101	ATTG	2	8	47831	47838	25 %	50 %	25 %	0 %	384049400
108	NC_017101	CGTC	2	8	48908	48915	0 %	25 %	25 %	50 %	384049402
109	NC_017101	GCGT	2	8	49072	49079	0 %	25 %	50 %	25 %	384049402
110	NC_017101	GCGT	2	8	49893	49900	0 %	25 %	50 %	25 %	384049403
111	NC_017101	CATC	2	8	50374	50381	25 %	25 %	0 %	50 %	384049403
112	NC_017101	AGCG	2	8	50489	50496	25 %	0 %	50 %	25 %	384049403
113	NC_017101	ACGA	2	8	50894	50901	50 %	0 %	25 %	25 %	384049404
114	NC_017101	GGAC	2	8	51022	51029	25 %	0 %	50 %	25 %	384049404
115	NC_017101	GGTC	2	8	52009	52016	0 %	25 %	50 %	25 %	384049405
116	NC_017101	GAAA	2	8	52647	52654	75 %	0 %	25 %	0 %	384049405
117	NC_017101	TGCC	2	8	54327	54334	0 %	25 %	25 %	50 %	384049406
118	NC_017101	GTGG	2	8	54669	54676	0 %	25 %	75 %	0 %	384049406
119	NC_017101	CCTT	2	8	54682	54689	0 %	50 %	0 %	50 %	384049406
120	NC_017101	CCTT	2	8	55422	55429	0 %	50 %	0 %	50 %	384049407
121	NC_017101	CAGG	2	8	55777	55784	25 %	0 %	50 %	25 %	384049407
122	NC_017101	TGTT	2	8	56607	56614	0 %	75 %	25 %	0 %	384049407
123	NC_017101	TTTC	2	8	56931	56938	0 %	75 %	0 %	25 %	384049408
124	NC_017101	GCGG	2	8	57006	57013	0 %	0 %	75 %	25 %	384049408
125	NC_017101	GGTT	2	8	57041	57048	0 %	50 %	50 %	0 %	384049408
126	NC_017101	TGGA	2	8	57893	57900	25 %	25 %	50 %	0 %	384049409
127	NC_017101	CTCC	2	8	58904	58911	0 %	25 %	0 %	75 %	384049409
128	NC_017101	AGAA	2	8	59368	59375	75 %	0 %	25 %	0 %	384049409
129	NC_017101	CGTC	2	8	59934	59941	0 %	25 %	25 %	50 %	384049409
130	NC_017101	ATGG	2	8	60370	60377	25 %	25 %	50 %	0 %	384049410
131	NC_017101	GGAT	2	8	61794	61801	25 %	25 %	50 %	0 %	384049411
132	NC_017101	CCCG	2	8	62261	62268	0 %	0 %	25 %	75 %	384049411
133	NC_017101	CTGT	2	8	62293	62300	0 %	50 %	25 %	25 %	384049411
134	NC_017101	AATC	2	8	62991	62998	50 %	25 %	0 %	25 %	384049412
135	NC_017101	GACG	2	8	63687	63694	25 %	0 %	50 %	25 %	384049413
136	NC_017101	GGTC	2	8	63957	63964	0 %	25 %	50 %	25 %	384049413
137	NC_017101	CTTC	2	8	64326	64333	0 %	50 %	0 %	50 %	384049413
138	NC_017101	CGGG	2	8	64496	64503	0 %	0 %	75 %	25 %	384049413
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408	NC_017101	ATGG	2	8	185413	185420	25 %	25 %	50 %	0 %	384049532
409	NC_017101	CCGG	2	8	185464	185471	0 %	0 %	50 %	50 %	384049532
410	NC_017101	ACCG	2	8	185884	185891	25 %	0 %	25 %	50 %	384049532
411	NC_017101	CATC	2	8	185910	185917	25 %	25 %	0 %	50 %	384049532
412	NC_017101	CCGC	2	8	186102	186109	0 %	0 %	25 %	75 %	384049532
413	NC_017101	GGCC	2	8	186567	186574	0 %	0 %	50 %	50 %	384049532
414	NC_017101	CTTC	2	8	187262	187269	0 %	50 %	0 %	50 %	384049533
415	NC_017101	CCAA	2	8	188054	188061	50 %	0 %	0 %	50 %	384049533
416	NC_017101	GATC	2	8	189953	189960	25 %	25 %	25 %	25 %	384049534

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.