MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03 plasmid pAPA03-010

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017101	CG	3	6	422	427	0 %	0 %	50 %	50 %	384049358
2	NC_017101	GC	3	6	1270	1275	0 %	0 %	50 %	50 %	384049360
3	NC_017101	CG	3	6	3182	3187	0 %	0 %	50 %	50 %	384049361
4	NC_017101	TG	3	6	3307	3312	0 %	50 %	50 %	0 %	384049361
5	NC_017101	TG	3	6	3498	3503	0 %	50 %	50 %	0 %	384049361
6	NC_017101	GC	3	6	3892	3897	0 %	0 %	50 %	50 %	384049362
7	NC_017101	TA	3	6	5229	5234	50 %	50 %	0 %	0 %	384049364
8	NC_017101	CG	3	6	5244	5249	0 %	0 %	50 %	50 %	384049364
9	NC_017101	TG	3	6	6288	6293	0 %	50 %	50 %	0 %	384049364
10	NC_017101	AG	3	6	6424	6429	50 %	0 %	50 %	0 %	384049364
11	NC_017101	GA	3	6	10120	10125	50 %	0 %	50 %	0 %	384049368
12	NC_017101	CG	3	6	10597	10602	0 %	0 %	50 %	50 %	384049368
13	NC_017101	CG	3	6	12032	12037	0 %	0 %	50 %	50 %	384049368
14	NC_017101	AG	3	6	12127	12132	50 %	0 %	50 %	0 %	384049368
15	NC_017101	TC	3	6	12471	12476	0 %	50 %	0 %	50 %	384049368
16	NC_017101	CG	3	6	12670	12675	0 %	0 %	50 %	50 %	384049368
17	NC_017101	AG	3	6	12944	12949	50 %	0 %	50 %	0 %	384049368
18	NC_017101	GC	3	6	14882	14887	0 %	0 %	50 %	50 %	384049369
19	NC_017101	CG	3	6	15707	15712	0 %	0 %	50 %	50 %	384049370
20	NC_017101	AC	3	6	16953	16958	50 %	0 %	0 %	50 %	384049371
21	NC_017101	CG	3	6	19083	19088	0 %	0 %	50 %	50 %	384049373
22	NC_017101	GC	3	6	19496	19501	0 %	0 %	50 %	50 %	384049373
23	NC_017101	AG	4	8	20185	20192	50 %	0 %	50 %	0 %	384049374
24	NC_017101	TC	3	6	20250	20255	0 %	50 %	0 %	50 %	384049374
25	NC_017101	AC	3	6	20415	20420	50 %	0 %	0 %	50 %	384049374
26	NC_017101	GC	3	6	20826	20831	0 %	0 %	50 %	50 %	384049375
27	NC_017101	TC	3	6	21883	21888	0 %	50 %	0 %	50 %	384049377
28	NC_017101	GA	4	8	21962	21969	50 %	0 %	50 %	0 %	384049377
29	NC_017101	CT	4	8	23716	23723	0 %	50 %	0 %	50 %	384049378
30	NC_017101	GC	3	6	23867	23872	0 %	0 %	50 %	50 %	384049378
31	NC_017101	GT	3	6	26513	26518	0 %	50 %	50 %	0 %	384049381
32	NC_017101	AG	3	6	26755	26760	50 %	0 %	50 %	0 %	384049381
33	NC_017101	CT	3	6	27592	27597	0 %	50 %	0 %	50 %	384049382
34	NC_017101	GA	3	6	27619	27624	50 %	0 %	50 %	0 %	384049382
35	NC_017101	GC	3	6	29123	29128	0 %	0 %	50 %	50 %	384049383
36	NC_017101	CA	3	6	30932	30937	50 %	0 %	0 %	50 %	384049385
37	NC_017101	AG	3	6	31183	31188	50 %	0 %	50 %	0 %	384049385
38	NC_017101	AC	3	6	32010	32015	50 %	0 %	0 %	50 %	384049386
39	NC_017101	AG	3	6	34632	34637	50 %	0 %	50 %	0 %	384049389
40	NC_017101	GC	3	6	34712	34717	0 %	0 %	50 %	50 %	384049389
41	NC_017101	AC	3	6	34735	34740	50 %	0 %	0 %	50 %	384049389
42	NC_017101	CG	3	6	34913	34918	0 %	0 %	50 %	50 %	384049389
43	NC_017101	CG	3	6	35765	35770	0 %	0 %	50 %	50 %	384049389
44	NC_017101	GT	3	6	35773	35778	0 %	50 %	50 %	0 %	384049389
45	NC_017101	CA	3	6	36305	36310	50 %	0 %	0 %	50 %	384049389
46	NC_017101	CA	3	6	37938	37943	50 %	0 %	0 %	50 %	384049390
47	NC_017101	CA	3	6	38259	38264	50 %	0 %	0 %	50 %	384049391
48	NC_017101	GC	3	6	41105	41110	0 %	0 %	50 %	50 %	384049395
49	NC_017101	GC	3	6	42774	42779	0 %	0 %	50 %	50 %	384049396
50	NC_017101	AC	3	6	45123	45128	50 %	0 %	0 %	50 %	384049398
51	NC_017101	GC	3	6	46166	46171	0 %	0 %	50 %	50 %	384049399
52	NC_017101	CA	3	6	47088	47093	50 %	0 %	0 %	50 %	384049400
53	NC_017101	CG	3	6	47628	47633	0 %	0 %	50 %	50 %	384049400
54	NC_017101	GT	3	6	48306	48311	0 %	50 %	50 %	0 %	384049401
55	NC_017101	TG	3	6	48619	48624	0 %	50 %	50 %	0 %	384049402
56	NC_017101	CT	3	6	48757	48762	0 %	50 %	0 %	50 %	384049402
57	NC_017101	AG	3	6	49439	49444	50 %	0 %	50 %	0 %	384049403
58	NC_017101	AC	3	6	50130	50135	50 %	0 %	0 %	50 %	384049403
59	NC_017101	GT	3	6	51055	51060	0 %	50 %	50 %	0 %	384049404
60	NC_017101	AG	3	6	53883	53888	50 %	0 %	50 %	0 %	384049406
61	NC_017101	CG	3	6	55368	55373	0 %	0 %	50 %	50 %	384049407
62	NC_017101	CG	3	6	55706	55711	0 %	0 %	50 %	50 %	384049407
63	NC_017101	CG	3	6	56449	56454	0 %	0 %	50 %	50 %	384049407
64	NC_017101	CA	3	6	59047	59052	50 %	0 %	0 %	50 %	384049409
65	NC_017101	GC	3	6	59618	59623	0 %	0 %	50 %	50 %	384049409
66	NC_017101	CT	3	6	59789	59794	0 %	50 %	0 %	50 %	384049409
67	NC_017101	TC	3	6	60081	60086	0 %	50 %	0 %	50 %	384049409
68	NC_017101	CG	3	6	60528	60533	0 %	0 %	50 %	50 %	384049410
69	NC_017101	GC	3	6	61360	61365	0 %	0 %	50 %	50 %	384049411
70	NC_017101	CA	3	6	61391	61396	50 %	0 %	0 %	50 %	384049411
71	NC_017101	GC	3	6	61415	61420	0 %	0 %	50 %	50 %	384049411
72	NC_017101	CT	4	8	61441	61448	0 %	50 %	0 %	50 %	384049411
73	NC_017101	AC	3	6	62703	62708	50 %	0 %	0 %	50 %	384049412
74	NC_017101	AC	3	6	63398	63403	50 %	0 %	0 %	50 %	384049412
75	NC_017101	CG	3	6	64092	64097	0 %	0 %	50 %	50 %	384049413
76	NC_017101	TC	3	6	65944	65949	0 %	50 %	0 %	50 %	384049414
77	NC_017101	CA	3	6	66906	66911	50 %	0 %	0 %	50 %	384049415
78	NC_017101	AG	3	6	67184	67189	50 %	0 %	50 %	0 %	384049415
79	NC_017101	AT	3	6	67940	67945	50 %	50 %	0 %	0 %	384049416
80	NC_017101	CT	3	6	68013	68018	0 %	50 %	0 %	50 %	384049416
81	NC_017101	TC	3	6	68730	68735	0 %	50 %	0 %	50 %	384049416
82	NC_017101	TA	3	6	69473	69478	50 %	50 %	0 %	0 %	384049416
83	NC_017101	AG	3	6	70455	70460	50 %	0 %	50 %	0 %	384049417
84	NC_017101	GC	3	6	70566	70571	0 %	0 %	50 %	50 %	384049417
85	NC_017101	GC	3	6	71151	71156	0 %	0 %	50 %	50 %	384049417
86	NC_017101	TG	3	6	71507	71512	0 %	50 %	50 %	0 %	384049418
87	NC_017101	GA	3	6	71651	71656	50 %	0 %	50 %	0 %	384049418
88	NC_017101	GC	3	6	72803	72808	0 %	0 %	50 %	50 %	384049420
89	NC_017101	CT	4	8	74249	74256	0 %	50 %	0 %	50 %	384049421
90	NC_017101	TC	3	6	74319	74324	0 %	50 %	0 %	50 %	384049421
91	NC_017101	CG	3	6	75660	75665	0 %	0 %	50 %	50 %	384049422
92	NC_017101	CG	4	8	79818	79825	0 %	0 %	50 %	50 %	384049424
93	NC_017101	GA	3	6	80191	80196	50 %	0 %	50 %	0 %	384049424
94	NC_017101	GC	3	6	80433	80438	0 %	0 %	50 %	50 %	384049424
95	NC_017101	CA	3	6	82594	82599	50 %	0 %	0 %	50 %	384049426
96	NC_017101	TG	3	6	82962	82967	0 %	50 %	50 %	0 %	384049427
97	NC_017101	CA	3	6	85207	85212	50 %	0 %	0 %	50 %	384049429
98	NC_017101	CG	3	6	89050	89055	0 %	0 %	50 %	50 %	384049432
99	NC_017101	GC	3	6	89463	89468	0 %	0 %	50 %	50 %	384049432
100	NC_017101	AG	3	6	90102	90107	50 %	0 %	50 %	0 %	384049433
101	NC_017101	GC	3	6	94001	94006	0 %	0 %	50 %	50 %	384049437
102	NC_017101	GC	3	6	95622	95627	0 %	0 %	50 %	50 %	384049439
103	NC_017101	GA	3	6	96150	96155	50 %	0 %	50 %	0 %	384049440
104	NC_017101	GA	3	6	96480	96485	50 %	0 %	50 %	0 %	384049440
105	NC_017101	TG	3	6	96649	96654	0 %	50 %	50 %	0 %	384049440
106	NC_017101	AT	3	6	97241	97246	50 %	50 %	0 %	0 %	384049440
107	NC_017101	GC	3	6	97931	97936	0 %	0 %	50 %	50 %	384049441
108	NC_017101	CT	3	6	98117	98122	0 %	50 %	0 %	50 %	384049441
109	NC_017101	GA	3	6	98145	98150	50 %	0 %	50 %	0 %	384049442
110	NC_017101	TG	3	6	98190	98195	0 %	50 %	50 %	0 %	384049442
111	NC_017101	CT	3	6	99085	99090	0 %	50 %	0 %	50 %	384049442
112	NC_017101	GC	3	6	100689	100694	0 %	0 %	50 %	50 %	384049443
113	NC_017101	GC	3	6	101361	101366	0 %	0 %	50 %	50 %	384049443
114	NC_017101	GC	3	6	101814	101819	0 %	0 %	50 %	50 %	384049443
115	NC_017101	TG	3	6	102898	102903	0 %	50 %	50 %	0 %	384049445
116	NC_017101	GC	3	6	105703	105708	0 %	0 %	50 %	50 %	384049448
117	NC_017101	AG	3	6	105816	105821	50 %	0 %	50 %	0 %	384049448
118	NC_017101	CT	3	6	106710	106715	0 %	50 %	0 %	50 %	384049449
119	NC_017101	TG	3	6	107077	107082	0 %	50 %	50 %	0 %	384049450
120	NC_017101	AC	3	6	107149	107154	50 %	0 %	0 %	50 %	384049450
121	NC_017101	AG	3	6	107561	107566	50 %	0 %	50 %	0 %	384049451
122	NC_017101	AC	3	6	108252	108257	50 %	0 %	0 %	50 %	384049451
123	NC_017101	GC	3	6	110275	110280	0 %	0 %	50 %	50 %	384049453
124	NC_017101	CA	3	6	110353	110358	50 %	0 %	0 %	50 %	384049453
125	NC_017101	TC	3	6	110558	110563	0 %	50 %	0 %	50 %	384049454
126	NC_017101	TC	3	6	112773	112778	0 %	50 %	0 %	50 %	384049457
127	NC_017101	AC	3	6	113942	113947	50 %	0 %	0 %	50 %	384049458
128	NC_017101	TC	3	6	115292	115297	0 %	50 %	0 %	50 %	384049459
129	NC_017101	GA	3	6	115774	115779	50 %	0 %	50 %	0 %	384049459
130	NC_017101	GC	3	6	115800	115805	0 %	0 %	50 %	50 %	384049459
131	NC_017101	CT	3	6	116659	116664	0 %	50 %	0 %	50 %	384049459
132	NC_017101	CG	3	6	117590	117595	0 %	0 %	50 %	50 %	384049460
133	NC_017101	GC	3	6	118548	118553	0 %	0 %	50 %	50 %	384049460
134	NC_017101	GA	3	6	118739	118744	50 %	0 %	50 %	0 %	384049461
135	NC_017101	CA	3	6	119445	119450	50 %	0 %	0 %	50 %	384049462
136	NC_017101	CG	3	6	119520	119525	0 %	0 %	50 %	50 %	384049462
137	NC_017101	GT	3	6	119912	119917	0 %	50 %	50 %	0 %	384049462
138	NC_017101	CT	3	6	120369	120374	0 %	50 %	0 %	50 %	384049463
139	NC_017101	CA	3	6	120546	120551	50 %	0 %	0 %	50 %	384049463
140	NC_017101	CG	3	6	121113	121118	0 %	0 %	50 %	50 %	384049464
141	NC_017101	CA	3	6	121933	121938	50 %	0 %	0 %	50 %	384049465
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.