MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acetobacter pasteurianus IFO 3283-03

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017100	TATTTT	2	12	157463	157474	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017100	TTTTGC	2	12	163909	163920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017100	TGTGTA	2	12	185229	185240	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017100	TATTTA	2	12	185346	185357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017100	GTCGGA	2	12	196772	196783	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017100	ACCTTT	2	12	230042	230053	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017100	CGACCG	2	12	278785	278796	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017100	TGCCAC	2	12	291046	291057	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017100	GGGCGG	2	12	309571	309582	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017100	AGAAAA	2	12	318237	318248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017100	TTCTGG	2	12	349051	349062	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017100	GGCGCG	2	12	419525	419536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017100	TATGCA	2	12	473968	473979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017100	AAACCA	2	12	521863	521874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017100	AAAATT	2	12	530972	530983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017100	TAAAAA	2	12	533157	533168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017100	TGCCAA	2	12	645192	645203	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017100	GTGCGT	2	12	723388	723399	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017100	AAAAGG	2	12	753042	753053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017100	TGAACG	2	12	766363	766374	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017100	TAAAGC	2	12	774378	774389	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017100	GCGCAA	2	12	791217	791228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017100	TGCGCG	2	12	866628	866639	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017100	GAAGGT	2	12	867500	867511	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017100	AGACGG	2	12	963622	963633	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017100	CCTTTC	2	12	1022636	1022647	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017100	GCCGGG	2	12	1042778	1042789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017100	TTTTCT	2	12	1055346	1055357	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017100	GGGGAT	2	12	1089924	1089935	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017100	TGTTGG	2	12	1090502	1090513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017100	GGGCAG	2	12	1192174	1192185	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017100	ACGGAA	2	12	1220214	1220225	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017100	GGAACG	2	12	1244204	1244215	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017100	TATTCG	2	12	1318954	1318965	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017100	AAACAT	2	12	1335039	1335050	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017100	TTCAGG	2	12	1335112	1335123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017100	CAAAAA	2	12	1348820	1348831	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017100	CAAAAA	2	12	1369744	1369755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017100	TTGGGG	2	12	1370278	1370289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017100	TTTTTG	2	12	1463492	1463503	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017100	CTCGCC	2	12	1539154	1539165	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017100	TTTGAT	2	12	1729472	1729483	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017100	CTCGCC	2	12	1732237	1732248	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017100	CCGAAA	2	12	1804488	1804499	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017100	TTTTTA	2	12	1836341	1836352	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017100	GAGCCC	2	12	1845714	1845725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017100	CGGTTC	2	12	1851224	1851235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017100	TATGGA	2	12	1918355	1918366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017100	CGATCC	2	12	1920799	1920810	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017100	GATGCC	2	12	1920848	1920859	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017100	TGAAGA	2	12	1923528	1923539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017100	AGCTAT	2	12	1932653	1932664	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017100	GTTTTT	2	12	1985111	1985122	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017100	ATCACG	2	12	2019156	2019167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017100	TATTTT	2	12	2029122	2029133	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017100	TGATCA	2	12	2033239	2033250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017100	CTACGC	2	12	2097275	2097286	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017100	AACCCT	2	12	2226314	2226325	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017100	AATATA	2	12	2256264	2256275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017100	CTCGCC	2	12	2286072	2286083	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017100	TGCGGT	2	12	2311823	2311834	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017100	GAAAAA	2	12	2352514	2352525	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017100	ATCCTT	2	12	2413006	2413017	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017100	TCGTTA	2	12	2417843	2417854	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017100	AAAATA	2	12	2428689	2428700	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017100	AATTGG	2	12	2480816	2480827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017100	GCGCCA	2	12	2504394	2504405	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017100	CAGAAA	2	12	2540795	2540806	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017100	AGCTTC	2	12	2589086	2589097	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017100	ACGTCA	2	12	2607983	2607994	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017100	CTCGCC	2	12	2610501	2610512	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017100	ACCTGC	2	12	2645656	2645667	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017100	CCGGAT	2	12	2677427	2677438	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017100	TCGCTG	2	12	2700856	2700867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017100	GCTTGC	2	12	2701002	2701013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017100	CTCGCC	2	12	2765546	2765557	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017100	TCTTAC	2	12	2786445	2786456	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017100	ATTTTA	2	12	2788559	2788570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017100	CTTTTT	2	12	2805549	2805560	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017100	GCTTCT	2	12	2843590	2843601	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017100	TCCTTT	2	12	2868386	2868397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.