MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Spirochaeta africana DSM 8902 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017098	ACCCG	2	10	1448	1457	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017098	CCACC	2	10	16217	16226	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_017098	TCAGA	2	10	69153	69162	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017098	TGTTT	2	10	75172	75181	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017098	TCAGA	2	10	87260	87269	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017098	TGAGG	2	10	132994	133003	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017098	GCGGG	2	10	153616	153625	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017098	TACAA	2	10	188061	188070	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017098	AAAAG	2	10	192377	192386	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017098	GGGGA	2	10	221683	221692	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017098	TCTGT	2	10	249123	249132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017098	TTATG	2	10	264055	264064	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017098	CGAGC	2	10	327682	327691	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017098	AACTG	2	10	337197	337206	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017098	CTGAA	2	10	364803	364812	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017098	ACAGG	2	10	365676	365685	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017098	AAAGC	2	10	390763	390772	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017098	TACCT	2	10	396644	396653	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017098	CGTCA	2	10	450175	450184	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017098	GCCTG	2	10	465021	465030	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017098	AATGC	2	10	505324	505333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017098	GCTGT	2	10	508906	508915	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017098	CGCCC	2	10	517671	517680	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
24	NC_017098	GTTCG	2	10	522943	522952	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017098	GTATA	2	10	524128	524137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017098	CCAGA	2	10	524158	524167	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017098	AGAGA	2	10	529952	529961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017098	ATTCT	2	10	549861	549870	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017098	GGGCG	2	10	558819	558828	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017098	TGTAT	2	10	569466	569475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017098	TCAAA	2	10	608643	608652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017098	AATAA	2	10	626028	626037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017098	AAACC	2	10	657935	657944	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_017098	GCCTT	2	10	659364	659373	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017098	AAGGA	2	10	696540	696549	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017098	GAGAG	2	10	751667	751676	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017098	ACGGC	2	10	807340	807349	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017098	CCTGT	2	10	840378	840387	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017098	AGAAA	2	10	853789	853798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017098	GTGCG	2	10	938759	938768	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017098	GCCGG	2	10	980984	980993	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_017098	CGCGC	2	10	982710	982719	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017098	AGGGG	2	10	982773	982782	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017098	CCGTC	2	10	987377	987386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_017098	CGCGC	2	10	988215	988224	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
46	NC_017098	CGCGC	2	10	990700	990709	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47	NC_017098	GTAGT	2	10	994909	994918	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017098	GCAAT	2	10	994965	994974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017098	TGCAG	2	10	1041225	1041234	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017098	GCAGC	2	10	1043993	1044002	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017098	CACGA	2	10	1057068	1057077	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_017098	CGTGC	2	10	1057078	1057087	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_017098	GCGGG	2	10	1060920	1060929	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017098	GATAG	2	10	1078961	1078970	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017098	GAGCA	2	10	1151100	1151109	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017098	GTAAT	2	10	1151224	1151233	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017098	GAGGC	2	10	1160877	1160886	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017098	AACAC	2	10	1161254	1161263	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017098	TACCA	2	10	1170200	1170209	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_017098	GATTT	2	10	1182623	1182632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017098	AGCAT	2	10	1190776	1190785	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017098	TGGGG	2	10	1215397	1215406	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017098	GGTGT	2	10	1268169	1268178	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017098	AGGTA	2	10	1270840	1270849	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017098	GGGCG	2	10	1274717	1274726	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017098	GGCGA	2	10	1295116	1295125	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017098	GGCGA	2	10	1300001	1300010	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017098	TTATA	2	10	1300601	1300610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017098	GCAGT	2	10	1378415	1378424	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017098	CGACA	2	10	1420394	1420403	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_017098	CGGCC	2	10	1424106	1424115	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_017098	GCCGG	2	10	1424140	1424149	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
73	NC_017098	CGACA	2	10	1424182	1424191	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_017098	AACAG	2	10	1430853	1430862	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017098	TCATC	2	10	1431389	1431398	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017098	AATGA	2	10	1431495	1431504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017098	CGGCC	2	10	1431777	1431786	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
78	NC_017098	CGACA	2	10	1431853	1431862	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017098	TGAAC	2	10	1474111	1474120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017098	ACTTG	2	10	1488516	1488525	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017098	TCCTG	2	10	1510248	1510257	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017098	ATGGA	2	10	1510631	1510640	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017098	CCCGA	2	10	1516214	1516223	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
84	NC_017098	CCGGG	2	10	1530715	1530724	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
85	NC_017098	GAGTT	2	10	1532308	1532317	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017098	GCCGG	2	10	1534761	1534770	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017098	GGGCA	2	10	1549365	1549374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017098	GTAAA	2	10	1553946	1553955	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017098	GTTGT	2	10	1572671	1572680	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017098	AATAT	2	10	1572714	1572723	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017098	AGGAT	2	10	1572817	1572826	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017098	AGTAT	2	10	1599522	1599531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017098	ATCCT	2	10	1607051	1607060	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017098	GCTGT	2	10	1608868	1608877	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017098	CGGGT	2	10	1614956	1614965	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017098	GTGGG	2	10	1689419	1689428	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017098	ATGTA	2	10	1707511	1707520	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017098	GCCGT	2	10	1717801	1717810	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017098	AGCAC	2	10	1717850	1717859	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017098	AATCC	2	10	1766947	1766956	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017098	TGAAT	2	10	1784263	1784272	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017098	GGAGG	2	10	1795853	1795862	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017098	CCTTT	2	10	1843368	1843377	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017098	ATACG	2	10	1858649	1858658	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017098	ACTGC	2	10	1920697	1920706	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017098	ATATA	2	10	1993227	1993236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017098	GATAG	2	10	1993940	1993949	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017098	TCGCT	2	10	2008061	2008070	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017098	CAGTT	2	10	2031187	2031196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017098	TTTCG	2	10	2037415	2037424	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017098	GGCCG	2	10	2101807	2101816	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
112	NC_017098	GCTGG	2	10	2101817	2101826	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017098	AATTT	2	10	2126019	2126028	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017098	GGAAA	2	10	2126988	2126997	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017098	TATAA	2	10	2202471	2202480	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017098	CTCCC	2	10	2241580	2241589	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_017098	CCGGC	2	10	2270810	2270819	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
118	NC_017098	TCACC	2	10	2275749	2275758	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017098	CATAC	2	10	2275826	2275835	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017098	CCCAC	2	10	2317579	2317588	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_017098	CAGCA	2	10	2317757	2317766	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017098	GAGCG	2	10	2331266	2331275	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017098	CTCCC	2	10	2400088	2400097	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
124	NC_017098	CACCC	2	10	2418449	2418458	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
125	NC_017098	CGCGC	2	10	2424149	2424158	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017098	CGCTT	2	10	2425593	2425602	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017098	GAAGG	2	10	2428158	2428167	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017098	CGCGC	2	10	2432011	2432020	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
129	NC_017098	CGCTT	2	10	2433456	2433465	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017098	GAAGG	2	10	2436024	2436033	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017098	GATCA	2	10	2440778	2440787	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017098	TATAC	2	10	2443467	2443476	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017098	ATGGA	2	10	2451399	2451408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017098	TCGGT	2	10	2451604	2451613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017098	CCGGA	2	10	2451717	2451726	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_017098	CAGGG	2	10	2455306	2455315	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017098	GACCC	2	10	2483855	2483864	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
138	NC_017098	AGCGG	2	10	2528698	2528707	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017098	TACAC	2	10	2534593	2534602	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017098	CCGGG	2	10	2541662	2541671	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017098	CGGAT	2	10	2549076	2549085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017098	TTCCT	2	10	2571352	2571361	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017098	GCGAA	3	15	2574196	2574210	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017098	TGCTC	2	10	2577002	2577011	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017098	CACAC	2	10	2595397	2595406	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
146	NC_017098	TGCCT	2	10	2599573	2599582	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_017098	CAATC	2	10	2601148	2601157	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_017098	GCGCA	2	10	2601324	2601333	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_017098	TTCTA	2	10	2635384	2635393	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_017098	ATGAG	2	10	2639318	2639327	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017098	CGGCA	2	10	2652834	2652843	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017098	CAGGA	2	10	2662104	2662113	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
153	NC_017098	CAACT	2	10	2673412	2673421	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
154	NC_017098	TACTA	2	10	2769869	2769878	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017098	TCAAT	2	10	2790923	2790932	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017098	GTCGT	2	10	2798017	2798026	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_017098	TGTCA	2	10	2821653	2821662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_017098	AAAAT	2	10	2823016	2823025	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017098	TCAGC	2	10	2830319	2830328	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_017098	CGCTC	2	10	2846853	2846862	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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162	NC_017098	CGGCA	2	10	2905200	2905209	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_017098	CGGGA	2	10	2933264	2933273	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
164	NC_017098	CGCGC	2	10	2957275	2957284	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
165	NC_017098	CGCTT	2	10	2958718	2958727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
166	NC_017098	GAAGG	2	10	2961295	2961304	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017098	CTCCC	2	10	3008180	3008189	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
168	NC_017098	TCTCT	2	10	3027493	3027502	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
169	NC_017098	GCGGG	2	10	3067963	3067972	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017098	GCTCC	2	10	3082758	3082767	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
171	NC_017098	CAACG	2	10	3094198	3094207	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_017098	CTGTT	2	10	3108040	3108049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017098	CCACA	2	10	3117178	3117187	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
174	NC_017098	TTCCT	2	10	3189146	3189155	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_017098	CCATG	2	10	3205244	3205253	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_017098	AGCAT	2	10	3221354	3221363	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_017098	TCTCC	2	10	3239797	3239806	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.