MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 664

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	CGTAAA	2	12	2827	2838	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383787665
2	NC_017096	CCGAAG	2	12	4313	4324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017096	ACACTT	2	12	6171	6182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787669
4	NC_017096	TGTGCC	2	12	16015	16026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383787678
5	NC_017096	AAGACC	2	12	16471	16482	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383787678
6	NC_017096	ATCTGA	2	12	17463	17474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017096	AAAAAT	2	12	23040	23051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017096	ATTCCT	2	12	24336	24347	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383787685
9	NC_017096	CACTTA	2	12	25920	25931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787687
10	NC_017096	CACTTA	2	12	27602	27613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787688
11	NC_017096	AGATTT	2	12	28531	28542	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383787688
12	NC_017096	CTTCGG	2	12	31478	31489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017096	CAACTT	2	12	32447	32458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787691
14	NC_017096	CTTTCT	2	12	32573	32584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787691
15	NC_017096	ACTTGC	2	12	34087	34098	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383787691
16	NC_017096	GGTGAA	2	12	34491	34502	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383787692
17	NC_017096	TCCTTC	2	12	34910	34921	0 %	50 %	0 %	50 %	383787692
18	NC_017096	AAATTC	2	12	38002	38013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787696
19	NC_017096	AGATGC	2	12	38419	38430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383787696
20	NC_017096	CATAAA	2	12	40921	40932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017096	CTTCGG	2	12	41218	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017096	TAAAAT	2	12	48406	48417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017096	TTCTTT	2	12	51761	51772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383787712
24	NC_017096	TAAATC	2	12	52988	52999	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787714
25	NC_017096	TCCTGT	2	12	55996	56007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383787717
26	NC_017096	GGTTAT	2	12	56025	56036	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383787717
27	NC_017096	CAATTG	2	12	56043	56054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383787717
28	NC_017096	TATCAA	2	12	56349	56360	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787717
29	NC_017096	TTACAG	2	12	58488	58499	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383787718
30	NC_017096	CCTTTT	2	12	59565	59576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787720
31	NC_017096	GAGCCA	2	12	60836	60847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383787722
32	NC_017096	AAAGAA	2	12	62144	62155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383787724
33	NC_017096	ACAGAT	2	12	66306	66317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017096	AAAGAA	2	12	69855	69866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383787739
35	NC_017096	TGTTCT	2	12	72169	72180	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383787742
36	NC_017096	AGCAAA	2	12	76635	76646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383787749
37	NC_017096	TTTTAC	2	12	80780	80791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787753
38	NC_017096	AGTGAA	2	12	81649	81660	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787753
39	NC_017096	TTGCAA	2	12	85547	85558	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383787757
40	NC_017096	GCAAAT	2	12	88301	88312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383787760
41	NC_017096	AAAATT	2	12	89792	89803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787761
42	NC_017096	TCATTA	2	12	94280	94291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017096	AGAGCA	2	12	96695	96706	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383787770
44	NC_017096	CAGGAG	2	12	98232	98243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383787771
45	NC_017096	ACTAAT	2	12	99079	99090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017096	ACTTTT	2	12	102922	102933	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787776
47	NC_017096	GTAAAA	2	12	104651	104662	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383787779
48	NC_017096	CGAAAG	2	12	106664	106675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383787782
49	NC_017096	CAACAT	2	12	108119	108130	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383787783
50	NC_017096	TTATAG	2	12	113307	113318	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383787790
51	NC_017096	TAATTT	2	12	118028	118039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017096	AGTCAG	2	12	121807	121818	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383787798
53	NC_017096	AGGCAT	2	12	124801	124812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383787801
54	NC_017096	CAATCT	2	12	125181	125192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787801
55	NC_017096	TGAAAT	2	12	129516	129527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383787805
56	NC_017096	GCAAAC	2	12	130141	130152	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383787806
57	NC_017096	GTTCCT	2	12	130959	130970	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383787807
58	NC_017096	CTGGGT	2	12	130982	130993	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383787807
59	NC_017096	AACTTA	2	12	132283	132294	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787810
60	NC_017096	CCCTTT	2	12	132499	132510	0 %	50 %	0 %	50 %	383787810
61	NC_017096	TCCATT	2	12	132821	132832	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017096	ATCTTT	2	12	135571	135582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787813
63	NC_017096	TTCTTA	2	12	135642	135653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787813
64	NC_017096	TTTTCT	2	12	138215	138226	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383787815
65	NC_017096	TCAATT	2	12	142844	142855	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383787819
66	NC_017096	TATAAA	2	12	146234	146245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787820
67	NC_017096	TTAAAA	2	12	148810	148821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787823
68	NC_017096	AAAGAT	2	12	150357	150368	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383787824
69	NC_017096	AAATGG	2	12	151004	151015	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787824
70	NC_017096	TACTTT	2	12	155451	155462	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787828
71	NC_017096	TTCCTT	2	12	156742	156753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383787830
72	NC_017096	CAAGGT	2	12	156843	156854	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383787830
73	NC_017096	GTAAAG	2	12	160609	160620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787834
74	NC_017096	TTACAA	2	12	163191	163202	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787836
75	NC_017096	CAAAAA	2	12	163892	163903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383787837
76	NC_017096	GTGGAA	2	12	166066	166077	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383787839
77	NC_017096	CTTGGG	2	12	167363	167374	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383787841
78	NC_017096	GATAAA	2	12	168734	168745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383787842
79	NC_017096	ATTCTT	2	12	170961	170972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787845
80	NC_017096	TTTTGG	2	12	171440	171451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787845
81	NC_017096	GGAGAT	2	12	173581	173592	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383787847
82	NC_017096	ATTTTG	2	12	175996	176007	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383787852
83	NC_017096	TTTACA	2	12	177697	177708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383787852
84	NC_017096	TCTTTT	2	12	178169	178180	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383787854
85	NC_017096	TCTATT	2	12	180473	180484	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383787857
86	NC_017096	AATGTG	2	12	180578	180589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787857
87	NC_017096	TTTTAA	2	12	180659	180670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787858
88	NC_017096	GCAAAG	2	12	181865	181876	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383787861
89	NC_017096	GATAAA	2	12	182213	182224	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383787861
90	NC_017096	AGGCAA	2	12	182913	182924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383787861
91	NC_017096	TTGGAA	2	12	185566	185577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787863
92	NC_017096	CAATTG	2	12	189011	189022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383787866
93	NC_017096	GAAAAA	2	12	193689	193700	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383787871
94	NC_017096	TCCAAT	2	12	194376	194387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787872
95	NC_017096	GCTTGG	2	12	196301	196312	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383787875
96	NC_017096	ATAAAA	2	12	202773	202784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383787881
97	NC_017096	TGTGCC	2	12	204108	204119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383787883
98	NC_017096	TTTGTT	2	12	207624	207635	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383787887
99	NC_017096	AAAGGT	2	12	210750	210761	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787889
100	NC_017096	TATGGG	2	12	211236	211247	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383787889
101	NC_017096	GATTGA	2	12	211609	211620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383787890
102	NC_017096	ATTTGT	2	12	211908	211919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383787890
103	NC_017096	TGAAGA	2	12	214016	214027	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787891
104	NC_017096	CTTTTT	2	12	214513	214524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383787892
105	NC_017096	ATTTCA	2	12	219216	219227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383787897
106	NC_017096	CATATA	2	12	221123	221134	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383787898
107	NC_017096	TCTTTT	2	12	224377	224388	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383787899
108	NC_017096	TTCAAC	2	12	226358	226369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383787901
109	NC_017096	ACTGTT	2	12	228785	228796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383787902
110	NC_017096	GAGTAA	2	12	229632	229643	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383787902
111	NC_017096	AAATTA	2	12	231042	231053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383787902
112	NC_017096	TGTTTG	2	12	233947	233958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383787902
113	NC_017096	ATAACA	2	12	234422	234433	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383787902
114	NC_017096	AGTGCA	2	12	235502	235513	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383787902
115	NC_017096	CAACTA	2	12	237855	237866	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383787902
116	NC_017096	GCCAAA	2	12	239644	239655	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383787902
117	NC_017096	TCGTTA	2	12	243809	243820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383787911
118	NC_017096	TCAATA	2	12	244490	244501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017096	AAATTT	2	12	247164	247175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017096	TTTAAT	2	12	249081	249092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383787919
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466	NC_017096	TATATC	2	12	1082498	1082509	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383788772
467	NC_017096	TTCTTG	2	12	1085098	1085109	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383788777
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