MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	CCGAAG	2	12	4313	4324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017096	ATCTGA	2	12	17463	17474	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017096	AAAAAT	2	12	23040	23051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017096	CTTCGG	2	12	31478	31489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017096	CATAAA	2	12	40921	40932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017096	CTTCGG	2	12	41218	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017096	TAAAAT	2	12	48406	48417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017096	ACAGAT	2	12	66306	66317	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017096	TCATTA	2	12	94280	94291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017096	ACTAAT	2	12	99079	99090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017096	TAATTT	2	12	118028	118039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017096	TCCATT	2	12	132821	132832	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017096	TCAATA	2	12	244490	244501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017096	AAATTT	2	12	247164	247175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017096	TGTTTT	2	12	271544	271555	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017096	CTTCGG	2	12	322347	322358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017096	GTAATT	2	12	365485	365496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017096	TGTTAA	2	12	374106	374117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017096	CCGAAG	2	12	374275	374286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017096	ATTTTT	2	12	483290	483301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017096	TCGCTT	2	12	548441	548452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017096	AAAAGT	2	12	576123	576134	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017096	ACTCCC	2	12	628441	628452	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017096	TATTTT	2	12	660871	660882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017096	ATTTAA	2	12	743601	743612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017096	AAACAA	2	12	761927	761938	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017096	GTTAAA	2	12	789229	789240	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017096	ATTGAT	2	12	866733	866744	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017096	CAAATA	2	12	922566	922577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017096	AAATTT	2	12	962941	962952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017096	AATAAA	2	12	995601	995612	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017096	AAATGG	2	12	1005936	1005947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017096	AAATGG	2	12	1011021	1011032	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017096	TCCTTT	2	12	1187500	1187511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017096	CATTTT	2	12	1255477	1255488	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017096	ATTTTT	2	12	1269295	1269306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017096	CTTCGG	2	12	1294740	1294751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017096	AAATTT	2	12	1307210	1307221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017096	ATTGCA	2	12	1345740	1345751	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017096	ATTTTT	2	12	1348227	1348238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017096	CCGAAG	2	12	1371696	1371707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017096	TAAAAA	2	12	1451448	1451459	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017096	ACAAAA	2	12	1463304	1463315	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017096	CCGAAG	2	12	1477621	1477632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017096	TAAAAA	2	12	1517278	1517289	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017096	ATTTTA	2	12	1538614	1538625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.