MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldisericum exile AZM16c01

Total Repeats: 358

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017096	TAAT	2	8	1521	1528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017096	TACT	2	8	5204	5211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017096	TTCG	2	8	13643	13650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017096	CAAT	2	8	14540	14547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017096	TTCG	2	8	14741	14748	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017096	TTCG	2	8	14823	14830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017096	TTAC	2	8	19137	19144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017096	CAAA	2	8	22110	22117	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017096	AGGC	2	8	23626	23633	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017096	TGCC	2	8	23639	23646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017096	TAAA	2	8	23657	23664	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017096	ATTG	2	8	24620	24627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017096	GCCT	2	8	25650	25657	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017096	AGGG	2	8	27555	27562	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017096	TCCC	2	8	27567	27574	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_017096	ATTT	2	8	29697	29704	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017096	ATTT	2	8	34306	34313	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017096	TGAA	2	8	34318	34325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017096	AATT	2	8	40837	40844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017096	CGAA	2	8	40997	41004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017096	TCGA	2	8	41084	41091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017096	TAAA	2	8	42117	42124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017096	GTAG	2	8	44391	44398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017096	CAAA	2	8	46934	46941	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017096	CCTT	2	8	50820	50827	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017096	TTGC	2	8	51025	51032	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017096	TAAA	2	8	51357	51364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017096	ATCC	2	8	52001	52008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017096	GTTT	2	8	52014	52021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017096	AGTG	2	8	52046	52053	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017096	GTAG	2	8	53387	53394	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017096	CGAA	2	8	55142	55149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017096	TCCT	2	8	55440	55447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017096	GGAA	2	8	55609	55616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017096	TTCT	2	8	58973	58980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017096	TATC	2	8	61517	61524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017096	TTTA	2	8	62359	62366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017096	ATGT	2	8	62691	62698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017096	GAAA	2	8	65643	65650	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017096	TGCT	2	8	66156	66163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017096	TGCT	2	8	66185	66192	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017096	TTTA	2	8	70070	70077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017096	ATTT	2	8	73082	73089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017096	GAAA	2	8	73883	73890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017096	CTTT	2	8	73975	73982	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017096	TTTC	2	8	75037	75044	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017096	CTAA	2	8	75090	75097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017096	TCTT	2	8	77024	77031	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017096	TCCT	2	8	77198	77205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017096	TCTA	2	8	77501	77508	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017096	TATT	2	8	79701	79708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017096	TGAC	2	8	83247	83254	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_017096	CAGT	2	8	83255	83262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017096	GATA	2	8	83296	83303	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017096	CAAG	2	8	83324	83331	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017096	TAGT	2	8	83334	83341	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017096	ATTA	2	8	86752	86759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017096	TAAA	2	8	93738	93745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017096	TACT	2	8	93827	93834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017096	TATC	2	8	93870	93877	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017096	AATG	2	8	94060	94067	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017096	CTAC	2	8	95896	95903	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017096	GAAT	2	8	97081	97088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017096	TTTG	2	8	98824	98831	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017096	AAAG	2	8	98883	98890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017096	TGGT	2	8	98971	98978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017096	TAAT	2	8	99070	99077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017096	AACC	2	8	106904	106911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017096	AATT	2	8	106927	106934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017096	GCAA	2	8	108689	108696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017096	AAAT	2	8	108704	108711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017096	GAAT	2	8	109461	109468	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017096	GGCA	2	8	121922	121929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017096	TACC	2	8	122539	122546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017096	TTCG	2	8	122611	122618	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017096	TTTG	2	8	131244	131251	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017096	TACT	2	8	138744	138751	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017096	TAAT	2	8	153500	153507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017096	ATAA	2	8	153654	153661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017096	CCCT	2	8	164952	164959	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
81	NC_017096	ATTT	2	8	171554	171561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017096	AAGG	2	8	171601	171608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017096	ATTT	2	8	175343	175350	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017096	TTCT	2	8	178510	178517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017096	TGTT	2	8	178541	178548	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017096	TATT	2	8	178573	178580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017096	TCAT	2	8	183704	183711	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_017096	GTTT	2	8	184394	184401	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017096	TGGT	2	8	184408	184415	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017096	TTTC	2	8	184441	184448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017096	CTTT	2	8	184461	184468	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017096	TTTA	2	8	187180	187187	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017096	AGAA	2	8	188526	188533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017096	TATT	2	8	192625	192632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017096	TTCG	2	8	203425	203432	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017096	TTAC	2	8	213037	213044	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017096	TAGT	3	12	215748	215759	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017096	AAGA	2	8	240296	240303	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017096	TTTG	2	8	241841	241848	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017096	CAAT	2	8	247202	247209	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017096	ATGA	2	8	247253	247260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017096	ATTT	2	8	257231	257238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017096	TGAT	2	8	257250	257257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017096	GAAT	2	8	257340	257347	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017096	ATCA	2	8	257892	257899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017096	AGTA	2	8	260026	260033	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017096	AAAG	2	8	260100	260107	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017096	ATGT	2	8	260265	260272	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017096	AGAA	2	8	261279	261286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017096	TTAT	2	8	269454	269461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017096	AAAT	2	8	270058	270065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017096	AAAG	2	8	270362	270369	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017096	AGAT	2	8	270624	270631	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017096	TATG	2	8	270824	270831	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017096	AAAG	2	8	274919	274926	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017096	CTTA	2	8	280588	280595	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017096	TTAT	2	8	280681	280688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017096	GATA	2	8	280851	280858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017096	TAAA	2	8	303974	303981	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017096	TAAG	2	8	304009	304016	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017096	GATT	2	8	307669	307676	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017096	ATTT	2	8	319614	319621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017096	ATCT	2	8	319622	319629	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017096	AGTT	2	8	319794	319801	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017096	AAAG	2	8	322549	322556	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017096	TCAA	2	8	323582	323589	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017096	AAGG	2	8	329156	329163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017096	TAAA	2	8	331365	331372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017096	TTTC	2	8	332837	332844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017096	ATTG	2	8	341786	341793	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017096	TAAT	2	8	341821	341828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017096	CGAA	2	8	341927	341934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017096	CTAA	2	8	342081	342088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017096	ATTT	2	8	344262	344269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017096	AATT	2	8	346039	346046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017096	GGTT	2	8	346062	346069	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017096	CTGG	2	8	358827	358834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017096	GGAT	2	8	358838	358845	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017096	AAGG	2	8	365513	365520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017096	ATTT	2	8	366481	366488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017096	TGAT	2	8	373960	373967	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017096	TGAT	2	8	373974	373981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017096	TACC	2	8	374295	374302	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017096	TTCG	2	8	374366	374373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017096	ATTA	2	8	387675	387682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017096	AATT	2	8	389117	389124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017096	ATCC	2	8	389144	389151	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017096	AAGG	2	8	403953	403960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017096	TGTT	2	8	409997	410004	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017096	AAGT	2	8	410263	410270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017096	TATT	2	8	427292	427299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017096	CAAT	2	8	430548	430555	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_017096	TTTG	2	8	430975	430982	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.