MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Fervidobacterium pennivorans DSM 9078 chromosome

Total Repeats: 695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017095	AAGATT	2	12	9900	9911	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383785722
2	NC_017095	TTGCTA	2	12	10575	10586	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383785723
3	NC_017095	TTATTT	2	12	13214	13225	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383785724
4	NC_017095	CTTGAA	2	12	13583	13594	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383785725
5	NC_017095	TTCCCT	2	12	15363	15374	0 %	50 %	0 %	50 %	383785727
6	NC_017095	AAGCTG	2	12	18199	18210	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785728
7	NC_017095	AAGGGA	2	12	19051	19062	50 %	0 %	50 %	0 %	383785729
8	NC_017095	GGATTC	2	12	21794	21805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383785732
9	NC_017095	TAAAAG	2	12	23322	23333	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383785733
10	NC_017095	AGTCAT	2	12	24626	24637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383785735
11	NC_017095	GAATTT	2	12	25662	25673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383785735
12	NC_017095	CCTGAA	2	12	26872	26883	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383785735
13	NC_017095	AAGGGA	2	12	30480	30491	50 %	0 %	50 %	0 %	383785737
14	NC_017095	CGAAAT	2	12	34577	34588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383785741
15	NC_017095	AACACA	2	12	34814	34825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383785741
16	NC_017095	TGAACG	2	12	39243	39254	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785743
17	NC_017095	ACTACG	2	12	43945	43956	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383785748
18	NC_017095	GAAGTT	2	12	45892	45903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383785751
19	NC_017095	ATTTGA	2	12	50957	50968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383785757
20	NC_017095	TCATCG	2	12	52995	53006	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383785757
21	NC_017095	TCAACC	2	12	53175	53186	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383785757
22	NC_017095	TCCAAT	2	12	57159	57170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785760
23	NC_017095	TGTTCC	2	12	57195	57206	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383785760
24	NC_017095	AAAGAT	2	12	63449	63460	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383785765
25	NC_017095	CCAACA	2	12	75612	75623	50 %	0 %	0 %	50 %	383785780
26	NC_017095	TACGAG	2	12	76205	76216	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785781
27	NC_017095	AGATAG	2	12	80716	80727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383785784
28	NC_017095	GTTACC	2	12	81494	81505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383785785
29	NC_017095	GTATAG	2	12	84180	84191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383785788
30	NC_017095	GATTTG	2	12	98295	98306	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383785801
31	NC_017095	ATCTTC	2	12	100923	100934	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383785802
32	NC_017095	ATCTAC	2	12	103191	103202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785806
33	NC_017095	CAGGGA	2	12	104009	104020	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383785808
34	NC_017095	GAATCA	2	12	104863	104874	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383785809
35	NC_017095	AAACGC	2	12	110557	110568	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383785812
36	NC_017095	CTTACA	2	12	110686	110697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785812
37	NC_017095	GATAAA	2	12	111284	111295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383785812
38	NC_017095	ATGCAA	2	12	111850	111861	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383785812
39	NC_017095	TGATAT	2	12	116497	116508	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383785814
40	NC_017095	GGAACT	2	12	118323	118334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785816
41	NC_017095	GAAAAA	2	12	122118	122129	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383785819
42	NC_017095	AAGGGA	2	12	125643	125654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017095	TGGAGA	2	12	128981	128992	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017095	TACTTA	2	12	129415	129426	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017095	GAGAAA	2	12	129601	129612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383785824
46	NC_017095	GATGTT	2	12	130251	130262	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383785824
47	NC_017095	TGAATA	2	12	133244	133255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383785828
48	NC_017095	GTAATT	2	12	136064	136075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017095	GAAAAG	2	12	136620	136631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383785830
50	NC_017095	AACGAT	2	12	136797	136808	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383785831
51	NC_017095	CAGATG	2	12	137082	137093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017095	GAAAGA	2	12	142581	142592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383785835
53	NC_017095	AAGGGA	2	12	143432	143443	50 %	0 %	50 %	0 %	383785836
54	NC_017095	ATACCA	2	12	143996	144007	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	383785837
55	NC_017095	GTTTAG	2	12	154767	154778	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383785846
56	NC_017095	CTTCAA	2	12	163118	163129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785855
57	NC_017095	ACGGGA	2	12	166403	166414	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	383785858
58	NC_017095	ATGTAA	2	12	169813	169824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383785861
59	NC_017095	TCAGAT	2	12	170172	170183	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383785862
60	NC_017095	GTCGTT	2	12	174180	174191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383785865
61	NC_017095	ATAACT	2	12	174675	174686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383785865
62	NC_017095	AAAATC	2	12	176180	176191	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383785867
63	NC_017095	GCTTGT	2	12	178935	178946	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383785871
64	NC_017095	AAACGG	2	12	180113	180124	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017095	TATACC	2	12	189874	189885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785880
66	NC_017095	ATCGGA	2	12	191034	191045	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785882
67	NC_017095	TGCTAT	2	12	195717	195728	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383785888
68	NC_017095	ATCATT	2	12	201807	201818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383785893
69	NC_017095	GAAATA	2	12	202417	202428	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383785894
70	NC_017095	GTTTGA	2	12	204828	204839	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383785896
71	NC_017095	AGCTTT	2	12	204844	204855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383785896
72	NC_017095	TTAGAT	2	12	210550	210561	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383785900
73	NC_017095	TTTATT	2	12	210832	210843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	383785900
74	NC_017095	AATTTT	2	12	211155	211166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383785900
75	NC_017095	CTTAAT	2	12	211744	211755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383785901
76	NC_017095	TTTTTG	2	12	213349	213360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	383785904
77	NC_017095	TATACC	2	12	213542	213553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383785904
78	NC_017095	GATAAT	2	12	223698	223709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383785913
79	NC_017095	GAAAAA	2	12	224328	224339	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383785913
80	NC_017095	TGGACA	2	12	224838	224849	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785914
81	NC_017095	GAGGTG	2	12	231875	231886	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017095	AAGGCA	2	12	232444	232455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383785920
83	NC_017095	TGACTT	2	12	256383	256394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383785944
84	NC_017095	GTATTT	2	12	256537	256548	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383785944
85	NC_017095	AGTGTT	2	12	263232	263243	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383785948
86	NC_017095	TCCTTT	2	12	265531	265542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383785952
87	NC_017095	TAAAAA	2	12	265559	265570	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383785952
88	NC_017095	TTCTTT	2	12	269824	269835	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383785954
89	NC_017095	CTGTAG	2	12	274447	274458	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383785957
90	NC_017095	GGCAGA	2	12	278780	278791	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017095	AAGCGA	2	12	280551	280562	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017095	TTTTCT	2	12	285450	285461	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383785961
93	NC_017095	TTTCCA	2	12	286927	286938	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383785963
94	NC_017095	AGTTTT	2	12	291449	291460	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383785966
95	NC_017095	ATCTTC	2	12	294533	294544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383785969
96	NC_017095	TAACTC	2	12	295737	295748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017095	TTCCTT	2	12	299109	299120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383785972
98	NC_017095	AAATTT	2	12	299876	299887	50 %	50 %	0 %	0 %	383785973
99	NC_017095	TATAAT	2	12	303417	303428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017095	TTTCAC	2	12	306570	306581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383785981
101	NC_017095	CCACCG	2	12	309217	309228	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	383785983
102	NC_017095	GCAACA	2	12	316906	316917	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383785991
103	NC_017095	CTGGTC	2	12	318195	318206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383785992
104	NC_017095	TTTTCA	2	12	318776	318787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383785992
105	NC_017095	CAAGTG	2	12	319442	319453	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383785993
106	NC_017095	TTGTGT	2	12	324652	324663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383785996
107	NC_017095	GAAAAG	2	12	328586	328597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383786001
108	NC_017095	GGAAAA	2	12	330760	330771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383786003
109	NC_017095	CTTTTT	2	12	336743	336754	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383786010
110	NC_017095	TTTCCA	2	12	337802	337813	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383786011
111	NC_017095	GAAAGA	2	12	342086	342097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383786014
112	NC_017095	CAGCAA	2	12	345419	345430	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383786017
113	NC_017095	TTTCTT	2	12	350928	350939	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017095	GAGATG	2	12	360405	360416	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383786035
115	NC_017095	GGATGG	2	12	362031	362042	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	383786037
116	NC_017095	ACATCT	2	12	363691	363702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383786040
117	NC_017095	GTTGAT	2	12	365708	365719	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	383786042
118	NC_017095	ATAGCT	2	12	371032	371043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383786048
119	NC_017095	AGCAAG	2	12	371823	371834	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383786049
120	NC_017095	GCTTGA	2	12	372372	372383	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383786050
121	NC_017095	AAGATA	2	12	377037	377048	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383786056
122	NC_017095	TAAAAG	2	12	377278	377289	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383786056
123	NC_017095	CTTGTT	2	12	381457	381468	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383786059
124	NC_017095	CCCCTA	2	12	391847	391858	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	383786068
125	NC_017095	AAGGGA	2	12	394682	394693	50 %	0 %	50 %	0 %	383786071
126	NC_017095	TGGTGA	2	12	396719	396730	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	383786074
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128	NC_017095	TTCCCT	2	12	401047	401058	0 %	50 %	0 %	50 %	383786078
129	NC_017095	TTTTCT	2	12	406570	406581	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383786082
130	NC_017095	CTGTTG	2	12	408657	408668	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	383786084
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155	NC_017095	TTTGTT	2	12	475505	475516	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017095	AGCATC	2	12	476258	476269	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383786138
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229	NC_017095	TTTTTC	2	12	703044	703055	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_017095	GCGTAA	2	12	711503	711514	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383786349
231	NC_017095	GAAAAT	2	12	712715	712726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383786350
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347	NC_017095	AAGATA	2	12	1024573	1024584	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383786629
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462	NC_017095	ACGAAC	2	12	1378843	1378854	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	383786962
463	NC_017095	AAAACT	2	12	1380103	1380114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383786964
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467	NC_017095	AAGTGC	2	12	1387089	1387100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	383786969
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471	NC_017095	TACATC	2	12	1395094	1395105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383786976
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482	NC_017095	GTTATC	2	12	1424540	1424551	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383787002
483	NC_017095	ATTTTT	2	12	1425871	1425882	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017095	ATATCG	2	12	1431211	1431222	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383787006
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