MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 92

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	TCCCCT	2	12	12790	12801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017094	TCTTGT	2	12	47345	47356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017094	TCCGTT	2	12	66260	66271	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017094	AACTGA	2	12	76884	76895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017094	CTCCTT	2	12	78223	78234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017094	GGGAAA	2	12	86339	86350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017094	AAGGAG	2	12	93825	93836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017094	GGATCC	2	12	189290	189301	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017094	AAGGTG	2	12	195692	195703	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017094	AAAGGG	2	12	269617	269628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017094	CCGGAA	2	12	319485	319496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017094	TAAAAA	2	12	356349	356360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017094	AAGCTG	2	12	366990	367001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017094	ACTGGA	2	12	374511	374522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017094	TCCTCT	2	12	374671	374682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017094	ATTTTT	2	12	454588	454599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017094	ATTTTT	2	12	492392	492403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017094	TCCGAA	2	12	524898	524909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017094	AATTGG	2	12	525055	525066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017094	AAGGAG	2	12	543009	543020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017094	CCGGTG	2	12	549128	549139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017094	TATAAT	2	12	554597	554608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017094	GAACAG	2	12	579501	579512	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017094	ATTTTA	2	12	612372	612383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017094	CTGGAT	2	12	618708	618719	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017094	AAATCC	2	12	662525	662536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017094	AAAGGG	2	12	675437	675448	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017094	TCTTTT	2	12	710807	710818	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017094	CAAGAT	2	12	779972	779983	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017094	GGTTTT	2	12	828644	828655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017094	GTTGAT	2	12	830147	830158	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017094	AAAAAG	2	12	893216	893227	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017094	TTTTGA	2	12	924757	924768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017094	TCTATG	2	12	969452	969463	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017094	GGAAGA	2	12	1060382	1060393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017094	CCGAAG	2	12	1061286	1061297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017094	ACTGCA	2	12	1063735	1063746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017094	CTTTTT	2	12	1063817	1063828	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017094	GGAAGA	2	12	1068991	1069002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017094	CCGAAG	2	12	1069895	1069906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017094	ACTGCA	2	12	1072343	1072354	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017094	CCAAAT	2	12	1099283	1099294	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017094	TTCAAG	2	12	1182986	1182997	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017094	GGAAGA	2	12	1215825	1215836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017094	CCGAAG	2	12	1216729	1216740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017094	ACTGCA	2	12	1219178	1219189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017094	CCCATT	2	12	1223216	1223227	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017094	TGAAAA	2	12	1266822	1266833	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017094	TTGACT	2	12	1274491	1274502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017094	AATCAA	2	12	1311942	1311953	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017094	TTTCAA	2	12	1321250	1321261	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017094	CTCATT	2	12	1323835	1323846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017094	CATGGA	2	12	1368235	1368246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017094	ACCCAG	2	12	1396479	1396490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017094	CCCGAA	2	12	1469455	1469466	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017094	TTTGAA	2	12	1469536	1469547	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017094	TTCTTT	2	12	1472554	1472565	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017094	TCCCCA	2	12	1503989	1504000	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017094	AGTGAA	2	12	1686779	1686790	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017094	TCAACC	3	18	1720551	1720568	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017094	AAGGAA	2	12	1755304	1755315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017094	GAAAAA	2	12	1759416	1759427	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017094	TAAAAA	2	12	1776379	1776390	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017094	CAGAAA	2	12	1784773	1784784	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017094	TCAGAA	2	12	1796232	1796243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017094	AAGGAC	2	12	1835534	1835545	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017094	GAAGGA	2	12	1850773	1850784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017094	GAAAAA	2	12	1859794	1859805	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017094	GGGAGA	2	12	1871445	1871456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017094	CTTTTT	2	12	1941144	1941155	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017094	ATTTTT	2	12	1951816	1951827	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017094	TGGAAA	2	12	1974206	1974217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017094	GGAATC	2	12	1978883	1978894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017094	TTGAAA	2	12	2022256	2022267	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017094	ATTGAT	2	12	2040080	2040091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017094	ACAAAA	2	12	2060161	2060172	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017094	CCATTT	2	12	2076536	2076547	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017094	GAACAT	2	12	2097013	2097024	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017094	CCTGAC	2	12	2112977	2112988	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017094	GGGAAA	2	12	2167820	2167831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017094	AAAAGA	2	12	2175368	2175379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017094	CAGAAA	2	12	2180721	2180732	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017094	AATTCC	2	12	2266048	2266059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017094	AAAAAG	2	12	2270827	2270838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017094	CAGGAA	2	12	2279440	2279451	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017094	CTTTCG	2	12	2287388	2287399	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017094	ATAATC	2	12	2289974	2289985	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017094	TTTTTC	2	12	2314576	2314587	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017094	GATGAC	2	12	2381045	2381056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017094	CGGAAG	2	12	2390893	2390904	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017094	ACGCTT	2	12	2479190	2479201	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017094	CCCTGA	2	12	2543480	2543491	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.