MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	TGTT	2	8	5118	5125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017094	ATTC	2	8	5130	5137	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017094	TGAT	2	8	12149	12156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017094	CCTG	2	8	12370	12377	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017094	GAAT	2	8	12889	12896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017094	CCTT	2	8	15308	15315	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_017094	TTAT	2	8	17279	17286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017094	TTCT	2	8	20177	20184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017094	TAAA	2	8	21043	21050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017094	TGAG	2	8	21127	21134	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017094	AATC	2	8	21473	21480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017094	ATCC	2	8	22205	22212	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017094	CCAG	2	8	24410	24417	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017094	TTTG	2	8	25676	25683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017094	GATC	2	8	28737	28744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_017094	ATCT	2	8	28988	28995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017094	TGTA	2	8	29116	29123	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017094	GATT	2	8	29328	29335	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017094	GGGA	2	8	39603	39610	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017094	TCCA	2	8	47299	47306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017094	AGAA	2	8	52174	52181	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017094	GGGT	2	8	54056	54063	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017094	TTCC	2	8	54584	54591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017094	GATT	2	8	54645	54652	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017094	TTTG	2	8	55584	55591	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017094	CCCA	2	8	56012	56019	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_017094	AGCT	2	8	61243	61250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017094	GATG	2	8	66064	66071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017094	GGGT	2	8	68038	68045	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017094	AATC	2	8	68248	68255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017094	GATT	2	8	68301	68308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017094	AAAG	2	8	76964	76971	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017094	GATA	2	8	77134	77141	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017094	TGAT	2	8	77160	77167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017094	CATT	2	8	77376	77383	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017094	GGAA	2	8	79804	79811	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017094	GCCG	2	8	81011	81018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017094	TCTG	2	8	84258	84265	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017094	CAAA	2	8	87371	87378	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017094	GTTT	2	8	87711	87718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017094	CTTT	2	8	89844	89851	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017094	ACCA	2	8	89913	89920	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017094	GATT	2	8	90603	90610	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017094	CAGA	2	8	93814	93821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017094	TTGA	2	8	96884	96891	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017094	TGCT	2	8	101851	101858	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017094	GATG	2	8	102906	102913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017094	GCAA	2	8	106741	106748	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017094	ATTC	2	8	115497	115504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017094	GCGA	2	8	124854	124861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017094	AGCC	2	8	131462	131469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_017094	TCCT	2	8	134938	134945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017094	ATCA	2	8	135057	135064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017094	CCCT	2	8	138348	138355	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
55	NC_017094	ATTG	2	8	142553	142560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017094	GATC	2	8	144155	144162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_017094	ACCC	2	8	145575	145582	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_017094	TCAT	2	8	151740	151747	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017094	TTTC	2	8	153553	153560	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017094	GTTG	2	8	153790	153797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017094	TTCC	2	8	153935	153942	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017094	GTCC	2	8	159317	159324	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017094	TGGA	2	8	167904	167911	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017094	GTTT	2	8	170401	170408	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017094	CTTG	2	8	171254	171261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017094	TGAT	2	8	173888	173895	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017094	AAGG	2	8	173949	173956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017094	GGAA	2	8	174614	174621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017094	TGAT	2	8	194176	194183	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017094	ATAA	2	8	195842	195849	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017094	GAAT	2	8	195995	196002	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017094	GTTT	2	8	198796	198803	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017094	GACT	2	8	198829	198836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017094	GTGA	2	8	198909	198916	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017094	GGGC	2	8	200429	200436	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017094	AATC	2	8	206368	206375	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017094	AAGC	2	8	210053	210060	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017094	TTTC	2	8	210153	210160	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017094	AGTG	2	8	213137	213144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017094	TCCT	2	8	213384	213391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017094	CCCA	2	8	213766	213773	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_017094	TCAT	2	8	213831	213838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017094	GATT	2	8	214841	214848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017094	CAGA	2	8	214963	214970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017094	ATCA	2	8	214995	215002	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017094	GGAG	2	8	220032	220039	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017094	CTTC	2	8	220082	220089	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017094	TCAA	2	8	222326	222333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017094	TTCT	2	8	223016	223023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017094	TCTT	2	8	225870	225877	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017094	CTTG	2	8	225901	225908	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017094	GCAT	2	8	227850	227857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017094	ATGA	2	8	243216	243223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017094	AATA	2	8	243259	243266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017094	GTAG	2	8	243424	243431	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017094	TGAG	2	8	253760	253767	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017094	ATTC	2	8	267276	267283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017094	TCAA	2	8	268198	268205	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017094	AATG	2	8	270252	270259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017094	GAAG	2	8	285694	285701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017094	TGAT	2	8	285726	285733	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017094	TGAG	2	8	289200	289207	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017094	TCCT	2	8	290739	290746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017094	CTTT	2	8	290877	290884	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017094	CACC	2	8	290908	290915	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017094	TCAT	2	8	294042	294049	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017094	GATT	2	8	294831	294838	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017094	ATGG	2	8	297417	297424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017094	GATG	2	8	299301	299308	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017094	ATAA	2	8	307737	307744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017094	GATC	2	8	313736	313743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017094	CCCT	2	8	316044	316051	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_017094	TGAA	2	8	322039	322046	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017094	GATG	2	8	325230	325237	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017094	TTGT	2	8	326086	326093	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017094	AGAA	2	8	326265	326272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017094	AGAT	2	8	331730	331737	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017094	CTTC	2	8	332039	332046	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017094	GAAT	2	8	332668	332675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017094	CTAT	2	8	332680	332687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017094	ATAG	2	8	332690	332697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017094	TCCT	2	8	341328	341335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017094	TCCT	2	8	342192	342199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017094	AAGG	2	8	342901	342908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017094	CAGC	2	8	344528	344535	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017094	AATG	2	8	350002	350009	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017094	GTCC	2	8	351016	351023	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017094	CCTG	2	8	354742	354749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017094	GGTG	2	8	356109	356116	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017094	AAAT	2	8	356467	356474	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017094	GGTT	2	8	358468	358475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017094	CCTT	2	8	360228	360235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017094	GATC	2	8	363629	363636	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017094	CTTC	2	8	364231	364238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017094	GGCG	2	8	365152	365159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017094	CCAA	2	8	365640	365647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017094	ATTT	2	8	368658	368665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017094	TTTC	2	8	374176	374183	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017094	GATT	2	8	374434	374441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017094	TTTG	2	8	374550	374557	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017094	TCTG	2	8	383849	383856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017094	AATC	2	8	383981	383988	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017094	TCCC	2	8	385592	385599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_017094	GGCT	2	8	387096	387103	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017094	GGGA	2	8	391689	391696	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017094	GAAA	2	8	393598	393605	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017094	AAAG	2	8	397252	397259	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017094	CAGA	2	8	399848	399855	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017094	TGAT	2	8	404009	404016	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017094	GTTC	2	8	404054	404061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017094	ATGA	2	8	412796	412803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017094	AGAT	2	8	425745	425752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017094	ATTT	2	8	438710	438717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017094	GTTT	2	8	439985	439992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_017094	GGTG	2	8	755438	755445	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017094	TTTG	2	8	755475	755482	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017094	GATG	2	8	1232524	1232531	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NC_017094	GATT	2	8	1232568	1232575	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_017094	GATG	2	8	1265299	1265306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_017094	GGAT	2	8	1268686	1268693	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017094	GATT	2	8	1268783	1268790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_017094	CGAT	2	8	1293827	1293834	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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462	NC_017094	CTTT	2	8	1294423	1294430	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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467	NC_017094	ATGG	2	8	1305346	1305353	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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474	NC_017094	TTTC	2	8	1312716	1312723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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476	NC_017094	TGCA	2	8	1314798	1314805	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_017094	GGAA	2	8	1321556	1321563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017094	GAAG	2	8	1325356	1325363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
483	NC_017094	CTGC	2	8	1326284	1326291	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
484	NC_017094	TGTC	2	8	1326297	1326304	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
485	NC_017094	TGGA	2	8	1329195	1329202	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
486	NC_017094	GATG	2	8	1329614	1329621	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
487	NC_017094	GGCG	2	8	1329629	1329636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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489	NC_017094	GGGA	2	8	1332758	1332765	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
490	NC_017094	GAAA	2	8	1333028	1333035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017094	AGGA	2	8	1333042	1333049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
492	NC_017094	GATA	2	8	1333133	1333140	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
493	NC_017094	AATC	2	8	1338810	1338817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
494	NC_017094	ATTG	2	8	1349680	1349687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
495	NC_017094	CAAA	2	8	1350008	1350015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_017094	TTTA	2	8	1350761	1350768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
497	NC_017094	CCTT	2	8	1351916	1351923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
498	NC_017094	TAAA	2	8	1352048	1352055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_017094	AAAT	2	8	1352120	1352127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017094	TGAT	2	8	1353054	1353061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

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