MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 plasmid pRahaq203

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017092	TCT	2	6	262	267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192419
2	NC_017092	GGA	2	6	268	273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192419
3	NC_017092	ATC	2	6	467	472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192419
4	NC_017092	CTG	2	6	540	545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192419
5	NC_017092	CCA	2	6	1542	1547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192420
6	NC_017092	CCT	2	6	1673	1678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192420
7	NC_017092	CTG	2	6	1686	1691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192420
8	NC_017092	AAC	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192420
9	NC_017092	TAA	2	6	1862	1867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192420
10	NC_017092	GTT	3	9	4123	4131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192421
11	NC_017092	TCA	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
12	NC_017092	AGA	2	6	4325	4330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192421
13	NC_017092	ATC	2	6	4454	4459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
14	NC_017092	TCA	2	6	4653	4658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192421
15	NC_017092	ATA	2	6	4713	4718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192421
16	NC_017092	ATA	2	6	4812	4817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192421
17	NC_017092	TCT	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192422
18	NC_017092	TCT	2	6	4956	4961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192422
19	NC_017092	AAC	2	6	5019	5024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192422
20	NC_017092	GGA	2	6	5029	5034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383192422
21	NC_017092	CAT	2	6	5050	5055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
22	NC_017092	GTT	2	6	5125	5130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192422
23	NC_017092	AAT	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383192422
24	NC_017092	CAT	2	6	5194	5199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
25	NC_017092	ATG	2	6	5338	5343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192422
26	NC_017092	TCA	2	6	5421	5426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
27	NC_017092	GAT	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192422
28	NC_017092	CAT	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192422
29	NC_017092	CCT	2	6	5559	5564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192422
30	NC_017092	ACA	2	6	5611	5616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192422
31	NC_017092	AGA	2	6	5737	5742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383192423
32	NC_017092	CAC	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192423
33	NC_017092	ACC	2	6	6029	6034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192423
34	NC_017092	ATT	2	6	6084	6089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
35	NC_017092	TGA	3	9	6207	6215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192423
36	NC_017092	ACA	2	6	6306	6311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383192423
37	NC_017092	TTG	2	6	6318	6323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383192423
38	NC_017092	TGG	2	6	6330	6335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383192423
39	NC_017092	TAT	2	6	6341	6346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
40	NC_017092	TAT	2	6	6362	6367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383192423
41	NC_017092	TGC	2	6	6406	6411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192423
42	NC_017092	GAT	2	6	6555	6560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192423
43	NC_017092	CGC	2	6	7259	7264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192424
44	NC_017092	ATC	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192424
45	NC_017092	GCT	2	6	7711	7716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383192425
46	NC_017092	CGC	2	6	7746	7751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
47	NC_017092	CGC	2	6	7809	7814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
48	NC_017092	GCC	3	9	7819	7827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192425
49	NC_017092	ATC	2	6	7849	7854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383192425
50	NC_017092	ACC	2	6	7871	7876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192425
51	NC_017092	CGC	2	6	8182	8187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192426
52	NC_017092	CAC	2	6	8240	8245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383192426
53	NC_017092	CCT	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383192426
54	NC_017092	TGA	2	6	8283	8288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383192426
55	NC_017092	ACG	2	6	8296	8301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383192426
56	NC_017092	TTC	2	6	8328	8333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383192426
57	NC_017092	CCG	2	6	8345	8350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383192426

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.