MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 583

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	ATTCA	2	10	8101	8110	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017079	TGAGA	2	10	13219	13228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017079	CGATA	2	10	14495	14504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017079	ATTGA	2	10	31994	32003	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017079	GATCC	2	10	33687	33696	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017079	AGCGA	2	10	33716	33725	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017079	ATGAA	2	10	38543	38552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017079	GTCAG	2	10	38715	38724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017079	ATTGA	2	10	54849	54858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017079	TCTCT	2	10	60625	60634	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017079	GAAGA	2	10	72695	72704	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017079	AGGCA	2	10	72883	72892	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017079	GGAAA	2	10	72963	72972	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017079	AACAA	2	10	91494	91503	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017079	TCGAT	2	10	91630	91639	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017079	ATTCA	2	10	96356	96365	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017079	GAAGG	2	10	117294	117303	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017079	CCCTC	2	10	126390	126399	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_017079	TCGAT	2	10	135967	135976	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017079	AAGAA	2	10	146957	146966	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017079	GCTGT	2	10	156863	156872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017079	ACTCT	2	10	167500	167509	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017079	CTTTG	2	10	201853	201862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017079	GAGGC	2	10	206247	206256	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017079	TCATC	2	10	210853	210862	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017079	CACAG	2	10	210931	210940	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017079	TAAAT	2	10	210980	210989	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017079	CTTTC	2	10	215807	215816	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017079	ATTGA	2	10	250330	250339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017079	AGTCG	2	10	264050	264059	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017079	GGTCC	2	10	275474	275483	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017079	AATTG	2	10	290699	290708	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017079	TGCGG	2	10	303911	303920	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017079	TGCCT	2	10	317574	317583	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_017079	CCTCG	2	10	319629	319638	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
36	NC_017079	CAGGC	2	10	328602	328611	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_017079	ATGCA	2	10	329739	329748	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017079	GAAAA	2	10	333613	333622	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017079	CAACC	2	10	334787	334796	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017079	CGCTC	2	10	345166	345175	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_017079	TAAAA	2	10	345183	345192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017079	AAATT	2	10	346682	346691	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017079	CGCTC	2	10	358699	358708	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_017079	CTGCG	2	10	379151	379160	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017079	TTTGT	2	10	379253	379262	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017079	CAGAA	2	10	387115	387124	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017079	CAGGC	2	10	417825	417834	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_017079	ACGCC	2	10	423104	423113	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_017079	TCAGG	2	10	424499	424508	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017079	AAAGG	2	10	452520	452529	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017079	GCAAA	2	10	452650	452659	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017079	TTCTT	2	10	454737	454746	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017079	TTCTT	2	10	477602	477611	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017079	TACAG	2	10	487361	487370	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017079	TAGAA	2	10	493371	493380	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017079	TGTCT	2	10	499604	499613	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017079	ATTGT	2	10	500094	500103	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017079	ACCAG	2	10	500956	500965	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017079	ATCAA	2	10	504604	504613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017079	CTCAT	2	10	513397	513406	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017079	CAAGA	2	10	515409	515418	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017079	GTTTT	2	10	521806	521815	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017079	GAGAA	2	10	535389	535398	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017079	GAAAA	2	10	537840	537849	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017079	TTGAT	2	10	550923	550932	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017079	AAGTA	2	10	559538	559547	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017079	TGCTA	2	10	567489	567498	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017079	ACTGT	2	10	583769	583778	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017079	CAACA	2	10	600639	600648	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_017079	TTTCG	2	10	601943	601952	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017079	AACAA	2	10	602031	602040	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017079	CTGCC	2	10	608363	608372	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
73	NC_017079	TGTTT	2	10	614315	614324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017079	CTCCA	2	10	618339	618348	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_017079	CAGGC	2	10	639507	639516	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_017079	CAGCG	2	10	661034	661043	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017079	CGCTG	2	10	661054	661063	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017079	GCGCT	2	10	661073	661082	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_017079	GTCAA	2	10	662405	662414	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017079	ATCCT	2	10	671825	671834	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017079	GCAAT	2	10	686638	686647	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017079	CCTGC	2	10	699779	699788	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_017079	TCAAT	2	10	699828	699837	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017079	TCATT	2	10	700492	700501	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017079	CCAAT	2	10	707397	707406	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_017079	TGAAA	2	10	715730	715739	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017079	AAATT	2	10	717921	717930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017079	TTGAT	2	10	723918	723927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017079	CTTCG	2	10	725424	725433	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_017079	CAACA	2	10	728694	728703	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017079	CCGAT	2	10	743166	743175	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017079	ATATC	2	10	746900	746909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017079	CGCAG	2	10	747323	747332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_017079	GCGCC	2	10	753005	753014	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_017079	CAGCG	2	10	760403	760412	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
96	NC_017079	GGAGG	2	10	789993	790002	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017079	ACCGG	2	10	792808	792817	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_017079	TTGCA	2	10	822213	822222	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017079	TCTCT	2	10	824437	824446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017079	TTTGC	2	10	833620	833629	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017079	CGATA	2	10	833634	833643	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017079	GGCAG	2	10	835199	835208	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017079	GAACA	2	10	836487	836496	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_017079	GCAAG	2	10	848091	848100	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017079	TGAAT	2	10	849931	849940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017079	CTCAT	2	10	860671	860680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_017079	TATGC	2	10	861321	861330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017079	CCAGC	2	10	861400	861409	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017079	GTCAT	2	10	867235	867244	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017079	GAGAA	2	10	889894	889903	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017079	GCTGG	2	10	895982	895991	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017079	TGATT	2	10	896537	896546	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017079	TTTGC	2	10	913407	913416	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017079	TTGAA	2	10	923294	923303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017079	GCAAA	2	10	928357	928366	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017079	AATCA	2	10	940745	940754	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017079	GGCAG	2	10	962833	962842	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017079	CTCCA	2	10	980699	980708	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017079	AGCGC	2	10	995186	995195	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_017079	GAAGA	2	10	1008116	1008125	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017079	CGCGC	2	10	1012057	1012066	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017079	CCTGT	2	10	1023683	1023692	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017079	CCATG	2	10	1029715	1029724	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_017079	TCTAT	2	10	1054771	1054780	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017079	GATTT	2	10	1054846	1054855	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017079	CCCAA	2	10	1055192	1055201	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_017079	TGATT	2	10	1071275	1071284	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017079	AGGCG	2	10	1081838	1081847	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017079	CATCG	2	10	1084649	1084658	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_017079	ATTGA	2	10	1117350	1117359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017079	TCAAT	2	10	1128137	1128146	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017079	TATGT	2	10	1132367	1132376	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017079	AAGTG	2	10	1142099	1142108	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017079	TTTGA	2	10	1156560	1156569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017079	TTCTT	2	10	1169593	1169602	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017079	GGTGA	2	10	1182257	1182266	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017079	TATGC	2	10	1186860	1186869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017079	GAACG	2	10	1204819	1204828	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017079	GGCCC	2	10	1205260	1205269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
140	NC_017079	GAAAG	2	10	1217217	1217226	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017079	CTTTG	2	10	1231073	1231082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017079	GACTC	2	10	1234557	1234566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_017079	CTGGC	2	10	1234629	1234638	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017079	GGGCC	2	10	1238919	1238928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_017079	CGGCG	2	10	1242400	1242409	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
146	NC_017079	ATAGA	2	10	1265278	1265287	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017079	CGAGA	2	10	1275643	1275652	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017079	TCGTG	2	10	1276781	1276790	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
149	NC_017079	CGTCA	2	10	1277103	1277112	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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151	NC_017079	CCGAA	2	10	1279935	1279944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017079	GACTT	2	10	1280154	1280163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_017079	GGCAT	2	10	1326894	1326903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_017079	GGCGC	2	10	1327452	1327461	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
156	NC_017079	TTTGA	2	10	1331884	1331893	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017079	CGCTG	2	10	1348252	1348261	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
159	NC_017079	TCATA	2	10	1352050	1352059	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_017079	GATAT	2	10	1371586	1371595	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017079	TTGTG	2	10	1377852	1377861	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017079	GGGGC	2	10	1377885	1377894	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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164	NC_017079	ACGCT	2	10	1389361	1389370	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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173	NC_017079	TCGAA	2	10	1511665	1511674	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_017079	GTATA	2	10	1572096	1572105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017079	CAGGT	2	10	1572603	1572612	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_017079	AGGGG	2	10	1585057	1585066	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017079	ATTCA	2	10	2030385	2030394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
263	NC_017079	GTATA	2	10	2066206	2066215	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017079	AGCGG	2	10	2066282	2066291	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_017079	GACAG	2	10	2126608	2126617	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
267	NC_017079	CAAAA	2	10	2139213	2139222	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_017079	GGCGC	2	10	2149473	2149482	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_017079	GACTG	2	10	2163443	2163452	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
271	NC_017079	TCATT	2	10	2163560	2163569	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_017079	TCGTT	2	10	2178571	2178580	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_017079	GCTAT	2	10	2211415	2211424	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
274	NC_017079	GATTG	2	10	2223809	2223818	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_017079	AGGGA	2	10	2233413	2233422	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
276	NC_017079	GGAGA	2	10	2250502	2250511	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
277	NC_017079	CGTCT	2	10	2250619	2250628	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
278	NC_017079	AATTT	2	10	2253742	2253751	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_017079	TGCGA	2	10	2281077	2281086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
280	NC_017079	CCCAG	2	10	2282517	2282526	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
281	NC_017079	TTACA	2	10	2296461	2296470	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_017079	TACGC	2	10	2315241	2315250	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_017079	TCATA	2	10	2318055	2318064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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