MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 14449

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	AGTA	2	8	382	389	50 %	25 %	25 %	0 %	383760956
2	NC_017079	ATGC	2	8	1009	1016	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
3	NC_017079	CATG	2	8	1020	1027	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
4	NC_017079	CTGG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	383760957
5	NC_017079	CAGC	2	8	1910	1917	25 %	0 %	25 %	50 %	383760957
6	NC_017079	CCTG	2	8	2122	2129	0 %	25 %	25 %	50 %	383760957
7	NC_017079	AAGC	2	8	2414	2421	50 %	0 %	25 %	25 %	383760957
8	NC_017079	GCCG	2	8	2713	2720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017079	TGGC	2	8	2787	2794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017079	CTGA	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017079	CAGA	2	8	3084	3091	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
12	NC_017079	GATG	2	8	3135	3142	25 %	25 %	50 %	0 %	383760958
13	NC_017079	GAAC	2	8	3321	3328	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
14	NC_017079	ACCT	2	8	3542	3549	25 %	25 %	0 %	50 %	383760958
15	NC_017079	GGCG	2	8	3936	3943	0 %	0 %	75 %	25 %	383760958
16	NC_017079	TTGA	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	383760959
17	NC_017079	GACC	2	8	4938	4945	25 %	0 %	25 %	50 %	383760959
18	NC_017079	GATC	2	8	5661	5668	25 %	25 %	25 %	25 %	383760959
19	NC_017079	GGAC	2	8	6144	6151	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
20	NC_017079	AGGC	2	8	6591	6598	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
21	NC_017079	CCTG	2	8	6833	6840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017079	CCTG	2	8	7931	7938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017079	TTTG	2	8	7998	8005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017079	TCCA	2	8	8032	8039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017079	CTGG	2	8	8532	8539	0 %	25 %	50 %	25 %	383760962
26	NC_017079	ATCG	2	8	8726	8733	25 %	25 %	25 %	25 %	383760963
27	NC_017079	CGCT	2	8	8820	8827	0 %	25 %	25 %	50 %	383760963
28	NC_017079	CGGT	2	8	8958	8965	0 %	25 %	50 %	25 %	383760963
29	NC_017079	GCCG	2	8	9206	9213	0 %	0 %	50 %	50 %	383760963
30	NC_017079	CGTT	2	8	9477	9484	0 %	50 %	25 %	25 %	383760963
31	NC_017079	AGCG	2	8	9654	9661	25 %	0 %	50 %	25 %	383760963
32	NC_017079	CGTG	2	8	9796	9803	0 %	25 %	50 %	25 %	383760963
33	NC_017079	TGAC	2	8	9844	9851	25 %	25 %	25 %	25 %	383760963
34	NC_017079	GCCG	2	8	10029	10036	0 %	0 %	50 %	50 %	383760964
35	NC_017079	CGGA	2	8	10180	10187	25 %	0 %	50 %	25 %	383760964
36	NC_017079	GGGC	2	8	10381	10388	0 %	0 %	75 %	25 %	383760964
37	NC_017079	CTGT	2	8	10446	10453	0 %	50 %	25 %	25 %	383760964
38	NC_017079	TCCT	2	8	10749	10756	0 %	50 %	0 %	50 %	383760964
39	NC_017079	GCAC	2	8	12302	12309	25 %	0 %	25 %	50 %	383760965
40	NC_017079	CCGC	2	8	12328	12335	0 %	0 %	25 %	75 %	383760965
41	NC_017079	GCAT	2	8	13067	13074	25 %	25 %	25 %	25 %	383760965
42	NC_017079	CATT	2	8	13131	13138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017079	CGTA	2	8	14224	14231	25 %	25 %	25 %	25 %	383760966
44	NC_017079	CCGG	2	8	14436	14443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017079	AAAC	2	8	14564	14571	75 %	0 %	0 %	25 %	383760967
46	NC_017079	CCGA	2	8	14936	14943	25 %	0 %	25 %	50 %	383760967
47	NC_017079	CCCG	2	8	15622	15629	0 %	0 %	25 %	75 %	383760967
48	NC_017079	GCAA	2	8	15761	15768	50 %	0 %	25 %	25 %	383760967
49	NC_017079	ACGC	2	8	16392	16399	25 %	0 %	25 %	50 %	383760969
50	NC_017079	ATCC	2	8	17074	17081	25 %	25 %	0 %	50 %	383760969
51	NC_017079	AATG	2	8	17200	17207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017079	ACGC	2	8	17404	17411	25 %	0 %	25 %	50 %	383760970
53	NC_017079	GCAG	2	8	17675	17682	25 %	0 %	50 %	25 %	383760970
54	NC_017079	CAGA	2	8	18094	18101	50 %	0 %	25 %	25 %	383760970
55	NC_017079	CTTG	2	8	18384	18391	0 %	50 %	25 %	25 %	383760970
56	NC_017079	CGGC	2	8	18558	18565	0 %	0 %	50 %	50 %	383760970
57	NC_017079	GCTG	2	8	19372	19379	0 %	25 %	50 %	25 %	383760970
58	NC_017079	AATC	2	8	20108	20115	50 %	25 %	0 %	25 %	383760971
59	NC_017079	GGGT	2	8	20975	20982	0 %	25 %	75 %	0 %	383760971
60	NC_017079	AAGC	2	8	21667	21674	50 %	0 %	25 %	25 %	383760972
61	NC_017079	CAGT	2	8	21874	21881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017079	ATGA	2	8	21945	21952	50 %	25 %	25 %	0 %	383760973
63	NC_017079	CGGC	2	8	22022	22029	0 %	0 %	50 %	50 %	383760973
64	NC_017079	TTCG	2	8	22154	22161	0 %	50 %	25 %	25 %	383760973
65	NC_017079	GCAC	2	8	22504	22511	25 %	0 %	25 %	50 %	383760973
66	NC_017079	CGTG	2	8	22515	22522	0 %	25 %	50 %	25 %	383760973
67	NC_017079	GCCC	2	8	22850	22857	0 %	0 %	25 %	75 %	383760974
68	NC_017079	GCAG	2	8	23001	23008	25 %	0 %	50 %	25 %	383760974
69	NC_017079	CGAA	2	8	23407	23414	50 %	0 %	25 %	25 %	383760974
70	NC_017079	CGGC	2	8	23866	23873	0 %	0 %	50 %	50 %	383760974
71	NC_017079	CTGG	2	8	23880	23887	0 %	25 %	50 %	25 %	383760974
72	NC_017079	GGCC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	383760975
73	NC_017079	AGCA	2	8	24478	24485	50 %	0 %	25 %	25 %	383760975
74	NC_017079	GCCA	2	8	25258	25265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017079	CTTC	2	8	25821	25828	0 %	50 %	0 %	50 %	383760977
76	NC_017079	GATG	2	8	26246	26253	25 %	25 %	50 %	0 %	383760977
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79	NC_017079	GGCG	2	8	27242	27249	0 %	0 %	75 %	25 %	383760979
80	NC_017079	GTCC	2	8	27458	27465	0 %	25 %	25 %	50 %	383760979
81	NC_017079	CAGC	2	8	27715	27722	25 %	0 %	25 %	50 %	383760980
82	NC_017079	CGAT	2	8	27747	27754	25 %	25 %	25 %	25 %	383760980
83	NC_017079	CGGT	2	8	27894	27901	0 %	25 %	50 %	25 %	383760980
84	NC_017079	GCAG	2	8	28448	28455	25 %	0 %	50 %	25 %	383760980
85	NC_017079	GAAT	2	8	28767	28774	50 %	25 %	25 %	0 %	383760980
86	NC_017079	GCGT	2	8	29206	29213	0 %	25 %	50 %	25 %	383760981
87	NC_017079	TTGA	2	8	31899	31906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017079	GGCA	2	8	32262	32269	25 %	0 %	50 %	25 %	383760984
89	NC_017079	GGCA	2	8	32313	32320	25 %	0 %	50 %	25 %	383760984
90	NC_017079	GCAA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	25 %	25 %	383760984
91	NC_017079	GCTG	2	8	32628	32635	0 %	25 %	50 %	25 %	383760984
92	NC_017079	TGGC	2	8	32750	32757	0 %	25 %	50 %	25 %	383760984
93	NC_017079	GGCA	2	8	33033	33040	25 %	0 %	50 %	25 %	383760984
94	NC_017079	CCAG	2	8	34537	34544	25 %	0 %	25 %	50 %	383760985
95	NC_017079	CTGC	2	8	34749	34756	0 %	25 %	25 %	50 %	383760985
96	NC_017079	GCTG	2	8	34799	34806	0 %	25 %	50 %	25 %	383760985
97	NC_017079	CGAT	2	8	35031	35038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017079	AACG	2	8	35736	35743	50 %	0 %	25 %	25 %	383760986
99	NC_017079	AGGC	2	8	35863	35870	25 %	0 %	50 %	25 %	383760986
100	NC_017079	CAAT	2	8	36044	36051	50 %	25 %	0 %	25 %	383760986
101	NC_017079	AATT	2	8	36072	36079	50 %	50 %	0 %	0 %	383760986
102	NC_017079	AGGA	2	8	36140	36147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017079	TGTC	2	8	36258	36265	0 %	50 %	25 %	25 %	383760987
104	NC_017079	GCAC	2	8	36592	36599	25 %	0 %	25 %	50 %	383760987
105	NC_017079	GAGC	2	8	36780	36787	25 %	0 %	50 %	25 %	383760987
106	NC_017079	CCTG	2	8	36980	36987	0 %	25 %	25 %	50 %	383760988
107	NC_017079	CGCC	2	8	37124	37131	0 %	0 %	25 %	75 %	383760988
108	NC_017079	GACG	2	8	37595	37602	25 %	0 %	50 %	25 %	383760988
109	NC_017079	GCGT	2	8	37619	37626	0 %	25 %	50 %	25 %	383760988
110	NC_017079	ATCT	2	8	38949	38956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017079	CTGG	2	8	39364	39371	0 %	25 %	50 %	25 %	383760990
112	NC_017079	ATCA	2	8	39421	39428	50 %	25 %	0 %	25 %	383760990
113	NC_017079	CGCT	2	8	39557	39564	0 %	25 %	25 %	50 %	383760990
114	NC_017079	CGCA	2	8	39755	39762	25 %	0 %	25 %	50 %	383760990
115	NC_017079	GAGC	2	8	39847	39854	25 %	0 %	50 %	25 %	383760990
116	NC_017079	GAGC	2	8	40174	40181	25 %	0 %	50 %	25 %	383760990
117	NC_017079	GGCT	2	8	40233	40240	0 %	25 %	50 %	25 %	383760990
118	NC_017079	CCGC	2	8	40686	40693	0 %	0 %	25 %	75 %	383760990
119	NC_017079	TCAC	2	8	40872	40879	25 %	25 %	0 %	50 %	383760990
120	NC_017079	AGCA	2	8	40922	40929	50 %	0 %	25 %	25 %	383760990
121	NC_017079	GGAA	2	8	41410	41417	50 %	0 %	50 %	0 %	383760991
122	NC_017079	GGGC	2	8	41512	41519	0 %	0 %	75 %	25 %	383760991
123	NC_017079	CTGG	2	8	41921	41928	0 %	25 %	50 %	25 %	383760991
124	NC_017079	ACCC	2	8	42686	42693	25 %	0 %	0 %	75 %	383760992
125	NC_017079	GATC	2	8	42996	43003	25 %	25 %	25 %	25 %	383760992
126	NC_017079	GGTT	2	8	43720	43727	0 %	50 %	50 %	0 %	383760992
127	NC_017079	TTCA	2	8	43946	43953	25 %	50 %	0 %	25 %	383760993
128	NC_017079	GCTC	2	8	44259	44266	0 %	25 %	25 %	50 %	383760993
129	NC_017079	GCGG	2	8	44287	44294	0 %	0 %	75 %	25 %	383760993
130	NC_017079	CGCA	2	8	44345	44352	25 %	0 %	25 %	50 %	383760993
131	NC_017079	ATTG	2	8	44476	44483	25 %	50 %	25 %	0 %	383760993
132	NC_017079	CGAG	2	8	44608	44615	25 %	0 %	50 %	25 %	383760993
133	NC_017079	AAAG	2	8	45127	45134	75 %	0 %	25 %	0 %	383760993
134	NC_017079	AGGG	2	8	45253	45260	25 %	0 %	75 %	0 %	383760994
135	NC_017079	CCGG	2	8	45369	45376	0 %	0 %	50 %	50 %	383760994
136	NC_017079	GCTT	2	8	45641	45648	0 %	50 %	25 %	25 %	383760994
137	NC_017079	TTGA	2	8	46060	46067	25 %	50 %	25 %	0 %	383760995
138	NC_017079	AGGT	2	8	46196	46203	25 %	25 %	50 %	0 %	383760995
139	NC_017079	AAAG	2	8	46481	46488	75 %	0 %	25 %	0 %	383760995
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