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Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 1873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	GCCG	2	8	2713	2720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017079	TGGC	2	8	2787	2794	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017079	CTGA	2	8	2845	2852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017079	CCTG	2	8	6833	6840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017079	CCTG	2	8	7931	7938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017079	TTTG	2	8	7998	8005	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017079	TCCA	2	8	8032	8039	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017079	CATT	2	8	13131	13138	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017079	CCGG	2	8	14436	14443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017079	AATG	2	8	17200	17207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017079	CAGT	2	8	21874	21881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017079	GCCA	2	8	25258	25265	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017079	TTGA	2	8	31899	31906	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017079	CGAT	2	8	35031	35038	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017079	AGGA	2	8	36140	36147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017079	ATCT	2	8	38949	38956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017079	ATCG	2	8	46531	46538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017079	GCAA	2	8	54839	54846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017079	CTTG	2	8	55183	55190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017079	CAGC	2	8	55206	55213	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017079	ATTG	2	8	58536	58543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017079	CGCA	2	8	72636	72643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017079	ATGG	2	8	75728	75735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017079	TGCT	2	8	91751	91758	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017079	CTTT	2	8	91765	91772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017079	TAAA	2	8	92557	92564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017079	GGAG	2	8	92626	92633	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017079	ATGA	2	8	92652	92659	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017079	TAAC	2	8	116615	116622	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017079	ACGC	2	8	116694	116701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017079	TGAA	2	8	116856	116863	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017079	TTGC	2	8	116920	116927	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017079	TGAT	2	8	117198	117205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017079	GACG	2	8	127142	127149	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017079	CGTG	2	8	135470	135477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017079	AGGG	2	8	135985	135992	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017079	GTGA	2	8	146236	146243	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017079	CCTG	2	8	146332	146339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017079	ATCC	2	8	153163	153170	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017079	AGAC	2	8	162498	162505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017079	AGAC	2	8	162615	162622	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017079	AAAT	2	8	164448	164455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017079	GATA	2	8	164515	164522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017079	TGCA	2	8	164525	164532	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017079	TGTT	2	8	166983	166990	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017079	TTCA	2	8	168370	168377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017079	CTCG	2	8	176480	176487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017079	GAAG	2	8	189021	189028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017079	TCAT	2	8	189510	189517	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017079	CGCT	2	8	201404	201411	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017079	GTCT	2	8	201712	201719	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017079	GAGG	2	8	201762	201769	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017079	GGCG	2	8	201814	201821	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017079	GGAG	2	8	201876	201883	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017079	CAAA	2	8	203522	203529	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017079	TGTT	2	8	205964	205971	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017079	CAAA	2	8	206045	206052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017079	CCTC	2	8	210964	210971	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_017079	TCGC	2	8	216057	216064	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017079	CGAC	2	8	221856	221863	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017079	GACT	2	8	226611	226618	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017079	GAGT	2	8	226659	226666	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017079	CGCA	2	8	232596	232603	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017079	GATT	2	8	232739	232746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017079	TCAA	2	8	232752	232759	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017079	AAAG	2	8	232761	232768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017079	TGAC	2	8	233736	233743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017079	GCCT	2	8	235799	235806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017079	TGCC	2	8	241043	241050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017079	GGGC	2	8	250322	250329	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017079	GCAT	2	8	250381	250388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017079	CATT	2	8	250458	250465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017079	GACT	2	8	252991	252998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017079	GAAA	2	8	270212	270219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017079	AATA	2	8	270700	270707	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017079	CAGA	2	8	275161	275168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017079	TAAA	2	8	275229	275236	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017079	CCAC	2	8	282474	282481	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_017079	TAGC	2	8	282516	282523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017079	TCCA	2	8	284062	284069	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017079	TAAA	2	8	285502	285509	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017079	GCTG	2	8	288891	288898	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017079	TGCC	2	8	289366	289373	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017079	TTAG	2	8	289574	289581	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017079	GTCG	2	8	291191	291198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017079	CCGG	2	8	291443	291450	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017079	CTTC	2	8	291581	291588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017079	CGTT	2	8	294130	294137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017079	GACA	2	8	304134	304141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017079	CGGC	2	8	308749	308756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017079	ATTC	2	8	311447	311454	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017079	GGTG	2	8	317402	317409	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017079	CGCA	2	8	321879	321886	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017079	AAAC	2	8	325307	325314	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017079	CTAT	2	8	327176	327183	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017079	GCTG	2	8	328476	328483	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017079	GCAA	2	8	328645	328652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_017079	TCCA	2	8	329652	329659	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017079	ATCA	2	8	329764	329771	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017079	CCTT	2	8	330979	330986	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017079	TAGA	2	8	333640	333647	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017079	CCCA	2	8	334859	334866	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_017079	AGCC	2	8	335437	335444	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017079	TGCG	2	8	335454	335461	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017079	CCCG	2	8	345112	345119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_017079	GATA	2	8	345864	345871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017079	CAGC	2	8	346761	346768	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017079	GAAC	2	8	353388	353395	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_017079	ATCA	2	8	358942	358949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_017079	AGAC	2	8	359085	359092	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_017079	GCAT	2	8	359134	359141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017079	AGCC	2	8	359814	359821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017079	TGCG	2	8	360491	360498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017079	CGAA	2	8	360693	360700	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017079	ACCA	2	8	363394	363401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017079	ATTT	2	8	367859	367866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017079	ACGA	2	8	378286	378293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017079	GGGC	2	8	381549	381556	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017079	AAGC	2	8	386997	387004	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017079	GATC	2	8	387720	387727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_017079	CGAA	2	8	387751	387758	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017079	TGCC	2	8	389677	389684	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017079	TGTC	2	8	391093	391100	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017079	TCGA	2	8	395749	395756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017079	TGCA	2	8	399982	399989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017079	ATTC	2	8	402473	402480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017079	CCTG	2	8	402506	402513	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017079	ATAG	2	8	404323	404330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017079	GCCT	2	8	405935	405942	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017079	AATA	2	8	411631	411638	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017079	ATGT	2	8	417964	417971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017079	ATCT	2	8	418058	418065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_017079	TTCC	2	8	418108	418115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017079	ATTT	2	8	418155	418162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017079	TTTC	2	8	420151	420158	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_017079	AACG	2	8	420339	420346	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017079	GTCT	2	8	420954	420961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017079	GTAA	2	8	422641	422648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017079	GTAA	2	8	422651	422658	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017079	TCGA	2	8	422951	422958	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017079	TTTG	2	8	423152	423159	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017079	TATC	2	8	423179	423186	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017079	CGGG	2	8	423261	423268	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017079	CATT	2	8	430128	430135	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017079	GCAT	2	8	435293	435300	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017079	CCCT	2	8	446419	446426	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_017079	TTTA	2	8	452627	452634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017079	CCAC	2	8	459797	459804	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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150	NC_017079	AAGG	2	8	469598	469605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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