MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 12576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2	NC_017079	ATGC	2	8	1009	1016	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
3	NC_017079	CATG	2	8	1020	1027	25 %	25 %	25 %	25 %	383760956
4	NC_017079	CTGG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	383760957
5	NC_017079	CAGC	2	8	1910	1917	25 %	0 %	25 %	50 %	383760957
6	NC_017079	CCTG	2	8	2122	2129	0 %	25 %	25 %	50 %	383760957
7	NC_017079	AAGC	2	8	2414	2421	50 %	0 %	25 %	25 %	383760957
8	NC_017079	CAGA	2	8	3084	3091	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
9	NC_017079	GATG	2	8	3135	3142	25 %	25 %	50 %	0 %	383760958
10	NC_017079	GAAC	2	8	3321	3328	50 %	0 %	25 %	25 %	383760958
11	NC_017079	ACCT	2	8	3542	3549	25 %	25 %	0 %	50 %	383760958
12	NC_017079	GGCG	2	8	3936	3943	0 %	0 %	75 %	25 %	383760958
13	NC_017079	TTGA	2	8	4822	4829	25 %	50 %	25 %	0 %	383760959
14	NC_017079	GACC	2	8	4938	4945	25 %	0 %	25 %	50 %	383760959
15	NC_017079	GATC	2	8	5661	5668	25 %	25 %	25 %	25 %	383760959
16	NC_017079	GGAC	2	8	6144	6151	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
17	NC_017079	AGGC	2	8	6591	6598	25 %	0 %	50 %	25 %	383760960
18	NC_017079	CTGG	2	8	8532	8539	0 %	25 %	50 %	25 %	383760962
19	NC_017079	ATCG	2	8	8726	8733	25 %	25 %	25 %	25 %	383760963
20	NC_017079	CGCT	2	8	8820	8827	0 %	25 %	25 %	50 %	383760963
21	NC_017079	CGGT	2	8	8958	8965	0 %	25 %	50 %	25 %	383760963
22	NC_017079	GCCG	2	8	9206	9213	0 %	0 %	50 %	50 %	383760963
23	NC_017079	CGTT	2	8	9477	9484	0 %	50 %	25 %	25 %	383760963
24	NC_017079	AGCG	2	8	9654	9661	25 %	0 %	50 %	25 %	383760963
25	NC_017079	CGTG	2	8	9796	9803	0 %	25 %	50 %	25 %	383760963
26	NC_017079	TGAC	2	8	9844	9851	25 %	25 %	25 %	25 %	383760963
27	NC_017079	GCCG	2	8	10029	10036	0 %	0 %	50 %	50 %	383760964
28	NC_017079	CGGA	2	8	10180	10187	25 %	0 %	50 %	25 %	383760964
29	NC_017079	GGGC	2	8	10381	10388	0 %	0 %	75 %	25 %	383760964
30	NC_017079	CTGT	2	8	10446	10453	0 %	50 %	25 %	25 %	383760964
31	NC_017079	TCCT	2	8	10749	10756	0 %	50 %	0 %	50 %	383760964
32	NC_017079	GCAC	2	8	12302	12309	25 %	0 %	25 %	50 %	383760965
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34	NC_017079	GCAT	2	8	13067	13074	25 %	25 %	25 %	25 %	383760965
35	NC_017079	CGTA	2	8	14224	14231	25 %	25 %	25 %	25 %	383760966
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37	NC_017079	CCGA	2	8	14936	14943	25 %	0 %	25 %	50 %	383760967
38	NC_017079	CCCG	2	8	15622	15629	0 %	0 %	25 %	75 %	383760967
39	NC_017079	GCAA	2	8	15761	15768	50 %	0 %	25 %	25 %	383760967
40	NC_017079	ACGC	2	8	16392	16399	25 %	0 %	25 %	50 %	383760969
41	NC_017079	ATCC	2	8	17074	17081	25 %	25 %	0 %	50 %	383760969
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47	NC_017079	GCTG	2	8	19372	19379	0 %	25 %	50 %	25 %	383760970
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50	NC_017079	AAGC	2	8	21667	21674	50 %	0 %	25 %	25 %	383760972
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53	NC_017079	TTCG	2	8	22154	22161	0 %	50 %	25 %	25 %	383760973
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60	NC_017079	CTGG	2	8	23880	23887	0 %	25 %	50 %	25 %	383760974
61	NC_017079	GGCC	2	8	24076	24083	0 %	0 %	50 %	50 %	383760975
62	NC_017079	AGCA	2	8	24478	24485	50 %	0 %	25 %	25 %	383760975
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67	NC_017079	GGCG	2	8	27242	27249	0 %	0 %	75 %	25 %	383760979
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70	NC_017079	CGAT	2	8	27747	27754	25 %	25 %	25 %	25 %	383760980
71	NC_017079	CGGT	2	8	27894	27901	0 %	25 %	50 %	25 %	383760980
72	NC_017079	GCAG	2	8	28448	28455	25 %	0 %	50 %	25 %	383760980
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77	NC_017079	GCAA	2	8	32396	32403	50 %	0 %	25 %	25 %	383760984
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80	NC_017079	GGCA	2	8	33033	33040	25 %	0 %	50 %	25 %	383760984
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104	NC_017079	AGCA	2	8	40922	40929	50 %	0 %	25 %	25 %	383760990
105	NC_017079	GGAA	2	8	41410	41417	50 %	0 %	50 %	0 %	383760991
106	NC_017079	GGGC	2	8	41512	41519	0 %	0 %	75 %	25 %	383760991
107	NC_017079	CTGG	2	8	41921	41928	0 %	25 %	50 %	25 %	383760991
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109	NC_017079	GATC	2	8	42996	43003	25 %	25 %	25 %	25 %	383760992
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112	NC_017079	GCTC	2	8	44259	44266	0 %	25 %	25 %	50 %	383760993
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119	NC_017079	CCGG	2	8	45369	45376	0 %	0 %	50 %	50 %	383760994
120	NC_017079	GCTT	2	8	45641	45648	0 %	50 %	25 %	25 %	383760994
121	NC_017079	TTGA	2	8	46060	46067	25 %	50 %	25 %	0 %	383760995
122	NC_017079	AGGT	2	8	46196	46203	25 %	25 %	50 %	0 %	383760995
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127	NC_017079	TCGT	2	8	47390	47397	0 %	50 %	25 %	25 %	383760996
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130	NC_017079	CTCG	2	8	48536	48543	0 %	25 %	25 %	50 %	383760998
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135	NC_017079	GCCA	2	8	51291	51298	25 %	0 %	25 %	50 %	383761001
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137	NC_017079	GGTC	2	8	51594	51601	0 %	25 %	50 %	25 %	383761001
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