MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Caldilinea aerophila DSM 14535 = NBRC 104270

Total Repeats: 77361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017079	TCA	2	6	92	97	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
2	NC_017079	CTA	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
3	NC_017079	CAT	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760956
4	NC_017079	CGT	2	6	184	189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
5	NC_017079	CGT	2	6	210	215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
6	NC_017079	TGC	2	6	237	242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
7	NC_017079	AGC	2	6	268	273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760956
8	NC_017079	CTG	2	6	302	307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
9	NC_017079	TGC	2	6	335	340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
10	NC_017079	CGG	2	6	495	500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760956
11	NC_017079	TGG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760956
12	NC_017079	GAA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760956
13	NC_017079	ACC	2	6	740	745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760956
14	NC_017079	CCA	2	6	787	792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760956
15	NC_017079	GAA	2	6	811	816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760956
16	NC_017079	GAG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760956
17	NC_017079	CAG	2	6	1041	1046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760956
18	NC_017079	TGG	2	6	1070	1075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760956
19	NC_017079	CGC	2	6	1122	1127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760956
20	NC_017079	CCG	2	6	1145	1150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760956
21	NC_017079	CGG	2	6	1165	1170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760956
22	NC_017079	AGG	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760956
23	NC_017079	TGC	2	6	1305	1310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760956
24	NC_017079	CAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017079	GGC	2	6	1722	1727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
26	NC_017079	GAC	2	6	1778	1783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
27	NC_017079	CGG	2	6	1820	1825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
28	NC_017079	GCG	2	6	1872	1877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
29	NC_017079	TGG	3	9	1984	1992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760957
30	NC_017079	GGC	2	6	2000	2005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
31	NC_017079	TGA	2	6	2071	2076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760957
32	NC_017079	AGA	2	6	2152	2157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760957
33	NC_017079	ACG	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
34	NC_017079	GTC	2	6	2271	2276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
35	NC_017079	GAA	3	9	2300	2308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760957
36	NC_017079	CCG	2	6	2332	2337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760957
37	NC_017079	CAT	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760957
38	NC_017079	CGG	2	6	2371	2376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760957
39	NC_017079	ACG	2	6	2443	2448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760957
40	NC_017079	GCT	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
41	NC_017079	GCT	2	6	2472	2477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760957
42	NC_017079	ACA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017079	CTC	2	6	2926	2931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760958
44	NC_017079	GCA	2	6	3049	3054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
45	NC_017079	CAT	2	6	3057	3062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
46	NC_017079	AGA	3	9	3108	3116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
47	NC_017079	CGC	2	6	3157	3162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760958
48	NC_017079	GAA	2	6	3181	3186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
49	NC_017079	CAG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
50	NC_017079	AGA	2	6	3306	3311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
51	NC_017079	TGC	2	6	3371	3376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760958
52	NC_017079	ATC	2	6	3475	3480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
53	NC_017079	CAT	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
54	NC_017079	TGG	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760958
55	NC_017079	CGA	2	6	3636	3641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
56	NC_017079	ATC	2	6	3655	3660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
57	NC_017079	AGC	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
58	NC_017079	GCA	2	6	3771	3776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
59	NC_017079	ATT	2	6	3790	3795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760958
60	NC_017079	AGA	2	6	3857	3862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
61	NC_017079	GGT	3	9	4089	4097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760958
62	NC_017079	TCA	2	6	4113	4118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760958
63	NC_017079	GCA	2	6	4159	4164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
64	NC_017079	CGA	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760958
65	NC_017079	AAG	2	6	4375	4380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760958
66	NC_017079	CGT	2	6	4422	4427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760958
67	NC_017079	CCA	2	6	4541	4546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760959
68	NC_017079	ATG	2	6	4565	4570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760959
69	NC_017079	AAC	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760959
70	NC_017079	GCG	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
71	NC_017079	GGC	2	6	4774	4779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
72	NC_017079	AAG	2	6	4796	4801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760959
73	NC_017079	GAG	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760959
74	NC_017079	GCC	2	6	4915	4920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
75	NC_017079	TCA	2	6	4955	4960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760959
76	NC_017079	CAT	2	6	4989	4994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760959
77	NC_017079	GCC	2	6	5058	5063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
78	NC_017079	CGC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760959
79	NC_017079	CAG	2	6	5326	5331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760959
80	NC_017079	CTG	2	6	5463	5468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760959
81	NC_017079	GCG	2	6	5477	5482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
82	NC_017079	CGG	2	6	5517	5522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
83	NC_017079	GCA	2	6	5534	5539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760959
84	NC_017079	GCG	2	6	5691	5696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
85	NC_017079	GGA	2	6	5706	5711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760959
86	NC_017079	TTC	2	6	5725	5730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760959
87	NC_017079	GAT	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760959
88	NC_017079	GGC	2	6	5787	5792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
89	NC_017079	CGG	2	6	5838	5843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760959
90	NC_017079	TCC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760959
91	NC_017079	GAG	2	6	6176	6181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
92	NC_017079	GGC	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760960
93	NC_017079	GGA	2	6	6394	6399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
94	NC_017079	CCG	2	6	6434	6439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
95	NC_017079	CCA	2	6	6440	6445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760960
96	NC_017079	CCG	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
97	NC_017079	TCA	2	6	6606	6611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760960
98	NC_017079	ATC	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760960
99	NC_017079	AGG	2	6	6771	6776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760960
100	NC_017079	CGC	2	6	6799	6804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760960
101	NC_017079	CTC	2	6	6857	6862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017079	CAT	2	6	7052	7057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760961
103	NC_017079	TCA	2	6	7088	7093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760961
104	NC_017079	TGC	2	6	7192	7197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760961
105	NC_017079	CCG	2	6	7237	7242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760961
106	NC_017079	TCA	2	6	7315	7320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760961
107	NC_017079	GGC	2	6	7329	7334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760961
108	NC_017079	CGG	2	6	7352	7357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760961
109	NC_017079	GTG	2	6	7386	7391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760961
110	NC_017079	GGC	2	6	7410	7415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760961
111	NC_017079	GAC	2	6	7421	7426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760961
112	NC_017079	TGC	2	6	7589	7594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760961
113	NC_017079	GAG	2	6	7644	7649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760961
114	NC_017079	GCG	2	6	7659	7664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760961
115	NC_017079	GGA	2	6	7727	7732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760961
116	NC_017079	TTC	2	6	7858	7863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017079	TGT	2	6	8008	8013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017079	ATG	2	6	8122	8127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760962
119	NC_017079	GCG	2	6	8141	8146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760962
120	NC_017079	GGA	2	6	8161	8166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760962
121	NC_017079	CGG	2	6	8273	8278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760962
122	NC_017079	CGA	2	6	8303	8308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760962
123	NC_017079	CAA	2	6	8474	8479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760962
124	NC_017079	GCA	2	6	8512	8517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760962
125	NC_017079	CGG	2	6	8526	8531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760962
126	NC_017079	AAG	2	6	8546	8551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760962
127	NC_017079	TCC	2	6	8625	8630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017079	CCG	2	6	8796	8801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760963
129	NC_017079	TCC	2	6	8805	8810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760963
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131	NC_017079	CCA	2	6	9463	9468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760963
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256	NC_017079	CTT	2	6	18784	18789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760970
257	NC_017079	CGA	2	6	18903	18908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760970
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280	NC_017079	GGA	2	6	20034	20039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_017079	CGA	2	6	20480	20485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760971
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