MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	TAAC	2	8	11	18	50 %	25 %	0 %	25 %	383760689
2	NC_017078	AAAG	2	8	81	88	75 %	0 %	25 %	0 %	383760689
3	NC_017078	CCTG	2	8	931	938	0 %	25 %	25 %	50 %	383760689
4	NC_017078	GCCA	2	8	1934	1941	25 %	0 %	25 %	50 %	383760690
5	NC_017078	CCAT	2	8	2010	2017	25 %	25 %	0 %	50 %	383760690
6	NC_017078	ATCA	2	8	3367	3374	50 %	25 %	0 %	25 %	383760691
7	NC_017078	ATCG	2	8	3520	3527	25 %	25 %	25 %	25 %	383760691
8	NC_017078	GATG	2	8	4726	4733	25 %	25 %	50 %	0 %	383760692
9	NC_017078	CAGG	2	8	5558	5565	25 %	0 %	50 %	25 %	383760692
10	NC_017078	CAAC	2	8	5695	5702	50 %	0 %	0 %	50 %	383760692
11	NC_017078	CCAT	2	8	7042	7049	25 %	25 %	0 %	50 %	383760693
12	NC_017078	ACGG	2	8	7219	7226	25 %	0 %	50 %	25 %	383760693
13	NC_017078	CAGC	2	8	7490	7497	25 %	0 %	25 %	50 %	383760693
14	NC_017078	GATG	2	8	7676	7683	25 %	25 %	50 %	0 %	383760693
15	NC_017078	TCGC	2	8	7717	7724	0 %	25 %	25 %	50 %	383760693
16	NC_017078	GACA	2	8	8065	8072	50 %	0 %	25 %	25 %	383760694
17	NC_017078	CTGA	2	8	8107	8114	25 %	25 %	25 %	25 %	383760694
18	NC_017078	GCAG	2	8	8463	8470	25 %	0 %	50 %	25 %	383760694
19	NC_017078	TGCC	2	8	8820	8827	0 %	25 %	25 %	50 %	383760694
20	NC_017078	GTCC	2	8	9585	9592	0 %	25 %	25 %	50 %	383760696
21	NC_017078	AGGC	2	8	10230	10237	25 %	0 %	50 %	25 %	383760696
22	NC_017078	TGCC	2	8	11376	11383	0 %	25 %	25 %	50 %	383760697
23	NC_017078	GACA	2	8	12050	12057	50 %	0 %	25 %	25 %	383760698
24	NC_017078	GATT	2	8	12871	12878	25 %	50 %	25 %	0 %	383760699
25	NC_017078	GATG	2	8	13975	13982	25 %	25 %	50 %	0 %	383760699
26	NC_017078	ATGG	2	8	13997	14004	25 %	25 %	50 %	0 %	383760699
27	NC_017078	TCCT	2	8	14841	14848	0 %	50 %	0 %	50 %	383760701
28	NC_017078	CTTT	2	8	15868	15875	0 %	75 %	0 %	25 %	383760701
29	NC_017078	GTCA	2	8	15888	15895	25 %	25 %	25 %	25 %	383760701
30	NC_017078	CAGC	2	8	16330	16337	25 %	0 %	25 %	50 %	383760702
31	NC_017078	TGTC	2	8	18961	18968	0 %	50 %	25 %	25 %	383760705
32	NC_017078	GCAG	2	8	19005	19012	25 %	0 %	50 %	25 %	383760705
33	NC_017078	CCTG	2	8	19081	19088	0 %	25 %	25 %	50 %	383760705
34	NC_017078	ATGT	2	8	19626	19633	25 %	50 %	25 %	0 %	383760706
35	NC_017078	GAGG	2	8	20005	20012	25 %	0 %	75 %	0 %	383760706
36	NC_017078	GGCA	2	8	20494	20501	25 %	0 %	50 %	25 %	383760707
37	NC_017078	TGGA	2	8	21506	21513	25 %	25 %	50 %	0 %	383760707
38	NC_017078	AAGG	2	8	21515	21522	50 %	0 %	50 %	0 %	383760707
39	NC_017078	ACCA	2	8	21548	21555	50 %	0 %	0 %	50 %	383760707
40	NC_017078	CCGG	2	8	21589	21596	0 %	0 %	50 %	50 %	383760707
41	NC_017078	GAAG	2	8	21832	21839	50 %	0 %	50 %	0 %	383760707
42	NC_017078	ATGT	2	8	22028	22035	25 %	50 %	25 %	0 %	383760707
43	NC_017078	ATGC	2	8	22724	22731	25 %	25 %	25 %	25 %	383760708
44	NC_017078	GCAG	2	8	23057	23064	25 %	0 %	50 %	25 %	383760709
45	NC_017078	TGGC	2	8	23220	23227	0 %	25 %	50 %	25 %	383760709
46	NC_017078	CAAT	2	8	24851	24858	50 %	25 %	0 %	25 %	383760710
47	NC_017078	TTCC	2	8	25658	25665	0 %	50 %	0 %	50 %	383760711
48	NC_017078	TACT	2	8	26450	26457	25 %	50 %	0 %	25 %	383760714
49	NC_017078	TGCC	2	8	27404	27411	0 %	25 %	25 %	50 %	383760716
50	NC_017078	ATCT	2	8	27941	27948	25 %	50 %	0 %	25 %	383760717
51	NC_017078	AATC	2	8	28803	28810	50 %	25 %	0 %	25 %	383760719
52	NC_017078	CGCA	2	8	29260	29267	25 %	0 %	25 %	50 %	383760719
53	NC_017078	CTTC	2	8	29330	29337	0 %	50 %	0 %	50 %	383760719
54	NC_017078	AAGG	2	8	29355	29362	50 %	0 %	50 %	0 %	383760719
55	NC_017078	GGAT	2	8	29576	29583	25 %	25 %	50 %	0 %	383760719
56	NC_017078	ATAA	2	8	29716	29723	75 %	25 %	0 %	0 %	383760719
57	NC_017078	AGGC	2	8	29901	29908	25 %	0 %	50 %	25 %	383760720
58	NC_017078	CTGG	2	8	29943	29950	0 %	25 %	50 %	25 %	383760720
59	NC_017078	CAAT	2	8	30029	30036	50 %	25 %	0 %	25 %	383760720
60	NC_017078	GTAA	2	8	30141	30148	50 %	25 %	25 %	0 %	383760720
61	NC_017078	CTGT	2	8	30568	30575	0 %	50 %	25 %	25 %	383760720
62	NC_017078	ATGT	2	8	31578	31585	25 %	50 %	25 %	0 %	383760722
63	NC_017078	TTCA	2	8	31746	31753	25 %	50 %	0 %	25 %	383760722
64	NC_017078	GAGG	2	8	31866	31873	25 %	0 %	75 %	0 %	383760722
65	NC_017078	CTTA	2	8	34253	34260	25 %	50 %	0 %	25 %	383760726
66	NC_017078	ACAA	2	8	34510	34517	75 %	0 %	0 %	25 %	383760726
67	NC_017078	TCCA	2	8	36314	36321	25 %	25 %	0 %	50 %	383760730
68	NC_017078	TCCA	2	8	36695	36702	25 %	25 %	0 %	50 %	383760730
69	NC_017078	GATG	2	8	37049	37056	25 %	25 %	50 %	0 %	383760731
70	NC_017078	ATCC	2	8	37062	37069	25 %	25 %	0 %	50 %	383760731
71	NC_017078	TGCT	2	8	37174	37181	0 %	50 %	25 %	25 %	383760731
72	NC_017078	ACAT	2	8	37308	37315	50 %	25 %	0 %	25 %	383760731
73	NC_017078	CCAG	2	8	38594	38601	25 %	0 %	25 %	50 %	383760732
74	NC_017078	CTTC	2	8	38736	38743	0 %	50 %	0 %	50 %	383760732
75	NC_017078	AAGG	2	8	39062	39069	50 %	0 %	50 %	0 %	383760732
76	NC_017078	TACC	2	8	40359	40366	25 %	25 %	0 %	50 %	383760733
77	NC_017078	GCCG	2	8	42140	42147	0 %	0 %	50 %	50 %	383760733
78	NC_017078	GAAG	2	8	43369	43376	50 %	0 %	50 %	0 %	383760734
79	NC_017078	CATT	2	8	43550	43557	25 %	50 %	0 %	25 %	383760734
80	NC_017078	CTGC	2	8	43864	43871	0 %	25 %	25 %	50 %	383760734
81	NC_017078	ATGC	2	8	44674	44681	25 %	25 %	25 %	25 %	383760736
82	NC_017078	ATCT	2	8	45052	45059	25 %	50 %	0 %	25 %	383760736
83	NC_017078	TCCT	2	8	45289	45296	0 %	50 %	0 %	50 %	383760736
84	NC_017078	TGAG	2	8	45716	45723	25 %	25 %	50 %	0 %	383760737
85	NC_017078	TGAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	25 %	0 %	383760737
86	NC_017078	GCAG	2	8	46191	46198	25 %	0 %	50 %	25 %	383760737
87	NC_017078	GAAA	2	8	47586	47593	75 %	0 %	25 %	0 %	383760739
88	NC_017078	TATG	2	8	47715	47722	25 %	50 %	25 %	0 %	383760739
89	NC_017078	CAGC	2	8	48326	48333	25 %	0 %	25 %	50 %	383760740
90	NC_017078	TATC	2	8	48428	48435	25 %	50 %	0 %	25 %	383760740
91	NC_017078	CTAT	2	8	48457	48464	25 %	50 %	0 %	25 %	383760740
92	NC_017078	AGGC	2	8	48496	48503	25 %	0 %	50 %	25 %	383760740
93	NC_017078	TCAA	2	8	49423	49430	50 %	25 %	0 %	25 %	383760742
94	NC_017078	CAAT	2	8	49742	49749	50 %	25 %	0 %	25 %	383760742
95	NC_017078	AGTA	2	8	49865	49872	50 %	25 %	25 %	0 %	383760742
96	NC_017078	AAGG	2	8	49968	49975	50 %	0 %	50 %	0 %	383760743
97	NC_017078	CAGT	2	8	50240	50247	25 %	25 %	25 %	25 %	383760743
98	NC_017078	GAAA	2	8	51108	51115	75 %	0 %	25 %	0 %	383760745
99	NC_017078	GCAG	2	8	51218	51225	25 %	0 %	50 %	25 %	383760745
100	NC_017078	GACA	2	8	51367	51374	50 %	0 %	25 %	25 %	383760745
101	NC_017078	GCCG	2	8	51770	51777	0 %	0 %	50 %	50 %	383760745
102	NC_017078	AAGC	2	8	53644	53651	50 %	0 %	25 %	25 %	383760747
103	NC_017078	TCAT	2	8	54536	54543	25 %	50 %	0 %	25 %	383760749
104	NC_017078	GGCT	2	8	54613	54620	0 %	25 %	50 %	25 %	383760749
105	NC_017078	TTTG	2	8	54993	55000	0 %	75 %	25 %	0 %	383760750
106	NC_017078	GTAT	2	8	55568	55575	25 %	50 %	25 %	0 %	383760751
107	NC_017078	ATCA	2	8	55679	55686	50 %	25 %	0 %	25 %	383760751
108	NC_017078	TATG	2	8	56418	56425	25 %	50 %	25 %	0 %	383760752
109	NC_017078	GCAG	2	8	56737	56744	25 %	0 %	50 %	25 %	383760752
110	NC_017078	TGCA	2	8	57515	57522	25 %	25 %	25 %	25 %	383760754
111	NC_017078	AGCA	2	8	58625	58632	50 %	0 %	25 %	25 %	383760755
112	NC_017078	AAAT	2	8	58863	58870	75 %	25 %	0 %	0 %	383760756
113	NC_017078	GACA	2	8	59952	59959	50 %	0 %	25 %	25 %	383760759
114	NC_017078	TTTA	2	8	59986	59993	25 %	75 %	0 %	0 %	383760759
115	NC_017078	CTGC	2	8	60085	60092	0 %	25 %	25 %	50 %	383760759
116	NC_017078	CAGC	2	8	60243	60250	25 %	0 %	25 %	50 %	383760759
117	NC_017078	CCCT	2	8	61031	61038	0 %	25 %	0 %	75 %	383760759
118	NC_017078	CTGA	2	8	61145	61152	25 %	25 %	25 %	25 %	383760759
119	NC_017078	CAGG	2	8	61747	61754	25 %	0 %	50 %	25 %	383760760
120	NC_017078	AAAC	2	8	62387	62394	75 %	0 %	0 %	25 %	383760761
121	NC_017078	GCAG	2	8	62504	62511	25 %	0 %	50 %	25 %	383760761
122	NC_017078	CTGG	2	8	62891	62898	0 %	25 %	50 %	25 %	383760761
123	NC_017078	CCTT	2	8	63090	63097	0 %	50 %	0 %	50 %	383760761
124	NC_017078	ATCA	2	8	63312	63319	50 %	25 %	0 %	25 %	383760761
125	NC_017078	TCTG	2	8	63475	63482	0 %	50 %	25 %	25 %	383760761
126	NC_017078	GGCC	2	8	63940	63947	0 %	0 %	50 %	50 %	383760762
127	NC_017078	CTGC	2	8	64508	64515	0 %	25 %	25 %	50 %	383760762
128	NC_017078	GAAG	2	8	64753	64760	50 %	0 %	50 %	0 %	383760762
129	NC_017078	AAAT	2	8	65705	65712	75 %	25 %	0 %	0 %	383760764
130	NC_017078	AACA	2	8	66129	66136	75 %	0 %	0 %	25 %	383760765
131	NC_017078	ATTG	2	8	66182	66189	25 %	50 %	25 %	0 %	383760765
132	NC_017078	GGTC	2	8	66462	66469	0 %	25 %	50 %	25 %	383760765
133	NC_017078	ATTC	2	8	66567	66574	25 %	50 %	0 %	25 %	383760765
134	NC_017078	AAGG	2	8	67303	67310	50 %	0 %	50 %	0 %	383760766
135	NC_017078	GGAT	2	8	67316	67323	25 %	25 %	50 %	0 %	383760766
136	NC_017078	AGCC	2	8	68163	68170	25 %	0 %	25 %	50 %	383760767
137	NC_017078	GCAG	2	8	69171	69178	25 %	0 %	50 %	25 %	383760767
138	NC_017078	AGCT	2	8	69270	69277	25 %	25 %	25 %	25 %	383760767
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