MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC1

Total Repeats: 3862

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017078	CAC	3	9	30	38	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
2	NC_017078	TGA	2	6	111	116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
3	NC_017078	AGG	2	6	140	145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760689
4	NC_017078	AAG	2	6	166	171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
5	NC_017078	CAA	3	9	198	206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
6	NC_017078	GCG	2	6	209	214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760689
7	NC_017078	AAC	2	6	222	227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
8	NC_017078	AGC	2	6	234	239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
9	NC_017078	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
10	NC_017078	AAG	2	6	259	264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
11	NC_017078	TGA	2	6	278	283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
12	NC_017078	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760689
13	NC_017078	ACT	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
14	NC_017078	GGT	2	6	526	531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
15	NC_017078	ATC	2	6	547	552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
16	NC_017078	CAT	2	6	558	563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
17	NC_017078	GAA	2	6	565	570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760689
18	NC_017078	AAC	2	6	625	630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760689
19	NC_017078	TCA	2	6	665	670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
20	NC_017078	CAC	2	6	732	737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760689
21	NC_017078	AGC	2	6	743	748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
22	NC_017078	TCC	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760689
23	NC_017078	TCA	2	6	887	892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760689
24	NC_017078	TGA	2	6	969	974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760689
25	NC_017078	GGT	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760689
26	NC_017078	AGC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760689
27	NC_017078	AAT	2	6	1004	1009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760690
28	NC_017078	ATG	2	6	1013	1018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
29	NC_017078	TCC	2	6	1061	1066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760690
30	NC_017078	GAA	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
31	NC_017078	GGC	2	6	1125	1130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
32	NC_017078	AGC	2	6	1189	1194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
33	NC_017078	CAG	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
34	NC_017078	GCC	2	6	1413	1418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
35	NC_017078	AAG	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
36	NC_017078	AGC	2	6	1675	1680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760690
37	NC_017078	CGG	2	6	1704	1709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760690
38	NC_017078	GCC	2	6	1802	1807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760690
39	NC_017078	ATG	2	6	1815	1820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760690
40	NC_017078	TCA	2	6	1866	1871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
41	NC_017078	GAA	2	6	1988	1993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760690
42	NC_017078	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
43	NC_017078	CAA	2	6	2092	2097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760690
44	NC_017078	TCA	2	6	2109	2114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760690
45	NC_017078	CAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
46	NC_017078	TGG	2	6	3476	3481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760691
47	NC_017078	CAG	2	6	3610	3615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
48	NC_017078	AGC	2	6	3675	3680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
49	NC_017078	GTA	2	6	3742	3747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760691
50	NC_017078	ACT	2	6	3748	3753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
51	NC_017078	CGA	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760691
52	NC_017078	TCC	2	6	3808	3813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760691
53	NC_017078	TCA	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760691
54	NC_017078	TTA	2	6	3891	3896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760691
55	NC_017078	CGG	2	6	3988	3993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760691
56	NC_017078	AGA	2	6	4046	4051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760691
57	NC_017078	GGA	2	6	4065	4070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760691
58	NC_017078	AAT	2	6	4090	4095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760691
59	NC_017078	GCT	2	6	4131	4136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760691
60	NC_017078	GCT	2	6	4586	4591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
61	NC_017078	GTG	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
62	NC_017078	CGG	2	6	4713	4718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
63	NC_017078	TGC	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
64	NC_017078	GGA	2	6	4783	4788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760692
65	NC_017078	ATC	2	6	4902	4907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760692
66	NC_017078	ATG	2	6	4919	4924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
67	NC_017078	GAA	2	6	5062	5067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
68	NC_017078	GGC	2	6	5099	5104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760692
69	NC_017078	AGC	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
70	NC_017078	TGG	2	6	5316	5321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760692
71	NC_017078	GAA	2	6	5360	5365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
72	NC_017078	GCA	2	6	5380	5385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
73	NC_017078	GCA	2	6	5403	5408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760692
74	NC_017078	TGA	2	6	5425	5430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760692
75	NC_017078	TGC	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760692
76	NC_017078	GAA	3	9	5714	5722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760692
77	NC_017078	AAT	2	6	6021	6026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760693
78	NC_017078	AGA	2	6	6031	6036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760693
79	NC_017078	ATC	2	6	6051	6056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
80	NC_017078	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760693
81	NC_017078	TGT	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760693
82	NC_017078	TGA	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
83	NC_017078	GCA	2	6	6448	6453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
84	NC_017078	TCG	2	6	6457	6462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
85	NC_017078	GTG	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
86	NC_017078	GAT	2	6	6573	6578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
87	NC_017078	TCA	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
88	NC_017078	AGC	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
89	NC_017078	CTG	2	6	6609	6614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
90	NC_017078	AGA	2	6	6674	6679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760693
91	NC_017078	TGC	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
92	NC_017078	TCA	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
93	NC_017078	TGG	2	6	6880	6885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
94	NC_017078	TGG	2	6	6917	6922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760693
95	NC_017078	GAG	2	6	7068	7073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760693
96	NC_017078	GCT	2	6	7086	7091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
97	NC_017078	GAT	2	6	7257	7262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
98	NC_017078	GAT	2	6	7301	7306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
99	NC_017078	ATC	2	6	7341	7346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
100	NC_017078	CAT	2	6	7418	7423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760693
101	NC_017078	CAG	2	6	7436	7441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
102	NC_017078	GAT	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
103	NC_017078	TGC	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
104	NC_017078	GCA	3	9	7538	7546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760693
105	NC_017078	ATG	2	6	7585	7590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760693
106	NC_017078	CTG	2	6	7902	7907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760693
107	NC_017078	GTG	2	6	8180	8185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760694
108	NC_017078	TGC	2	6	8313	8318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760694
109	NC_017078	CAG	4	12	8335	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760694
110	NC_017078	TGT	2	6	8397	8402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760694
111	NC_017078	CCT	2	6	8505	8510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760694
112	NC_017078	GCA	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760694
113	NC_017078	GGT	2	6	8617	8622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760694
114	NC_017078	GCC	2	6	8662	8667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760694
115	NC_017078	CGG	2	6	8693	8698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760694
116	NC_017078	TGC	2	6	8861	8866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760694
117	NC_017078	TGC	2	6	8870	8875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760694
118	NC_017078	GAA	2	6	9131	9136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760695
119	NC_017078	GAA	2	6	9183	9188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760695
120	NC_017078	AGA	2	6	9320	9325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760695
121	NC_017078	GAA	2	6	9643	9648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760696
122	NC_017078	GCC	2	6	9664	9669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760696
123	NC_017078	CTT	2	6	9709	9714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760696
124	NC_017078	ATG	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760696
125	NC_017078	CGG	2	6	9766	9771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760696
126	NC_017078	TTA	2	6	9776	9781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760696
127	NC_017078	CGG	2	6	9859	9864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760696
128	NC_017078	GCT	2	6	9967	9972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760696
129	NC_017078	GGC	2	6	10009	10014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760696
130	NC_017078	GCC	2	6	10022	10027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760696
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