MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	TGCTCC	2	12	1861	1872	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383760555
2	NC_017076	CATCTA	2	12	3213	3224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
3	NC_017076	AGCTCA	2	12	3816	3827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383760556
4	NC_017076	TCAAAA	2	12	6868	6879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383760561
5	NC_017076	GAAAGC	2	12	7403	7414	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383760561
6	NC_017076	CTTTTA	2	12	10410	10421	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	383760565
7	NC_017076	GGAAAT	2	12	13135	13146	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383760568
8	NC_017076	TTTGTA	2	12	29259	29270	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017076	AGTGGA	2	12	31624	31635	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383760589
10	NC_017076	CATTGG	2	12	33117	33128	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383760590
11	NC_017076	ATTTGA	2	12	39168	39179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383760601
12	NC_017076	AAAGGA	2	12	40710	40721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017076	AAGTTT	2	12	43654	43665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017076	TCCACA	2	12	45104	45115	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383760610
15	NC_017076	GCTCCG	2	12	48668	48679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383760614
16	NC_017076	CAAAAT	2	12	49827	49838	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	383760615
17	NC_017076	TTGCCG	2	12	50432	50443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760615
18	NC_017076	TCCTTG	2	12	52108	52119	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383760618
19	NC_017076	TGGCTG	2	12	55415	55426	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	383760622
20	NC_017076	GGCCCT	2	12	62523	62534	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	383760634
21	NC_017076	CCAGCA	2	12	63788	63799	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383760636
22	NC_017076	CTTTGC	2	12	69136	69147	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383760646
23	NC_017076	AATGGT	2	12	71916	71927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760649
24	NC_017076	AATTGC	2	12	80489	80500	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383760661
25	NC_017076	CACATC	2	12	84777	84788	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383760665
26	NC_017076	CATATT	2	12	90721	90732	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383760668

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.