MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	CAGCT	2	10	487	496	20 %	20 %	20 %	40 %	383760554
2	NC_017076	GCCCG	2	10	583	592	0 %	0 %	40 %	60 %	383760554
3	NC_017076	AAAAG	2	10	2941	2950	80 %	0 %	20 %	0 %	383760556
4	NC_017076	ATGTA	2	10	3635	3644	40 %	40 %	20 %	0 %	383760556
5	NC_017076	AATAT	2	10	4180	4189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017076	CAGGA	2	10	5335	5344	40 %	0 %	40 %	20 %	383760558
7	NC_017076	GAAAA	2	10	5430	5439	80 %	0 %	20 %	0 %	383760559
8	NC_017076	AAAGC	2	10	6509	6518	60 %	0 %	20 %	20 %	383760560
9	NC_017076	GCATG	2	10	11691	11700	20 %	20 %	40 %	20 %	383760566
10	NC_017076	CCGTT	2	10	12452	12461	0 %	40 %	20 %	40 %	383760566
11	NC_017076	ATTTC	2	10	13771	13780	20 %	60 %	0 %	20 %	383760568
12	NC_017076	GTCAA	2	10	13898	13907	40 %	20 %	20 %	20 %	383760569
13	NC_017076	TTTAC	2	10	14045	14054	20 %	60 %	0 %	20 %	383760569
14	NC_017076	TCATT	2	10	14574	14583	20 %	60 %	0 %	20 %	383760569
15	NC_017076	ACGGC	2	10	19235	19244	20 %	0 %	40 %	40 %	383760576
16	NC_017076	ACCTT	2	10	19427	19436	20 %	40 %	0 %	40 %	383760576
17	NC_017076	TATAG	2	10	19872	19881	40 %	40 %	20 %	0 %	383760576
18	NC_017076	TGTCA	2	10	20137	20146	20 %	40 %	20 %	20 %	383760577
19	NC_017076	GATGT	2	10	23413	23422	20 %	40 %	40 %	0 %	383760579
20	NC_017076	GCAAC	2	10	23775	23784	40 %	0 %	20 %	40 %	383760580
21	NC_017076	TATTT	2	10	26051	26060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017076	TTAGT	2	10	29294	29303	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017076	CATCG	2	10	31991	32000	20 %	20 %	20 %	40 %	383760589
24	NC_017076	GGGCT	2	10	32660	32669	0 %	20 %	60 %	20 %	383760590
25	NC_017076	TTGCG	2	10	33663	33672	0 %	40 %	40 %	20 %	383760591
26	NC_017076	ATTGA	2	10	36527	36536	40 %	40 %	20 %	0 %	383760597
27	NC_017076	ATCAA	2	10	36573	36582	60 %	20 %	0 %	20 %	383760598
28	NC_017076	AGCTG	2	10	38142	38151	20 %	20 %	40 %	20 %	383760600
29	NC_017076	TGACA	2	10	39339	39348	40 %	20 %	20 %	20 %	383760601
30	NC_017076	TAGAA	2	10	40695	40704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017076	GCTAT	2	10	45079	45088	20 %	40 %	20 %	20 %	383760610
32	NC_017076	CTAAG	2	10	47697	47706	40 %	20 %	20 %	20 %	383760612
33	NC_017076	GATTT	2	10	48278	48287	20 %	60 %	20 %	0 %	383760614
34	NC_017076	GGGGC	2	10	49762	49771	0 %	0 %	80 %	20 %	383760615
35	NC_017076	CATTT	2	10	50290	50299	20 %	60 %	0 %	20 %	383760615
36	NC_017076	TAATA	2	10	54103	54112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017076	AAGGA	2	10	54827	54836	60 %	0 %	40 %	0 %	383760621
38	NC_017076	TCTGC	2	10	59129	59138	0 %	40 %	20 %	40 %	383760628
39	NC_017076	TGATT	2	10	59646	59655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017076	GCAAG	2	10	59818	59827	40 %	0 %	40 %	20 %	383760630
41	NC_017076	AATAT	2	10	60510	60519	60 %	40 %	0 %	0 %	383760632
42	NC_017076	GTTAT	2	10	61978	61987	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017076	AGCTT	2	10	62747	62756	20 %	40 %	20 %	20 %	383760635
44	NC_017076	CTTCT	2	10	63908	63917	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017076	TTCAT	2	10	65434	65443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017076	ATTTG	2	10	65504	65513	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017076	AACAA	2	10	67622	67631	80 %	0 %	0 %	20 %	383760644
48	NC_017076	AATCA	2	10	69161	69170	60 %	20 %	0 %	20 %	383760646
49	NC_017076	CATTC	2	10	69837	69846	20 %	40 %	0 %	40 %	383760647
50	NC_017076	GAAAT	2	10	73200	73209	60 %	20 %	20 %	0 %	383760651
51	NC_017076	TCCAA	2	10	73365	73374	40 %	20 %	0 %	40 %	383760651
52	NC_017076	GGATG	2	10	74331	74340	20 %	20 %	60 %	0 %	383760653
53	NC_017076	ATGGT	2	10	79890	79899	20 %	40 %	40 %	0 %	383760660
54	NC_017076	CTGAA	2	10	80278	80287	40 %	20 %	20 %	20 %	383760661
55	NC_017076	CGGTC	2	10	80979	80988	0 %	20 %	40 %	40 %	383760662
56	NC_017076	ACGAT	2	10	81306	81315	40 %	20 %	20 %	20 %	383760662
57	NC_017076	TGCCG	2	10	86433	86442	0 %	20 %	40 %	40 %	383760666
58	NC_017076	TGCCG	2	10	88387	88396	0 %	20 %	40 %	40 %	383760668
59	NC_017076	CATTT	2	10	91312	91321	20 %	60 %	0 %	20 %	383760668
60	NC_017076	AATCA	2	10	91659	91668	60 %	20 %	0 %	20 %	383760669
61	NC_017076	TTTAC	2	10	92872	92881	20 %	60 %	0 %	20 %	383760669
62	NC_017076	GACAT	2	10	92991	93000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017076	ACAAA	2	10	93246	93255	80 %	0 %	0 %	20 %	383760670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.