MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 1250

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	CAA	2	6	198	203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383760554
2	NC_017076	CAG	2	6	230	235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
3	NC_017076	CCT	2	6	249	254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760554
4	NC_017076	CAT	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
5	NC_017076	ATC	3	9	448	456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
6	NC_017076	CAT	2	6	516	521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
7	NC_017076	CAT	2	6	531	536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760554
8	NC_017076	AAT	2	6	598	603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760554
9	NC_017076	GCA	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760554
10	NC_017076	GCT	2	6	735	740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760554
11	NC_017076	TTC	2	6	748	753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760554
12	NC_017076	TGA	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760554
13	NC_017076	GGT	2	6	948	953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760554
14	NC_017076	CAG	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760555
15	NC_017076	GAA	2	6	1118	1123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
16	NC_017076	TGA	2	6	1216	1221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
17	NC_017076	TAC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
18	NC_017076	ATG	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
19	NC_017076	CAT	2	6	1582	1587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760555
20	NC_017076	TCT	2	6	1629	1634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
21	NC_017076	TTC	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
22	NC_017076	ATG	2	6	1686	1691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760555
23	NC_017076	GTC	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760555
24	NC_017076	CTT	2	6	1769	1774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760555
25	NC_017076	GAA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760555
26	NC_017076	ACA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017076	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017076	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017076	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017076	CAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017076	CCA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017076	TTG	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017076	TAA	2	6	2687	2692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017076	TTG	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760556
35	NC_017076	ACG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
36	NC_017076	GTG	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760556
37	NC_017076	TCC	2	6	3095	3100	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760556
38	NC_017076	GAT	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
39	NC_017076	TCT	2	6	3298	3303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
40	NC_017076	CTG	2	6	3347	3352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760556
41	NC_017076	CTT	2	6	3387	3392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760556
42	NC_017076	CCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760556
43	NC_017076	AAG	2	6	3511	3516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
44	NC_017076	GAT	2	6	3607	3612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
45	NC_017076	CAT	2	6	3615	3620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760556
46	NC_017076	TGA	2	6	3756	3761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760556
47	NC_017076	TTA	2	6	3858	3863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
48	NC_017076	AGC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760556
49	NC_017076	AAG	2	6	4003	4008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760556
50	NC_017076	ATT	2	6	4092	4097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760556
51	NC_017076	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017076	TAA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017076	TAT	2	6	4202	4207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760557
54	NC_017076	ACG	2	6	4219	4224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760557
55	NC_017076	GAA	2	6	4260	4265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
56	NC_017076	AAG	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
57	NC_017076	CAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760557
58	NC_017076	GAA	2	6	4344	4349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
59	NC_017076	GAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760557
60	NC_017076	CAT	3	9	4514	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017076	GTT	2	6	4540	4545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760558
62	NC_017076	CTA	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
63	NC_017076	CAC	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
64	NC_017076	GCA	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760558
65	NC_017076	TCA	2	6	4738	4743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760558
66	NC_017076	ACC	2	6	4991	4996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760558
67	NC_017076	AAG	2	6	5018	5023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760558
68	NC_017076	ATT	2	6	5352	5357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760558
69	NC_017076	CAG	2	6	5608	5613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760559
70	NC_017076	TCA	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760560
71	NC_017076	GCC	2	6	5724	5729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
72	NC_017076	CGC	2	6	5767	5772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
73	NC_017076	AGG	3	9	5773	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383760560
74	NC_017076	CTG	2	6	5849	5854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
75	NC_017076	TGA	2	6	5896	5901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760560
76	NC_017076	TGG	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760560
77	NC_017076	GCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760560
78	NC_017076	ATA	2	6	6098	6103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760560
79	NC_017076	ATT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760560
80	NC_017076	CAC	2	6	6290	6295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
81	NC_017076	TCC	2	6	6339	6344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760560
82	NC_017076	CTG	2	6	6364	6369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
83	NC_017076	CAC	2	6	6391	6396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760560
84	NC_017076	GCC	2	6	6467	6472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760560
85	NC_017076	GCT	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760560
86	NC_017076	ATC	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017076	CAG	3	9	6656	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017076	CTT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017076	TGC	3	9	6738	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017076	CTT	2	6	6755	6760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017076	CCA	2	6	6856	6861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
92	NC_017076	CAC	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
93	NC_017076	GCC	2	6	7089	7094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
94	NC_017076	CAC	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760561
95	NC_017076	CGC	2	6	7213	7218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
96	NC_017076	CCG	2	6	7245	7250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383760561
97	NC_017076	CCT	2	6	7417	7422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760561
98	NC_017076	ATT	2	6	7464	7469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760561
99	NC_017076	CGT	2	6	7576	7581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
100	NC_017076	CAT	2	6	7640	7645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
101	NC_017076	CGG	2	6	7730	7735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760561
102	NC_017076	TAA	2	6	7750	7755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
103	NC_017076	TGG	2	6	7804	7809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760561
104	NC_017076	AAG	2	6	7932	7937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760561
105	NC_017076	CAT	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
106	NC_017076	GAT	3	9	8003	8011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760561
107	NC_017076	TGC	2	6	8050	8055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760561
108	NC_017076	AAT	2	6	8096	8101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760561
109	NC_017076	ATC	2	6	8148	8153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760561
110	NC_017076	TTG	2	6	8195	8200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760561
111	NC_017076	TCT	2	6	8311	8316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760562
112	NC_017076	ATC	2	6	8345	8350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
113	NC_017076	ATC	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
114	NC_017076	TCC	2	6	8673	8678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760562
115	NC_017076	TGT	2	6	8704	8709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760562
116	NC_017076	CCA	2	6	8815	8820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760562
117	NC_017076	GTA	2	6	8828	8833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383760562
118	NC_017076	TCC	2	6	8907	8912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760562
119	NC_017076	CCA	2	6	9067	9072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383760562
120	NC_017076	TCA	2	6	9073	9078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760562
121	NC_017076	CTA	2	6	9403	9408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017076	TTG	2	6	9458	9463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760563
123	NC_017076	TCT	2	6	9468	9473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
124	NC_017076	CAT	2	6	9487	9492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
125	NC_017076	ATC	2	6	9525	9530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
126	NC_017076	TCA	2	6	9633	9638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
127	NC_017076	ATA	2	6	9666	9671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760563
128	NC_017076	ATC	2	6	9708	9713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760563
129	NC_017076	TTC	3	9	9722	9730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
130	NC_017076	TAA	2	6	9743	9748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760563
131	NC_017076	AGA	2	6	9923	9928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760563
132	NC_017076	TAT	2	6	9995	10000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760563
133	NC_017076	CTG	2	6	10023	10028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760563
134	NC_017076	TCT	2	6	10039	10044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383760563
135	NC_017076	TCC	2	6	10046	10051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017076	TTC	2	6	10163	10168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017076	CCA	2	6	10180	10185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017076	CTG	2	6	10396	10401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760565
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141	NC_017076	TCC	2	6	10559	10564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760565
142	NC_017076	CAG	2	6	10570	10575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760565
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154	NC_017076	ATC	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017076	ATA	2	6	11804	11809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383760566
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161	NC_017076	CAG	2	6	12625	12630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_017076	CAT	2	6	12661	12666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760567
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240	NC_017076	GAG	2	6	17864	17869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_017076	CAT	2	6	18756	18761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760576
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253	NC_017076	AGC	2	6	18943	18948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760576
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257	NC_017076	CAT	2	6	19203	19208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760576
258	NC_017076	GCG	2	6	19507	19512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760576
259	NC_017076	TCA	2	6	19996	20001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383760577
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379	NC_017076	CAG	2	6	29397	29402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383760587
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384	NC_017076	TCC	2	6	29577	29582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383760587
385	NC_017076	AGA	2	6	29601	29606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760587
386	NC_017076	GAA	2	6	29640	29645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760587
387	NC_017076	CGT	2	6	29885	29890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383760587
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391	NC_017076	TGG	2	6	30197	30202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760587
392	NC_017076	AAG	2	6	30235	30240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383760587
393	NC_017076	TAT	2	6	30250	30255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760587
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400	NC_017076	TGT	2	6	30690	30695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383760587
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405	NC_017076	TAT	2	6	31180	31185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383760589
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416	NC_017076	GCG	2	6	32230	32235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760590
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427	NC_017076	TGG	2	6	32864	32869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760590
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454	NC_017076	GAA	2	6	34566	34571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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463	NC_017076	TTA	2	6	35565	35570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_017076	TGG	2	6	35661	35666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383760596
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499	NC_017076	TGA	2	6	39606	39611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017076	GGC	2	6	39756	39761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383760602

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