MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 155

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	ACA	2	6	2103	2108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017076	ATT	2	6	2170	2175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017076	CAA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017076	TTC	2	6	2199	2204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017076	CAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017076	CCA	2	6	2551	2556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017076	TTG	2	6	2645	2650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017076	TAA	2	6	2687	2692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017076	GAA	2	6	4119	4124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017076	TAA	2	6	4174	4179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017076	CAT	3	9	4514	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017076	ATC	2	6	6639	6644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017076	CAG	3	9	6656	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017076	CTT	2	6	6683	6688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017076	TGC	3	9	6738	6746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017076	CTT	2	6	6755	6760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017076	CTA	2	6	9403	9408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017076	TCC	2	6	10046	10051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017076	TTC	2	6	10163	10168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017076	CCA	2	6	10180	10185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017076	ATC	2	6	11607	11612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017076	CAG	2	6	12625	12630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017076	CTC	2	6	13788	13793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017076	CAA	2	6	13835	13840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017076	CTT	2	6	15055	15060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017076	GCC	2	6	15458	15463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017076	TGC	2	6	16998	17003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017076	GCC	2	6	17752	17757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017076	CAG	2	6	17798	17803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017076	GCT	2	6	17814	17819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017076	GAG	2	6	17864	17869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017076	TAT	2	6	23112	23117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017076	TAA	2	6	23156	23161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017076	GCT	2	6	23168	23173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017076	CTG	2	6	23231	23236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017076	ATG	2	6	23243	23248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017076	CCT	2	6	23632	23637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017076	ACT	2	6	23671	23676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017076	TTG	2	6	23689	23694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017076	TAT	2	6	23735	23740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017076	AGT	2	6	23744	23749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017076	GCT	2	6	25786	25791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017076	GAA	2	6	25796	25801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017076	CTG	2	6	25809	25814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017076	TTC	2	6	25909	25914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017076	TGA	2	6	25955	25960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017076	TGT	2	6	26000	26005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017076	TAA	2	6	26075	26080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017076	TTG	2	6	26183	26188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017076	ATA	2	6	26220	26225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017076	AGA	2	6	28503	28508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017076	AAT	2	6	28531	28536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017076	GGA	2	6	28582	28587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017076	ATA	3	9	29220	29228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017076	ATC	2	6	29233	29238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017076	GAA	2	6	34566	34571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017076	CGG	2	6	35535	35540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017076	TTA	2	6	35565	35570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017076	GAA	2	6	36966	36971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017076	TGA	2	6	39606	39611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017076	CAG	2	6	40663	40668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017076	GGA	2	6	41684	41689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017076	GAC	2	6	41693	41698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017076	AGG	2	6	41704	41709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017076	GCT	2	6	42960	42965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017076	GCT	2	6	43641	43646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017076	TTA	2	6	43647	43652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017076	TTA	2	6	44687	44692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017076	TGC	2	6	44731	44736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017076	GAA	3	9	44744	44752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017076	GTT	2	6	47189	47194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017076	GAC	2	6	47241	47246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017076	CTG	2	6	47281	47286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017076	ACT	2	6	47313	47318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017076	ATG	2	6	47425	47430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017076	TCC	2	6	50889	50894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017076	TAT	2	6	51439	51444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017076	AGT	2	6	51543	51548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017076	CCT	2	6	52548	52553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017076	GAT	2	6	54088	54093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017076	AGC	2	6	54966	54971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017076	GAA	2	6	55626	55631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017076	AGC	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017076	CAA	2	6	57097	57102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017076	GAG	2	6	57128	57133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017076	AGC	2	6	57990	57995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017076	GCC	2	6	58024	58029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017076	ATA	2	6	58055	58060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017076	ACA	2	6	58149	58154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017076	ATT	2	6	58172	58177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017076	ATC	2	6	58233	58238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017076	TAT	2	6	58277	58282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017076	TCT	2	6	58360	58365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017076	CTT	2	6	59306	59311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017076	CCT	2	6	59639	59644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017076	AGA	2	6	59668	59673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017076	TTC	2	6	59709	59714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017076	ATA	2	6	59763	59768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017076	AAT	2	6	60024	60029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017076	TAA	2	6	60060	60065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017076	CCT	2	6	60329	60334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_017076	AAC	2	6	61016	61021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017076	GCT	2	6	61097	61102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017076	TTG	2	6	61143	61148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017076	ATA	2	6	61158	61163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017076	CCG	2	6	61230	61235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017076	GTC	2	6	61425	61430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017076	TAA	2	6	61495	61500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017076	TAA	2	6	61508	61513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017076	AGA	2	6	61774	61779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017076	GTC	2	6	62127	62132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017076	TCC	3	9	64490	64498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_017076	TAT	2	6	65455	65460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017076	ATG	2	6	65522	65527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017076	GAG	2	6	65567	65572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017076	TAA	2	6	66055	66060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017076	CCT	2	6	67448	67453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_017076	CAC	2	6	67498	67503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017076	GCC	2	6	68824	68829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017076	GGC	2	6	68861	68866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017076	TCC	2	6	70399	70404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017076	CAA	2	6	71232	71237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017076	ACA	2	6	71248	71253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017076	CTA	2	6	71282	71287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017076	TGG	2	6	71290	71295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017076	CAA	2	6	71343	71348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017076	AGC	2	6	71374	71379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017076	TAA	2	6	72065	72070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017076	TAA	2	6	72080	72085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017076	TTG	2	6	72100	72105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017076	CAT	2	6	72110	72115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017076	CCT	2	6	73471	73476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017076	CTT	2	6	75226	75231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017076	CAA	2	6	75254	75259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017076	CAA	2	6	75280	75285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017076	CCT	2	6	75411	75416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017076	GAA	2	6	75427	75432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017076	CTG	2	6	75468	75473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017076	AGG	2	6	75501	75506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017076	AGC	3	9	75980	75988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017076	TAT	2	6	76050	76055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017076	GCA	2	6	76196	76201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017076	TGT	2	6	78144	78149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017076	TCC	2	6	78342	78347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017076	TCC	3	9	80170	80178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017076	TAT	2	6	80187	80192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017076	GCA	2	6	80207	80212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017076	TAA	2	6	81413	81418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017076	CTT	2	6	81961	81966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017076	CTC	2	6	84963	84968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_017076	GCC	2	6	92951	92956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_017076	AAT	2	6	92974	92979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017076	ACG	2	6	93045	93050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017076	AGG	2	6	93055	93060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017076	ACC	2	6	94186	94191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.