MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC2

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017076	TC	3	6	306	311	0 %	50 %	0 %	50 %	383760554
2	NC_017076	TA	3	6	568	573	50 %	50 %	0 %	0 %	383760554
3	NC_017076	AG	3	6	1500	1505	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
4	NC_017076	GA	3	6	1570	1575	50 %	0 %	50 %	0 %	383760555
5	NC_017076	CT	3	6	1879	1884	0 %	50 %	0 %	50 %	383760555
6	NC_017076	AC	3	6	2731	2736	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
7	NC_017076	AG	3	6	2790	2795	50 %	0 %	50 %	0 %	383760556
8	NC_017076	CA	3	6	2826	2831	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
9	NC_017076	AC	3	6	3369	3374	50 %	0 %	0 %	50 %	383760556
10	NC_017076	CT	3	6	6425	6430	0 %	50 %	0 %	50 %	383760560
11	NC_017076	GA	3	6	7676	7681	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
12	NC_017076	AG	3	6	7740	7745	50 %	0 %	50 %	0 %	383760561
13	NC_017076	TC	3	6	8349	8354	0 %	50 %	0 %	50 %	383760562
14	NC_017076	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	383760562
15	NC_017076	TA	3	6	10373	10378	50 %	50 %	0 %	0 %	383760564
16	NC_017076	AT	3	6	10497	10502	50 %	50 %	0 %	0 %	383760565
17	NC_017076	CA	3	6	11763	11768	50 %	0 %	0 %	50 %	383760566
18	NC_017076	AT	3	6	16373	16378	50 %	50 %	0 %	0 %	383760572
19	NC_017076	GC	3	6	17520	17525	0 %	0 %	50 %	50 %	383760574
20	NC_017076	GA	3	6	18081	18086	50 %	0 %	50 %	0 %	383760575
21	NC_017076	CT	3	6	18353	18358	0 %	50 %	0 %	50 %	383760575
22	NC_017076	TC	3	6	18422	18427	0 %	50 %	0 %	50 %	383760575
23	NC_017076	AT	4	8	18969	18976	50 %	50 %	0 %	0 %	383760576
24	NC_017076	TG	3	6	19044	19049	0 %	50 %	50 %	0 %	383760576
25	NC_017076	TA	3	6	19827	19832	50 %	50 %	0 %	0 %	383760576
26	NC_017076	CA	3	6	20489	20494	50 %	0 %	0 %	50 %	383760577
27	NC_017076	TA	3	6	20954	20959	50 %	50 %	0 %	0 %	383760577
28	NC_017076	GA	4	8	20993	21000	50 %	0 %	50 %	0 %	383760577
29	NC_017076	TC	3	6	21780	21785	0 %	50 %	0 %	50 %	383760578
30	NC_017076	TC	3	6	22825	22830	0 %	50 %	0 %	50 %	383760578
31	NC_017076	AC	3	6	22875	22880	50 %	0 %	0 %	50 %	383760578
32	NC_017076	AT	3	6	23785	23790	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
33	NC_017076	AT	3	6	24101	24106	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
34	NC_017076	TA	4	8	24402	24409	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
35	NC_017076	AT	3	6	24892	24897	50 %	50 %	0 %	0 %	383760580
36	NC_017076	CG	3	6	25595	25600	0 %	0 %	50 %	50 %	383760581
37	NC_017076	GA	3	6	26517	26522	50 %	0 %	50 %	0 %	383760582
38	NC_017076	AT	3	6	29730	29735	50 %	50 %	0 %	0 %	383760587
39	NC_017076	AT	3	6	30765	30770	50 %	50 %	0 %	0 %	383760588
40	NC_017076	TG	3	6	32052	32057	0 %	50 %	50 %	0 %	383760589
41	NC_017076	TA	3	6	34376	34381	50 %	50 %	0 %	0 %	383760592
42	NC_017076	AT	3	6	34427	34432	50 %	50 %	0 %	0 %	383760592
43	NC_017076	GT	3	6	36288	36293	0 %	50 %	50 %	0 %	383760597
44	NC_017076	TG	3	6	38038	38043	0 %	50 %	50 %	0 %	383760600
45	NC_017076	AT	3	6	38690	38695	50 %	50 %	0 %	0 %	383760601
46	NC_017076	CA	3	6	39862	39867	50 %	0 %	0 %	50 %	383760602
47	NC_017076	GA	3	6	40156	40161	50 %	0 %	50 %	0 %	383760602
48	NC_017076	TA	3	6	41571	41576	50 %	50 %	0 %	0 %	383760603
49	NC_017076	TG	3	6	41905	41910	0 %	50 %	50 %	0 %	383760604
50	NC_017076	AT	3	6	42017	42022	50 %	50 %	0 %	0 %	383760605
51	NC_017076	AT	3	6	43718	43723	50 %	50 %	0 %	0 %	383760608
52	NC_017076	GA	3	6	44848	44853	50 %	0 %	50 %	0 %	383760610
53	NC_017076	AT	3	6	44923	44928	50 %	50 %	0 %	0 %	383760610
54	NC_017076	GT	3	6	45174	45179	0 %	50 %	50 %	0 %	383760610
55	NC_017076	TA	3	6	45185	45190	50 %	50 %	0 %	0 %	383760610
56	NC_017076	AG	3	6	45879	45884	50 %	0 %	50 %	0 %	383760611
57	NC_017076	GA	3	6	46267	46272	50 %	0 %	50 %	0 %	383760611
58	NC_017076	AT	3	6	48108	48113	50 %	50 %	0 %	0 %	383760613
59	NC_017076	TG	3	6	50699	50704	0 %	50 %	50 %	0 %	383760616
60	NC_017076	GA	3	6	51067	51072	50 %	0 %	50 %	0 %	383760617
61	NC_017076	GA	3	6	51362	51367	50 %	0 %	50 %	0 %	383760617
62	NC_017076	CA	3	6	54281	54286	50 %	0 %	0 %	50 %	383760621
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64	NC_017076	TA	3	6	60805	60810	50 %	50 %	0 %	0 %	383760632
65	NC_017076	CT	3	6	62218	62223	0 %	50 %	0 %	50 %	383760634
66	NC_017076	TA	3	6	63152	63157	50 %	50 %	0 %	0 %	383760636
67	NC_017076	AT	3	6	65409	65414	50 %	50 %	0 %	0 %	383760639
68	NC_017076	AT	3	6	66701	66706	50 %	50 %	0 %	0 %	383760642
69	NC_017076	CT	3	6	68116	68121	0 %	50 %	0 %	50 %	383760645
70	NC_017076	AT	3	6	69263	69268	50 %	50 %	0 %	0 %	383760646
71	NC_017076	AT	5	10	69959	69968	50 %	50 %	0 %	0 %	383760647
72	NC_017076	AG	3	6	70097	70102	50 %	0 %	50 %	0 %	383760647
73	NC_017076	AT	3	6	71162	71167	50 %	50 %	0 %	0 %	383760648
74	NC_017076	TA	4	8	71450	71457	50 %	50 %	0 %	0 %	383760649
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76	NC_017076	TG	3	6	72728	72733	0 %	50 %	50 %	0 %	383760650
77	NC_017076	TA	3	6	75184	75189	50 %	50 %	0 %	0 %	383760654
78	NC_017076	AT	3	6	75867	75872	50 %	50 %	0 %	0 %	383760655
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83	NC_017076	AT	3	6	84625	84630	50 %	50 %	0 %	0 %	383760665
84	NC_017076	AT	3	6	87650	87655	50 %	50 %	0 %	0 %	383760667
85	NC_017076	TC	3	6	89796	89801	0 %	50 %	0 %	50 %	383760668
86	NC_017076	TC	3	6	92460	92465	0 %	50 %	0 %	50 %	383760669
87	NC_017076	AT	3	6	93423	93428	50 %	50 %	0 %	0 %	383760670
88	NC_017076	CT	3	6	93579	93584	0 %	50 %	0 %	50 %	383760670

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.