MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rubrivivax gelatinosus IL144

Total Repeats: 446

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017075	CGAGG	2	10	33595	33604	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017075	CGCGC	2	10	42558	42567	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017075	TGCCG	2	10	56289	56298	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017075	AAGGC	2	10	62842	62851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017075	TCGGA	2	10	88784	88793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017075	GCCGC	2	10	92119	92128	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7	NC_017075	CGGCG	2	10	114000	114009	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8	NC_017075	GTCTC	2	10	115344	115353	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_017075	CGCGC	2	10	123738	123747	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_017075	GGCCC	2	10	138258	138267	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_017075	CCCGG	2	10	143459	143468	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12	NC_017075	GCAAA	2	10	144589	144598	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017075	CGGCG	2	10	161475	161484	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017075	ATGGG	2	10	182246	182255	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017075	ATCTC	2	10	188174	188183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017075	CCGGC	2	10	197721	197730	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_017075	GCGCC	2	10	198660	198669	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017075	AAAGC	2	10	221102	221111	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017075	GCCGT	2	10	228651	228660	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017075	TCGAG	2	10	269195	269204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017075	CCTGC	2	10	276639	276648	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017075	GGCAG	2	10	295060	295069	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_017075	GGGGT	2	10	296997	297006	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017075	GTCCC	2	10	322464	322473	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_017075	GCGGG	2	10	322481	322490	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
26	NC_017075	TCGCA	2	10	325560	325569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_017075	TCGAC	2	10	330790	330799	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017075	CTCGG	2	10	335946	335955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_017075	CGGCC	2	10	340203	340212	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_017075	GCTCT	2	10	348512	348521	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_017075	CGGGC	2	10	350276	350285	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
32	NC_017075	GCGCG	2	10	355970	355979	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017075	GGTGT	2	10	396053	396062	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017075	TGCAG	2	10	400531	400540	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017075	CGGGC	2	10	406530	406539	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
36	NC_017075	CGGAG	2	10	422683	422692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017075	AGGGC	2	10	437524	437533	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017075	TGCGT	2	10	447074	447083	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017075	GCTCG	2	10	447498	447507	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_017075	GCGGG	3	15	451491	451505	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017075	TCGCC	2	10	501217	501226	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_017075	CGGCC	2	10	525124	525133	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017075	CTGGC	2	10	547473	547482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017075	TGCGG	2	10	627150	627159	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017075	CGAAA	2	10	640473	640482	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017075	TGCGG	2	10	640563	640572	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017075	GGGCT	2	10	655730	655739	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017075	GCGAG	2	10	657866	657875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017075	CGCTC	2	10	661302	661311	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017075	TGCGC	2	10	671647	671656	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_017075	CCCCG	2	10	676939	676948	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
52	NC_017075	GCCGC	2	10	700250	700259	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017075	GCTTC	2	10	702762	702771	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017075	GCGGT	2	10	704031	704040	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017075	ACCGG	2	10	731743	731752	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_017075	CGTGG	2	10	731768	731777	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017075	CACTG	2	10	736365	736374	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_017075	CGGGC	2	10	736494	736503	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_017075	CCGCA	2	10	741147	741156	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017075	GCACG	2	10	742462	742471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017075	GGGCG	2	10	743437	743446	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017075	CGGCG	2	10	751793	751802	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017075	CGTGG	2	10	756818	756827	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017075	CTCGC	2	10	757576	757585	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
65	NC_017075	ACGCG	2	10	762843	762852	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
66	NC_017075	GTCGA	2	10	765033	765042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017075	GCCGT	2	10	769048	769057	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
68	NC_017075	CCGGC	2	10	784023	784032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
69	NC_017075	GGCCC	2	10	806888	806897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
70	NC_017075	GACTG	2	10	840033	840042	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017075	CGCGC	2	10	840107	840116	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
72	NC_017075	GGGCA	2	10	881641	881650	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017075	CATTG	2	10	923852	923861	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017075	GGGCC	2	10	957948	957957	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017075	GCGCC	2	10	977612	977621	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_017075	GGTGC	2	10	979109	979118	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017075	GTCAA	2	10	997945	997954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_017075	GACCC	2	10	1015213	1015222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
79	NC_017075	CAGCG	2	10	1043705	1043714	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_017075	GCATT	2	10	1109228	1109237	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017075	ATTCA	2	10	1109241	1109250	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017075	CGCGG	2	10	1109327	1109336	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_017075	ACCGA	2	10	1111868	1111877	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
84	NC_017075	AGGCG	2	10	1129319	1129328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017075	GGGCG	2	10	1129345	1129354	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017075	GGCGA	2	10	1138168	1138177	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017075	GCTTT	2	10	1140436	1140445	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_017075	GCCCC	2	10	1141490	1141499	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
89	NC_017075	GATCG	2	10	1165461	1165470	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017075	GGCGC	2	10	1166740	1166749	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017075	GCCTC	2	10	1166820	1166829	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
92	NC_017075	CCCCG	2	10	1224955	1224964	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
93	NC_017075	GCCGC	2	10	1229426	1229435	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017075	CGCGC	2	10	1233301	1233310	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
95	NC_017075	GAAAC	2	10	1233335	1233344	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017075	GCGGG	2	10	1235309	1235318	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017075	GCCCC	2	10	1237004	1237013	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
98	NC_017075	GCGTC	2	10	1245170	1245179	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017075	GCCTT	2	10	1254559	1254568	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017075	TCGAG	2	10	1254648	1254657	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017075	TGCGC	2	10	1254726	1254735	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_017075	GCCTC	2	10	1272641	1272650	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_017075	TGAGG	2	10	1272677	1272686	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017075	GCGCG	2	10	1273786	1273795	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_017075	GGCCG	2	10	1287279	1287288	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_017075	CGCGC	2	10	1302234	1302243	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
107	NC_017075	GCATG	2	10	1316351	1316360	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017075	GCCCG	2	10	1319236	1319245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
109	NC_017075	TCCGG	2	10	1326737	1326746	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017075	CGCGG	2	10	1339125	1339134	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
111	NC_017075	CGGTT	2	10	1351003	1351012	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017075	CGGGG	2	10	1351138	1351147	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017075	GCGGG	2	10	1360699	1360708	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017075	CGCGG	2	10	1367778	1367787	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017075	GGGCG	2	10	1373648	1373657	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017075	GTCGA	2	10	1383199	1383208	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_017075	GCGGG	2	10	1401427	1401436	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017075	TCGCA	2	10	1405712	1405721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017075	TCGGG	2	10	1419386	1419395	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017075	CGACC	2	10	1429349	1429358	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_017075	CTCGG	2	10	1431920	1431929	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_017075	AGCGG	2	10	1455850	1455859	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017075	CGGCC	2	10	1485079	1485088	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_017075	CGCCC	2	10	1496309	1496318	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_017075	GCTCA	2	10	1511950	1511959	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017075	GGCAG	2	10	1521999	1522008	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017075	GCGCG	2	10	1546471	1546480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017075	CGCGG	2	10	1557350	1557359	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017075	GCGGG	2	10	1561977	1561986	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017075	GTGTG	2	10	1570980	1570989	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017075	GCGCC	2	10	1588071	1588080	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_017075	CGCGC	2	10	1588236	1588245	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
133	NC_017075	AAAAC	2	10	1649567	1649576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017075	GCGGG	2	10	1669886	1669895	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017075	CCGCG	2	10	1674147	1674156	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
136	NC_017075	CCACC	2	10	1676774	1676783	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_017075	CAAAG	2	10	1678655	1678664	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017075	GGCAA	2	10	1680975	1680984	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
139	NC_017075	GGGGC	2	10	1683556	1683565	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017075	CTGGG	2	10	1691049	1691058	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017075	CGGCA	2	10	1691498	1691507	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
142	NC_017075	CGCGC	2	10	1695260	1695269	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_017075	CCACC	2	10	1697601	1697610	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
144	NC_017075	CAGTT	2	10	1698640	1698649	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_017075	GCCGC	2	10	3206057	3206066	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
262	NC_017075	GCACC	2	10	3207334	3207343	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_017075	GTCGG	2	10	3233906	3233915	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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265	NC_017075	CCCGC	2	10	3268480	3268489	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
266	NC_017075	CGGCG	2	10	3276047	3276056	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
267	NC_017075	GACGC	2	10	3276183	3276192	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
268	NC_017075	CGGCA	2	10	3287322	3287331	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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270	NC_017075	GCGCC	2	10	3318394	3318403	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
271	NC_017075	TTTCA	2	10	3335466	3335475	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_017075	AGGCG	2	10	3506089	3506098	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
280	NC_017075	GCGCT	2	10	3515655	3515664	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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422	NC_017075	GCGCC	2	10	4758146	4758155	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
423	NC_017075	CAGGT	2	10	4773288	4773297	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
424	NC_017075	CGGCC	2	10	4794888	4794897	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
425	NC_017075	CTGCA	2	10	4810785	4810794	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
426	NC_017075	GGGTC	2	10	4811109	4811118	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
427	NC_017075	CGGCG	2	10	4811133	4811142	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
428	NC_017075	CGTCA	2	10	4827787	4827796	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
429	NC_017075	TCCTG	2	10	4855263	4855272	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
430	NC_017075	GCCCG	2	10	4863028	4863037	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
431	NC_017075	CGCTC	2	10	4880447	4880456	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
432	NC_017075	AGTCA	2	10	4894349	4894358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
433	NC_017075	GCCGG	2	10	4896549	4896558	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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437	NC_017075	CGGGG	2	10	4938891	4938900	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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439	NC_017075	GCCGC	2	10	4946906	4946915	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
440	NC_017075	GCCGT	2	10	4949710	4949719	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
441	NC_017075	CGGCC	2	10	4952835	4952844	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
442	NC_017075	GCGTG	2	10	4952879	4952888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
443	NC_017075	GCCGG	2	10	4964286	4964295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
444	NC_017075	CCCTG	2	10	4992245	4992254	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
445	NC_017075	CGGGG	2	10	5029159	5029168	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
446	NC_017075	GCCGG	2	10	5029941	5029950	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.