MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 17

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	GATAGA	2	12	1694	1705	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017074	ACTCTA	2	12	2889	2900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017074	TCTTTT	2	12	3706	3717	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017074	TTAGCA	2	12	7540	7551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383080727
5	NC_017074	GAAGCA	2	12	8083	8094	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	383080728
6	NC_017074	AGGCCA	2	12	8106	8117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
7	NC_017074	GTTGAC	2	12	10002	10013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383080730
8	NC_017074	AACAAA	2	12	10561	10572	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017074	CTATAA	2	12	12423	12434	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017074	CTTATC	2	12	13606	13617	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383080738
11	NC_017074	GTTCAG	2	12	15234	15245	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383080739
12	NC_017074	ACATTG	2	12	20490	20501	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383080746
13	NC_017074	CTGGCT	2	12	20999	21010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080747
14	NC_017074	CTGCGT	2	12	21966	21977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080750
15	NC_017074	AAAACG	2	12	28464	28475	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	383080755
16	NC_017074	GCCAAT	2	12	28808	28819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383080755
17	NC_017074	ACAAAC	2	12	33297	33308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080761

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.