MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	AAGG	2	8	223	230	50 %	0 %	50 %	0 %	383080719
2	NC_017074	GCCA	2	8	366	373	25 %	0 %	25 %	50 %	383080719
3	NC_017074	GAGC	2	8	1126	1133	25 %	0 %	50 %	25 %	383080720
4	NC_017074	CATA	2	8	1654	1661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017074	ATTT	2	8	1956	1963	25 %	75 %	0 %	0 %	383080721
6	NC_017074	ATGA	2	8	2520	2527	50 %	25 %	25 %	0 %	383080721
7	NC_017074	TAAC	2	8	2960	2967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017074	CCTC	2	8	3888	3895	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_017074	GAAT	2	8	4151	4158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017074	CCAA	2	8	4494	4501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017074	GCGT	2	8	4511	4518	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017074	AGGA	2	8	4802	4809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017074	AGAT	2	8	5034	5041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017074	TTGC	2	8	6222	6229	0 %	50 %	25 %	25 %	383080727
15	NC_017074	ATGC	2	8	6234	6241	25 %	25 %	25 %	25 %	383080727
16	NC_017074	GCTG	2	8	6566	6573	0 %	25 %	50 %	25 %	383080727
17	NC_017074	GACG	2	8	6683	6690	25 %	0 %	50 %	25 %	383080727
18	NC_017074	ATGT	2	8	6801	6808	25 %	50 %	25 %	0 %	383080727
19	NC_017074	TCAT	2	8	6976	6983	25 %	50 %	0 %	25 %	383080727
20	NC_017074	AGCA	2	8	7352	7359	50 %	0 %	25 %	25 %	383080727
21	NC_017074	AGCA	2	8	7382	7389	50 %	0 %	25 %	25 %	383080727
22	NC_017074	ACGG	2	8	7617	7624	25 %	0 %	50 %	25 %	383080727
23	NC_017074	CAGC	2	8	7625	7632	25 %	0 %	25 %	50 %	383080727
24	NC_017074	GTAT	2	8	7634	7641	25 %	50 %	25 %	0 %	383080727
25	NC_017074	TGAA	2	8	7953	7960	50 %	25 %	25 %	0 %	383080728
26	NC_017074	GAAC	2	8	8239	8246	50 %	0 %	25 %	25 %	383080728
27	NC_017074	AGCA	2	8	8252	8259	50 %	0 %	25 %	25 %	383080728
28	NC_017074	GCCG	2	8	8263	8270	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
29	NC_017074	GCCG	2	8	8726	8733	0 %	0 %	50 %	50 %	383080728
30	NC_017074	TCAT	2	8	8914	8921	25 %	50 %	0 %	25 %	383080729
31	NC_017074	GTTC	2	8	8969	8976	0 %	50 %	25 %	25 %	383080729
32	NC_017074	CAGG	2	8	9042	9049	25 %	0 %	50 %	25 %	383080729
33	NC_017074	CTTT	2	8	9357	9364	0 %	75 %	0 %	25 %	383080729
34	NC_017074	GGGC	2	8	9804	9811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017074	GGCA	2	8	9994	10001	25 %	0 %	50 %	25 %	383080730
36	NC_017074	ATAG	2	8	10548	10555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017074	AGGA	2	8	10928	10935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017074	ACGA	2	8	12229	12236	50 %	0 %	25 %	25 %	383080735
39	NC_017074	TTTA	2	8	12340	12347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017074	AGAA	2	8	12453	12460	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017074	TTGC	2	8	12593	12600	0 %	50 %	25 %	25 %	383080736
42	NC_017074	ATAA	2	8	12813	12820	75 %	25 %	0 %	0 %	383080736
43	NC_017074	CCTG	2	8	13075	13082	0 %	25 %	25 %	50 %	383080738
44	NC_017074	CCTT	2	8	13137	13144	0 %	50 %	0 %	50 %	383080738
45	NC_017074	ACCT	2	8	14383	14390	25 %	25 %	0 %	50 %	383080738
46	NC_017074	TGAA	2	8	14723	14730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017074	TTAA	2	8	14735	14742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017074	GCCG	2	8	15015	15022	0 %	0 %	50 %	50 %	383080739
49	NC_017074	ACGG	2	8	15523	15530	25 %	0 %	50 %	25 %	383080739
50	NC_017074	GCCG	2	8	16156	16163	0 %	0 %	50 %	50 %	383080740
51	NC_017074	AGGA	2	8	16415	16422	50 %	0 %	50 %	0 %	383080740
52	NC_017074	TTGA	2	8	16466	16473	25 %	50 %	25 %	0 %	383080740
53	NC_017074	ATGA	2	8	17491	17498	50 %	25 %	25 %	0 %	383080741
54	NC_017074	ATAC	2	8	17501	17508	50 %	25 %	0 %	25 %	383080741
55	NC_017074	GTTT	2	8	17667	17674	0 %	75 %	25 %	0 %	383080741
56	NC_017074	AGCC	2	8	17882	17889	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017074	AAAG	2	8	17914	17921	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017074	AGGC	2	8	18019	18026	25 %	0 %	50 %	25 %	383080742
59	NC_017074	CAGT	2	8	18364	18371	25 %	25 %	25 %	25 %	383080743
60	NC_017074	TTGA	2	8	19447	19454	25 %	50 %	25 %	0 %	383080745
61	NC_017074	ATTC	2	8	19471	19478	25 %	50 %	0 %	25 %	383080745
62	NC_017074	TGGT	2	8	19886	19893	0 %	50 %	50 %	0 %	383080746
63	NC_017074	TTCG	2	8	20263	20270	0 %	50 %	25 %	25 %	383080746
64	NC_017074	CAAT	2	8	20424	20431	50 %	25 %	0 %	25 %	383080746
65	NC_017074	GAAG	2	8	21066	21073	50 %	0 %	50 %	0 %	383080747
66	NC_017074	TCGC	2	8	22404	22411	0 %	25 %	25 %	50 %	383080750
67	NC_017074	CAGG	2	8	22626	22633	25 %	0 %	50 %	25 %	383080750
68	NC_017074	TGAC	2	8	22783	22790	25 %	25 %	25 %	25 %	383080750
69	NC_017074	GCAG	2	8	23036	23043	25 %	0 %	50 %	25 %	383080750
70	NC_017074	CAAA	2	8	23094	23101	75 %	0 %	0 %	25 %	383080750
71	NC_017074	TGGT	2	8	23152	23159	0 %	50 %	50 %	0 %	383080750
72	NC_017074	TCCT	2	8	23925	23932	0 %	50 %	0 %	50 %	383080750
73	NC_017074	TAAA	2	8	24466	24473	75 %	25 %	0 %	0 %	383080750
74	NC_017074	CAAT	2	8	24766	24773	50 %	25 %	0 %	25 %	383080750
75	NC_017074	AAAG	2	8	24866	24873	75 %	0 %	25 %	0 %	383080751
76	NC_017074	ATAA	2	8	25017	25024	75 %	25 %	0 %	0 %	383080751
77	NC_017074	GAAA	2	8	25061	25068	75 %	0 %	25 %	0 %	383080751
78	NC_017074	TCCT	2	8	25365	25372	0 %	50 %	0 %	50 %	383080751
79	NC_017074	ACTG	2	8	25433	25440	25 %	25 %	25 %	25 %	383080751
80	NC_017074	CATG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	25 %	25 %	383080752
81	NC_017074	GCCA	2	8	26220	26227	25 %	0 %	25 %	50 %	383080752
82	NC_017074	GGCA	2	8	26681	26688	25 %	0 %	50 %	25 %	383080752
83	NC_017074	ATAG	2	8	27559	27566	50 %	25 %	25 %	0 %	383080754
84	NC_017074	GCAG	2	8	28228	28235	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
85	NC_017074	GGCA	2	8	28257	28264	25 %	0 %	50 %	25 %	383080755
86	NC_017074	CGCT	2	8	28626	28633	0 %	25 %	25 %	50 %	383080755
87	NC_017074	CAGC	2	8	28683	28690	25 %	0 %	25 %	50 %	383080755
88	NC_017074	TCCT	2	8	28765	28772	0 %	50 %	0 %	50 %	383080755
89	NC_017074	TGTT	2	8	29246	29253	0 %	75 %	25 %	0 %	383080756
90	NC_017074	ACTA	2	8	29271	29278	50 %	25 %	0 %	25 %	383080756
91	NC_017074	ACGA	2	8	29282	29289	50 %	0 %	25 %	25 %	383080756
92	NC_017074	GCAG	2	8	29358	29365	25 %	0 %	50 %	25 %	383080756
93	NC_017074	ATTT	2	8	29545	29552	25 %	75 %	0 %	0 %	383080756
94	NC_017074	ATAA	2	8	29844	29851	75 %	25 %	0 %	0 %	383080757
95	NC_017074	GCTG	2	8	30459	30466	0 %	25 %	50 %	25 %	383080757
96	NC_017074	CATA	2	8	30785	30792	50 %	25 %	0 %	25 %	383080757
97	NC_017074	GTAA	2	8	31981	31988	50 %	25 %	25 %	0 %	383080757
98	NC_017074	TGAT	2	8	31999	32006	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017074	AGGC	2	8	32151	32158	25 %	0 %	50 %	25 %	383080758
100	NC_017074	GGCT	2	8	32476	32483	0 %	25 %	50 %	25 %	383080759
101	NC_017074	GCAG	2	8	33285	33292	25 %	0 %	50 %	25 %	383080761
102	NC_017074	AACA	2	8	33315	33322	75 %	0 %	0 %	25 %	383080761
103	NC_017074	CATT	2	8	33852	33859	25 %	50 %	0 %	25 %	383080762
104	NC_017074	TCCG	2	8	34219	34226	0 %	25 %	25 %	50 %	383080763
105	NC_017074	AAAC	2	8	34646	34653	75 %	0 %	0 %	25 %	383080764
106	NC_017074	TTAT	2	8	35039	35046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.