MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	GGC	2	6	34	39	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080719
2	NC_017074	ACG	3	9	49	57	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080719
3	NC_017074	GAA	2	6	264	269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
4	NC_017074	ACA	2	6	385	390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080719
5	NC_017074	ATT	2	6	418	423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080719
6	NC_017074	GCA	2	6	424	429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080719
7	NC_017074	CTG	2	6	500	505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080719
8	NC_017074	TGG	2	6	515	520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383080719
9	NC_017074	CAA	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080719
10	NC_017074	ATT	2	6	621	626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080719
11	NC_017074	AAG	2	6	659	664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
12	NC_017074	GTT	2	6	683	688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080719
13	NC_017074	CCG	2	6	707	712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080719
14	NC_017074	AAG	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080719
15	NC_017074	AGG	2	6	761	766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080719
16	NC_017074	GCT	2	6	805	810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
17	NC_017074	GAA	2	6	824	829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
18	NC_017074	CTG	2	6	830	835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
19	NC_017074	AGA	2	6	892	897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
20	NC_017074	AGA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
21	NC_017074	TTG	2	6	1098	1103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080720
22	NC_017074	CTG	2	6	1163	1168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080720
23	NC_017074	GAA	2	6	1258	1263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080720
24	NC_017074	TTC	2	6	1307	1312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080720
25	NC_017074	ACA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080720
26	NC_017074	GTT	2	6	1396	1401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080720
27	NC_017074	CAA	2	6	1629	1634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017074	CGA	2	6	1662	1667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017074	CTT	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017074	TTC	2	6	2142	2147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
31	NC_017074	TTC	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
32	NC_017074	CTT	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
33	NC_017074	TAA	2	6	2765	2770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080721
34	NC_017074	TCT	3	9	2786	2794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080721
35	NC_017074	ATA	2	6	2815	2820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080721
36	NC_017074	CCT	2	6	2827	2832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017074	AAT	2	6	2860	2865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017074	ACA	2	6	3062	3067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017074	GCT	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080722
40	NC_017074	ACT	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080722
41	NC_017074	AAT	2	6	3383	3388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383080722
42	NC_017074	ATT	2	6	3402	3407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080722
43	NC_017074	GGA	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080722
44	NC_017074	CAA	2	6	3463	3468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080722
45	NC_017074	CTT	2	6	3590	3595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017074	AGA	2	6	3640	3645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017074	GCA	2	6	3664	3669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017074	GTC	2	6	3779	3784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017074	ATT	2	6	3795	3800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017074	GCT	2	6	3833	3838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017074	ACT	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017074	AGA	2	6	3868	3873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017074	TAT	2	6	3941	3946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080723
54	NC_017074	GAC	2	6	3979	3984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080723
55	NC_017074	GCA	2	6	4003	4008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080723
56	NC_017074	CTG	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080723
57	NC_017074	GGC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080723
58	NC_017074	CTG	2	6	4067	4072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080723
59	NC_017074	GAG	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017074	AAG	2	6	4258	4263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080724
61	NC_017074	GTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080724
62	NC_017074	GCA	2	6	4451	4456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017074	TTG	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017074	GTC	2	6	4475	4480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017074	CCT	2	6	4488	4493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017074	TGT	2	6	4519	4524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017074	GCC	2	6	4583	4588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017074	AGA	2	6	4725	4730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017074	GCC	2	6	4873	4878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080725
70	NC_017074	GGA	2	6	5043	5048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017074	AGC	2	6	5113	5118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
72	NC_017074	ACA	2	6	5135	5140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080726
73	NC_017074	AAG	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
74	NC_017074	AGG	2	6	5243	5248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080726
75	NC_017074	CGA	2	6	5256	5261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
76	NC_017074	AAG	2	6	5264	5269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
77	NC_017074	GAA	2	6	5328	5333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080726
78	NC_017074	TCT	2	6	5388	5393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080726
79	NC_017074	CGA	2	6	5424	5429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
80	NC_017074	AGC	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080726
81	NC_017074	ATA	2	6	5514	5519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017074	TGT	2	6	5527	5532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017074	GCT	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017074	CGT	2	6	5574	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017074	ACA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017074	AAC	2	6	5719	5724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017074	TAT	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017074	ACA	2	6	5987	5992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017074	ACA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
90	NC_017074	ACG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
91	NC_017074	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080727
92	NC_017074	ACA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
93	NC_017074	CTG	2	6	6204	6209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
94	NC_017074	CAA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
95	NC_017074	ACA	2	6	6253	6258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
96	NC_017074	AAG	2	6	6276	6281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
97	NC_017074	AAG	2	6	6381	6386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
98	NC_017074	CGT	2	6	6412	6417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
99	NC_017074	ACT	2	6	6499	6504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080727
100	NC_017074	GAA	2	6	6600	6605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
101	NC_017074	AGG	2	6	6613	6618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080727
102	NC_017074	GTT	2	6	6642	6647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080727
103	NC_017074	GAA	2	6	6651	6656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
104	NC_017074	AGC	2	6	6733	6738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
105	NC_017074	CGA	2	6	6935	6940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
106	NC_017074	CAG	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080727
107	NC_017074	TCT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080727
108	NC_017074	CAA	2	6	7178	7183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
109	NC_017074	GCT	2	6	7191	7196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
110	NC_017074	GAA	2	6	7335	7340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
111	NC_017074	AAG	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080727
112	NC_017074	ACC	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080727
113	NC_017074	GTC	2	6	7404	7409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080727
114	NC_017074	CAA	2	6	7471	7476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080727
115	NC_017074	ACA	2	6	7809	7814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017074	AGG	2	6	7884	7889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017074	ACA	2	6	7901	7906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
118	NC_017074	ATT	2	6	7913	7918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080728
119	NC_017074	GCA	2	6	7991	7996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
120	NC_017074	CAG	2	6	8039	8044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
121	NC_017074	CAA	2	6	8142	8147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
122	NC_017074	TTA	2	6	8365	8370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383080728
123	NC_017074	CAA	2	6	8764	8769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080728
124	NC_017074	GAC	2	6	8792	8797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080728
125	NC_017074	GCC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080728
126	NC_017074	TGC	2	6	9064	9069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080729
127	NC_017074	TCG	2	6	9215	9220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080729
128	NC_017074	TCC	2	6	9273	9278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383080729
129	NC_017074	GCA	2	6	9287	9292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080729
130	NC_017074	CTT	2	6	9300	9305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080729
131	NC_017074	TTC	2	6	9322	9327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080729
132	NC_017074	CTT	3	9	9345	9353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080729
133	NC_017074	TGC	2	6	9377	9382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080729
134	NC_017074	GGC	3	9	9445	9453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080729
135	NC_017074	ACA	3	9	9476	9484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080729
136	NC_017074	TCC	3	9	9621	9629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017074	CTG	2	6	9667	9672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017074	CAG	2	6	9692	9697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017074	TAT	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017074	AAT	2	6	9718	9723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017074	ATT	2	6	9730	9735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017074	TAA	2	6	9776	9781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017074	ACC	2	6	9791	9796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_017074	CAG	2	6	9896	9901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080730
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161	NC_017074	TAG	2	6	10904	10909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017074	ACA	3	9	10947	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080732
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182	NC_017074	AAG	2	6	11982	11987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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