MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC5

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017074	A	6	6	1141	1146	100 %	0 %	0 %	0 %	383080720
2	NC_017074	A	6	6	1427	1432	100 %	0 %	0 %	0 %	383080720
3	NC_017074	T	8	8	1948	1955	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
4	NC_017074	T	6	6	2065	2070	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
5	NC_017074	A	7	7	2421	2427	100 %	0 %	0 %	0 %	383080721
6	NC_017074	T	6	6	2771	2776	0 %	100 %	0 %	0 %	383080721
7	NC_017074	C	6	6	2997	3002	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_017074	A	6	6	3121	3126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017074	T	6	6	3594	3599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017074	T	6	6	3613	3618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017074	A	6	6	3722	3727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017074	T	6	6	5505	5510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017074	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017074	T	8	8	5588	5595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017074	A	6	6	5707	5712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017074	T	6	6	5908	5913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017074	A	6	6	5992	5997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017074	A	8	8	6115	6122	100 %	0 %	0 %	0 %	383080727
19	NC_017074	A	6	6	8132	8137	100 %	0 %	0 %	0 %	383080728
20	NC_017074	T	6	6	8907	8912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017074	A	6	6	9598	9603	100 %	0 %	0 %	0 %	383080729
22	NC_017074	A	6	6	9615	9620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017074	A	7	7	11324	11330	100 %	0 %	0 %	0 %	383080733
24	NC_017074	A	6	6	11517	11522	100 %	0 %	0 %	0 %	383080733
25	NC_017074	A	6	6	11812	11817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017074	C	7	7	12321	12327	0 %	0 %	0 %	100 %	383080735
27	NC_017074	T	6	6	12435	12440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017074	T	6	6	12800	12805	0 %	100 %	0 %	0 %	383080736
29	NC_017074	A	6	6	13084	13089	100 %	0 %	0 %	0 %	383080738
30	NC_017074	T	6	6	14013	14018	0 %	100 %	0 %	0 %	383080738
31	NC_017074	A	7	7	14741	14747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017074	A	7	7	16900	16906	100 %	0 %	0 %	0 %	383080741
33	NC_017074	A	6	6	18706	18711	100 %	0 %	0 %	0 %	383080744
34	NC_017074	A	6	6	21753	21758	100 %	0 %	0 %	0 %	383080748
35	NC_017074	A	6	6	23628	23633	100 %	0 %	0 %	0 %	383080750
36	NC_017074	A	6	6	23789	23794	100 %	0 %	0 %	0 %	383080750
37	NC_017074	A	6	6	25509	25514	100 %	0 %	0 %	0 %	383080751
38	NC_017074	A	6	6	26303	26308	100 %	0 %	0 %	0 %	383080752
39	NC_017074	A	6	6	26763	26768	100 %	0 %	0 %	0 %	383080752
40	NC_017074	A	6	6	28703	28708	100 %	0 %	0 %	0 %	383080755
41	NC_017074	A	6	6	29655	29660	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
42	NC_017074	A	6	6	29877	29882	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
43	NC_017074	A	8	8	29944	29951	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
44	NC_017074	A	6	6	31259	31264	100 %	0 %	0 %	0 %	383080757
45	NC_017074	A	8	8	32354	32361	100 %	0 %	0 %	0 %	383080758
46	NC_017074	A	6	6	33162	33167	100 %	0 %	0 %	0 %	383080761
47	NC_017074	T	6	6	33990	33995	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
48	NC_017074	T	6	6	34015	34020	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
49	NC_017074	T	6	6	34396	34401	0 %	100 %	0 %	0 %	383080763
50	NC_017074	T	6	6	34902	34907	0 %	100 %	0 %	0 %	383080764

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.