MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017073	TTGATC	2	12	107	118	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383755758
2	NC_017073	ACGTTC	2	12	3405	3416	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383755761
3	NC_017073	CCTTTT	2	12	7163	7174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383755767
4	NC_017073	ATTCAT	2	12	15690	15701	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383755773
5	NC_017073	AGAAGG	2	12	26866	26877	50 %	0 %	50 %	0 %	383755780
6	NC_017073	GCCTTT	2	12	28640	28651	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	383755780
7	NC_017073	GAGCCG	2	12	32162	32173	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	383755786
8	NC_017073	CTGCAC	2	12	32918	32929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383755787
9	NC_017073	TCGCCC	2	12	35081	35092	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	383755791
10	NC_017073	TTTGCT	2	12	35345	35356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383755791
11	NC_017073	CACAAC	2	12	35415	35426	50 %	0 %	0 %	50 %	383755791
12	NC_017073	TATTCA	2	12	37236	37247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	383755793
13	NC_017073	GTATCC	2	12	41154	41165	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383755797
14	NC_017073	GAACCG	2	12	43332	43343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383755798
15	NC_017073	GAAGTA	2	12	48273	48284	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383755809
16	NC_017073	GCCATA	2	12	56025	56036	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383755828
17	NC_017073	TTTTCT	2	12	62424	62435	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	383755842
18	NC_017073	TACCGC	2	12	70190	70201	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383755856
19	NC_017073	GGCTTC	2	12	70560	70571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383755856

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.