MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC3

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017073	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017073	A	6	6	1408	1413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017073	T	6	6	1748	1753	0 %	100 %	0 %	0 %	383755761
4	NC_017073	T	6	6	3954	3959	0 %	100 %	0 %	0 %	383755761
5	NC_017073	C	7	7	4505	4511	0 %	0 %	0 %	100 %	383755761
6	NC_017073	A	7	7	5196	5202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017073	A	6	6	7181	7186	100 %	0 %	0 %	0 %	383755767
8	NC_017073	A	7	7	7416	7422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017073	T	6	6	7542	7547	0 %	100 %	0 %	0 %	383755768
10	NC_017073	T	6	6	7718	7723	0 %	100 %	0 %	0 %	383755768
11	NC_017073	T	6	6	14206	14211	0 %	100 %	0 %	0 %	383755773
12	NC_017073	T	6	6	15004	15009	0 %	100 %	0 %	0 %	383755773
13	NC_017073	T	6	6	16498	16503	0 %	100 %	0 %	0 %	383755773
14	NC_017073	T	6	6	16831	16836	0 %	100 %	0 %	0 %	383755773
15	NC_017073	A	8	8	20107	20114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017073	A	7	7	20141	20147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017073	A	6	6	20231	20236	100 %	0 %	0 %	0 %	383755777
18	NC_017073	A	6	6	21058	21063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017073	T	6	6	21083	21088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017073	T	6	6	21277	21282	0 %	100 %	0 %	0 %	383755778
21	NC_017073	A	7	7	22003	22009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017073	T	7	7	25191	25197	0 %	100 %	0 %	0 %	383755780
23	NC_017073	A	6	6	29159	29164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017073	G	6	6	29168	29173	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017073	T	6	6	29259	29264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017073	T	7	7	29355	29361	0 %	100 %	0 %	0 %	383755781
27	NC_017073	T	6	6	29494	29499	0 %	100 %	0 %	0 %	383755782
28	NC_017073	T	9	9	29728	29736	0 %	100 %	0 %	0 %	383755783
29	NC_017073	T	6	6	30032	30037	0 %	100 %	0 %	0 %	383755783
30	NC_017073	A	6	6	30114	30119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017073	A	6	6	30337	30342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017073	T	6	6	32500	32505	0 %	100 %	0 %	0 %	383755787
33	NC_017073	C	6	6	33659	33664	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
34	NC_017073	A	6	6	34850	34855	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017073	T	6	6	37155	37160	0 %	100 %	0 %	0 %	383755792
36	NC_017073	A	7	7	37195	37201	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
37	NC_017073	A	7	7	37539	37545	100 %	0 %	0 %	0 %	383755793
38	NC_017073	A	6	6	40602	40607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017073	T	6	6	41020	41025	0 %	100 %	0 %	0 %	383755797
40	NC_017073	C	6	6	41740	41745	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_017073	C	6	6	41748	41753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_017073	A	7	7	41800	41806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017073	T	6	6	41816	41821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017073	A	6	6	42186	42191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017073	C	7	7	42372	42378	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_017073	T	6	6	42458	42463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017073	T	6	6	42729	42734	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017073	T	8	8	42779	42786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017073	A	6	6	42852	42857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017073	A	7	7	43053	43059	100 %	0 %	0 %	0 %	383755798
51	NC_017073	A	6	6	43548	43553	100 %	0 %	0 %	0 %	383755798
52	NC_017073	T	7	7	43615	43621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017073	A	6	6	44742	44747	100 %	0 %	0 %	0 %	383755802
54	NC_017073	A	6	6	45845	45850	100 %	0 %	0 %	0 %	383755805
55	NC_017073	A	6	6	46480	46485	100 %	0 %	0 %	0 %	383755806
56	NC_017073	A	6	6	46852	46857	100 %	0 %	0 %	0 %	383755806
57	NC_017073	A	6	6	47445	47450	100 %	0 %	0 %	0 %	383755807
58	NC_017073	A	6	6	47487	47492	100 %	0 %	0 %	0 %	383755807
59	NC_017073	A	6	6	47580	47585	100 %	0 %	0 %	0 %	383755807
60	NC_017073	A	6	6	47951	47956	100 %	0 %	0 %	0 %	383755808
61	NC_017073	A	6	6	48570	48575	100 %	0 %	0 %	0 %	383755810
62	NC_017073	A	6	6	49330	49335	100 %	0 %	0 %	0 %	383755812
63	NC_017073	A	6	6	50059	50064	100 %	0 %	0 %	0 %	383755812
64	NC_017073	A	6	6	52264	52269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017073	A	6	6	53258	53263	100 %	0 %	0 %	0 %	383755822
66	NC_017073	A	6	6	53944	53949	100 %	0 %	0 %	0 %	383755823
67	NC_017073	A	7	7	54110	54116	100 %	0 %	0 %	0 %	383755823
68	NC_017073	T	8	8	54907	54914	0 %	100 %	0 %	0 %	383755826
69	NC_017073	T	6	6	55551	55556	0 %	100 %	0 %	0 %	383755827
70	NC_017073	T	7	7	56077	56083	0 %	100 %	0 %	0 %	383755828
71	NC_017073	T	6	6	62668	62673	0 %	100 %	0 %	0 %	383755842
72	NC_017073	T	6	6	64270	64275	0 %	100 %	0 %	0 %	383755845
73	NC_017073	T	7	7	65104	65110	0 %	100 %	0 %	0 %	383755846
74	NC_017073	T	6	6	66505	66510	0 %	100 %	0 %	0 %	383755848
75	NC_017073	T	6	6	67343	67348	0 %	100 %	0 %	0 %	383755848
76	NC_017073	T	6	6	67735	67740	0 %	100 %	0 %	0 %	383755848
77	NC_017073	A	6	6	69403	69408	100 %	0 %	0 %	0 %	383755853
78	NC_017073	A	6	6	69563	69568	100 %	0 %	0 %	0 %	383755854
79	NC_017073	G	6	6	70068	70073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017073	T	7	7	70937	70943	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017073	A	6	6	70982	70987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017073	A	6	6	71065	71070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017073	C	6	6	71426	71431	0 %	0 %	0 %	100 %	383755857
84	NC_017073	A	6	6	71719	71724	100 %	0 %	0 %	0 %	383755858
85	NC_017073	A	6	6	71802	71807	100 %	0 %	0 %	0 %	383755858
86	NC_017073	A	14	14	72173	72186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017073	T	7	7	72330	72336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017073	A	6	6	72673	72678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017073	T	6	6	73069	73074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.