MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC8

Total Repeats: 23

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017071	TATT	2	8	92	99	25 %	75 %	0 %	0 %	383080709
2	NC_017071	CAGA	2	8	757	764	50 %	0 %	25 %	25 %	383080709
3	NC_017071	GCAA	2	8	1059	1066	50 %	0 %	25 %	25 %	383080709
4	NC_017071	TTTC	2	8	1071	1078	0 %	75 %	0 %	25 %	383080709
5	NC_017071	ACTG	2	8	1143	1150	25 %	25 %	25 %	25 %	383080709
6	NC_017071	TTTC	2	8	1203	1210	0 %	75 %	0 %	25 %	383080709
7	NC_017071	GAAA	2	8	1420	1427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017071	GACT	2	8	1522	1529	25 %	25 %	25 %	25 %	383080710
9	NC_017071	CAAA	2	8	1593	1600	75 %	0 %	0 %	25 %	383080710
10	NC_017071	CTGT	2	8	2156	2163	0 %	50 %	25 %	25 %	383080711
11	NC_017071	ATGA	2	8	2377	2384	50 %	25 %	25 %	0 %	383080711
12	NC_017071	CGGG	2	8	2453	2460	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017071	GGTG	2	8	2461	2468	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017071	GCGG	2	8	2621	2628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017071	GAAA	2	8	2669	2676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017071	AGGG	2	8	3030	3037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017071	CAAA	2	8	3401	3408	75 %	0 %	0 %	25 %	383080712
18	NC_017071	TACA	2	8	3462	3469	50 %	25 %	0 %	25 %	383080712
19	NC_017071	CAAG	2	8	4142	4149	50 %	0 %	25 %	25 %	383080712
20	NC_017071	CAAT	2	8	4362	4369	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017071	TGTT	2	8	4453	4460	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017071	TGTT	2	8	4472	4479	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017071	GCCA	2	8	4494	4501	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.