MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Selenomonas ruminantium subsp. lactilytica TAM6421 plasmid pSRC8

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017071	CGG	2	6	201	206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383080709
2	NC_017071	ATG	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080709
3	NC_017071	TGA	3	9	360	368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080709
4	NC_017071	CTT	2	6	429	434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080709
5	NC_017071	TCT	2	6	442	447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080709
6	NC_017071	CTT	2	6	475	480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080709
7	NC_017071	AGA	2	6	537	542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080709
8	NC_017071	CCA	2	6	779	784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383080709
9	NC_017071	TGA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080709
10	NC_017071	AAC	2	6	907	912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383080709
11	NC_017071	GAA	2	6	1002	1007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080709
12	NC_017071	AGA	2	6	1023	1028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080709
13	NC_017071	AGA	3	9	1116	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080709
14	NC_017071	AGA	2	6	1128	1133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080709
15	NC_017071	GAT	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080709
16	NC_017071	GAA	2	6	1309	1314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017071	GAA	2	6	1437	1442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017071	GTT	2	6	1601	1606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080710
19	NC_017071	GAA	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080710
20	NC_017071	TTG	2	6	1759	1764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017071	GCC	2	6	1792	1797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017071	GCG	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017071	GCT	2	6	1805	1810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017071	TGC	2	6	1985	1990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080711
25	NC_017071	TAG	2	6	2034	2039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080711
26	NC_017071	TCT	2	6	2057	2062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080711
27	NC_017071	TGC	2	6	2070	2075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080711
28	NC_017071	TAG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080711
29	NC_017071	GCT	2	6	2278	2283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080711
30	NC_017071	TCA	2	6	2305	2310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383080711
31	NC_017071	CTT	2	6	2390	2395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080711
32	NC_017071	TCT	2	6	2396	2401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383080711
33	NC_017071	CGG	2	6	2445	2450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017071	GCC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017071	CGG	2	6	2517	2522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017071	TGG	2	6	2561	2566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017071	GTG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017071	AGG	3	9	2591	2599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017071	AAT	2	6	2733	2738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017071	TCA	2	6	2740	2745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017071	GTT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017071	AAC	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017071	GTC	2	6	2980	2985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017071	CTA	2	6	3019	3024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017071	GAG	2	6	3146	3151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017071	AGG	2	6	3217	3222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017071	GGT	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017071	AGC	2	6	3266	3271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080712
49	NC_017071	AAG	2	6	3304	3309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080712
50	NC_017071	CAG	2	6	3493	3498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080712
51	NC_017071	GCT	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080712
52	NC_017071	TGA	2	6	3719	3724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080712
53	NC_017071	GCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383080712
54	NC_017071	TGT	2	6	3758	3763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383080712
55	NC_017071	GCT	2	6	3765	3770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383080712
56	NC_017071	AGA	2	6	3773	3778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383080712
57	NC_017071	GGA	2	6	3981	3986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383080712
58	NC_017071	GCC	2	6	4041	4046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383080712
59	NC_017071	TGA	2	6	4224	4229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383080712
60	NC_017071	CGT	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017071	AGA	2	6	4380	4385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017071	AGT	2	6	4642	4647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.